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2008 Fiscal Year Annual Research Report

インプリンティング遺伝子のゲノムワイドな同定法の開発と、小児腫瘍の病態解明

Research Project

Project/Area Number 19659274
Research InstitutionGunma Institute of Public Health and Environmental Sciences

Principal Investigator

林 泰秀  Gunma Institute of Public Health and Environmental Sciences, 研究企画係, 研究員 (30238133)

Keywords遺伝学 / 遺伝子 / ゲノム / 癌 / マイクロアレイ
Research Abstract

小児腫瘍において、種々の遺伝子がuniparental disomy(UPD)やその他のメカニズムによりインプリンティングが障害されていると考えられ、各腫瘍にはheterogeneityが存在することが予測され、ある腫瘍では別の腫瘍で障害されるインプリンティングは保存されていることが予測される。これらのことにより小児腫瘍では癌遺伝子が活性化されたり、メチル化などにより癌抑制遺伝子が不活化されることによる発癌メカニズムが考えられる。
今年度は神経芽腫で検討した。新鮮神経芽腫215例と24細胞株において、100万SNPプローブを搭載したGeneChip1Mアレイを用いた手法によりUPDの網羅的な探索を行い、共通して認められるUPD領域を網羅的に探索した。Affymetrix社のGene Chipアレイによる神経芽腫の解析では、コピー数の増加または増幅は2番染色体のMYCN領域より少し中心体よりの領域でみられ、この領域にALK遺伝子が同定された。ALK遺伝子の変異の解析では変異は新鮮腫瘍215例中13例(6.1%)、細胞株24株中8株(33%)でみられた。変異がみられた新鮮腫瘍13例中12例が病期3〜4の進展例であった。変異キナーゼは自己リン酸されており、変異のないキナーゼに比べて活性が上昇していた。また変異体を導入したNIH3T3線維芽細胞は形質転換し、ソフトアガールでコロニー形成がみられ、ヌードマウスでも腫瘍を形成した。siRNAによってALKをdown regulationすると神経芽腫の増殖が抑制された(Nature 2008)。今回のALK遺伝子同定の結果は進行神経芽腫の発生機序の解明に貢献し、ALK阻害薬は治療に役立つ可能性が示唆された。

  • Research Products

    (53 results)

All 2009 2008

All Journal Article (18 results) (of which Peer Reviewed: 18 results) Presentation (35 results)

  • [Journal Article] Age-associated difference in gene expression of pediatric acute myelomonocytic lineage leukemia (FAB M4 and M5 subtypes) and its correlation with prognosis2009

    • Author(s)
      Jo A, et al.
    • Journal Title

      Brit J Haematol 144

      Pages: 917-929

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] FBXW7 and NOTCH1 mutations in childhood T cell acute lymphoblastic leukaemia and T cell non-Hodgkin lymphoma2009

    • Author(s)
      Park MJ, et al.
    • Journal Title

      Brit J Haematol

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mutations of GATA1, FLT3, MLL-partial tandem duplication, NRAS, and RUNX1 genes are not found in a 7-year-old Down syndrome patient with acute myeloid leukemia (FAB-M2) having a good prognosis2008

    • Author(s)
      Kawamura M, et al.
    • Journal Title

      Cancer Genet Cytogenet. 180

      Pages: 74-78

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fbxw7 acts as a critical fail-safe against premature loss of hematopoietic stem cells and development of T-ALL2008

    • Author(s)
      Matsuoka S, et al.
    • Journal Title

      Genes Dev. 22

      Pages: 986-991

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Clinical features and outcome of MLL gene rearranged acute lymphoblastic leukemia in infants with additional chromosomal abnormalities other than 11q23 translocation2008

    • Author(s)
      Tauchi H, et al.
    • Journal Title

      Leuk Res. 32

      Pages: 1523-1529

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tandem duplications of MLL and FLT3 are correlated with poor prognoses in pediatric acute myeloid leukemia : A study of the Japanese childhood AML Cooperative Study Group2008

