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2007 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝子発現時系列解析技法の開発

Research Project

Project/Area Number 19650068
Research InstitutionKurume University

Principal Investigator

柳川 堯  Kurume University, バイオ統計センター, 教授 (80029488)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 角間 辰之  久留米大学, バイオ統計センター, 教授 (50341540)
荒木 由布子  久留米大学, バイオ統計センター, 研究員 (80403913)
Keywordsアルゴリズム / プロテオーム / 統計数学 / 関数データ解析 / 機械学習 / ゲノム / 時系列データ / 網膜タンパク
Research Abstract

◇柳川、荒木は,研究協力者である,松本 博教授(オクラホマ大学、医学部)を訪問し,松本教授が行った研究「生後発達中のマウス網膜の蛋白質を時間的に追跡した発現データに基づいて,発達段階のどの時点でどの遺伝子が関わっているかの解明」のデータ及関連データを頂くとともに,関連する生物学的知識を教えていただき,このデータを中心に当該課題の研究を行った。
◇荒木は,ロジスティック判別関数を「予測変数が関数である」場合の「関数ロジスティック判別解析法」に一般化した,一般化の過程で,観測地よりも未知パラメータの個数が多い,いわゆる"n<p"問題に対処するため正規化法を導入し,またモデルに含まれる未知パラメータを選択して最適なモデルを設定するためにベイズ情報量基準を導入した。
◇開発した関数ロジスティック判別解析法を,松本教授からいただいた生後発達中のマウス網膜のたんぱく質時系列データに適用し,松本教授のグループが分類できなかった遺伝子を,松本教授が設定したクラスに分類することに成功した。
◇国際会議を開催し,以上の成果を世界に向けて情報発信した。

  • Research Products

    (9 results)

All 2008 2007

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Regularized functional logitic discrimination and its application to the longitunal data2008

    • Author(s)
      Araki Yuko
    • Journal Title

      Proceedings of the 2nd International Kurume Symposium on Biostatistics

      Pages: 92-97

  • [Journal Article] Paternal transmisson and slow elimination of mutant alleles associated with late-onset orithine transcarbamylase deficincy in male patients2008

    • Author(s)
      Sanae Numata
    • Journal Title

      Journal of Huamn Genetics 53

      Pages: 10-17

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional discriminant analysis via radial basis function expansion and model selection criterion2007

    • Author(s)
      Araki Yukc
    • Journal Title

      Proceedings of the COE conference on the development of DMHF

      Pages: 195-198

  • [Presentation] Application of fumctonal ANOVA models for hazard regression to the Hisayama data2008

    • Author(s)
      Ybnemoto K
    • Organizer
      The 2nd International Kumme Symposium on Biostatistics Analysis of Longitudinal Data and Related Toics
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2008-02-25
  • [Presentation] Regularized functional logistic discrimination and its apliction to the longtitudinal data2008

    • Author(s)
      Araki, Y
    • Organizer
      The 2nd International Kumme Symposium on Biostatlstrcs Analysis of Longitudinal Data and Related Toics
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2008-02-25
  • [Presentation] 1ヒトがんにおける転移抑制因子Cap43/NDRG1発現の多様性と臨床的意義2008

    • Author(s)
      河原 明彦
    • Organizer
      第7回九州がんフォーラ
    • Place of Presentation
      九州大学百年記念講堂
    • Year and Date
      2008-02-08
  • [Presentation] Functional discriminant analysis via radial basis function expansion and model selection criterion2007

    • Author(s)
      Araki, Y
    • Organizer
      International COE conference on the development of DMEF
    • Place of Presentation
      Kyushu University
    • Year and Date
      2007-10-04
  • [Presentation] Human finger vein images are diverse and its pattems are useful for peronal identification2007

    • Author(s)
      Takashi Yanagawa
    • Organizer
      The 56th Session of the InternationaI Statistical Institute
    • Place of Presentation
      Lisboa,PortugaI
    • Year and Date
      2007-08-29
  • [Book] ハリエットレーンハンドブック2007

    • Author(s)
      柳川堯(バイオ統計学とEBM項目の翻訳
    • Total Pages
      942
    • Publisher
      メディカルサイエンス・インターナショナル

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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