2007 Fiscal Year Annual Research Report
ヒト骨転移特異的タンパク質の逆翻訳によるゲノム解析
| Project/Area Number |
19591741
|
|---|
| Research Institution | Kurume University |
|---|
Principal Investigator |
津留 美智代 Kurume University, バイオ統計センター, 研究員 (90368887)
|
|---|
| Keywords | アミノ酸構造解析 / miRNA / タンパク質 / 逆番羽訳 / がん |
|---|
| Research Abstract |
がん患者の血清から骨に特異的に転移する時に発現するタンパク質を発見じた。このタンパク質は不安定な状態にあり,また,健常人の血液中には発現しないために,アミノ酸解析後,ヒト健常者のデータバンクからは合致するゲノムは見つけることができなかった。
骨転移特異的タンパク質のみを精製しいアミノ酸配列データをバイオインフォマティクスを使いい,Shine-Dalgarno sequence開始コドンの上流にプリンに富んだ配列を解読し,30Sサブユニットの主成分である16SリボソームRNA(rRNA)が、3'末端に相補的な配列を持つことから,両者が塩基対を形成して結合することにより,mRNAを鋳型としたタンパク質の生合成が促進される原理から,RNA編集を遂行している。
ゲノム上の塩基配列には,非蛋白質コード領域が多数存在することが知られており,この中には,DNA複製の開始点として定義される複製起点,あるいはプロモーター,エンハンサー,サイレンサーといった遺伝子の発現を制御する生命活動に非常に重要な領域が含まれている。アミノ酸合成と質量分析を併用し,疾病に関してのみ発現するタンパク質のゲノム解析からこのタンパク質がどの遺伝子から発現するものか,また,非コード化遺伝子oncogenic micro RNAによるタンパク質合成阻害の関与を重点的に慎重な解析を遂行している。miRNA発現パターンと癌の間には,顕著な相関関係があること,骨転移で発現す登特定miRNAを明らかにし,癌増殖や癌遺伝子へのmiRNAの影響を解析する。
|