    • Author(s)
      Shimada A, et al.
    • Journal Title

      Pediatr Blood Cancer 50

      Pages: 264-269

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of the novel AML1 fusion partner gene, LAF4, a fusion partner of MLL, in childhood T-cell acute lymphoblastic leukemia with t(2;21)(q11;q22) by bubble PCR method for cDNA2008

    • Author(s)
      Chinen Y, et al.
    • Journal Title

      Oncogene 27

      Pages: 2249-2256

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Whole genome profiling of chromosomal aberrations in hepatoblastoma using high-density single nucleotide polymorphism genotyping microarrays2008

    • Author(s)
      Suzuki M, et al.
    • Journal Title

      Cancer Science 99

      Pages: 564-570

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Significance of the complete clearance of peripheral blasts after 7 days of prednisolone treatment in children with acute lymphoblastic leukemia : the Tokyo Children's Cancer Study Group Study L99-152008

    • Author(s)
      Manabe A, et al.
    • Journal Title

      Haematologica 93

      Pages: 1155-1160

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fusion of OTT to BSAC results in aberrant up-regulation of transcriptional activity2008

    • Author(s)
      Sawada T, et al.
    • Journal Title

      J Biol Chem 283

      Pages: 26820-26828

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Oncogenic mutations of ALK kinase in neuroblastoma2008

    • Author(s)
      Chen Y, et al.
    • Journal Title

      Nature 455

      Pages: 971-974

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel gain-of-function mutation in the extracellular domain of the PDGFRA gene in infant acute lymphoblastic leukemia with t(4;11)(q21;q23)2008

    • Author(s)
      Hiwatari M, et al.
    • Journal Title

      Leukemia. 22

      Pages: 2279-2280

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] MNX1-ETV6 fusion gene in an acute megakaryoblastic leukemia and expression of the MNX1 gene in leukemia and normal B cell lines2008

    • Author(s)
      Taketani T, et al.
    • Journal Title

      Cancer Genet Cytogenet. 186

      Pages: 115-11

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hemophagocytic lymphohistiocytosis associated with uncontrolled inflammatory cytokinemia and chemokinemia which were caused by systemic anaplastic large cell lymphoma : A case report and review of the literature2008

    • Author(s)
      Shimada A, et al.
    • Journal Title

      J Pediatr Hematol Oncol 30

      Pages: 785-787

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] C/EBPalpha and C/EBPvarepsilon induce the monocytic differentiation of myelomonocytic cells with the MLL-chimeric fusion gene2008

    • Author(s)
      Matsushita H, et al.
    • Journal Title

      Oncogene 27

      Pages: 6749-6760

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A complex t(1;22;11)(q44;q13;q23) translocation causing MLL-p300 fusion gene in therapy-related acute myeloid leukemia2008

    • Author(s)
      Ohnishi H, et al.
    • Journal Title

      Eur J Haematol 81

      Pages: 475-480

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression of KIT and PDGFR is associated with a good prognosis in neuroblastoma2008

    • Author(s)
      Shimada A, et al.
    • Journal Title

      Pediatr Blood Cancer 50

      Pages: 213-217

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transient abnormal myelopoiesis in a Down syndrome newborn followed by acute myeloid leukemia : identification of the same chromosomal abnormality in both stages2008

    • Author(s)
      Kitoh T, et al.
    • Journal Title

      Cancer Genet Cytogenet. 188

      Pages: 99-102

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 高密度SNPアレイを用いた神経芽腫における網羅的ゲノム解析2008

    • Author(s)
      滝田順子, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] 小児T細胞型急性リンパ性白血病の最新の話題-分子病態を中心に-2008

    • Author(s)
      林泰秀
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] DNAマイクロアイレによる小児急性骨髄性白血病の診断2008

    • Author(s)
      城青衣, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] JPLSG AML05臨床試験における新WHO分類を用いた横断的中央診断2008

    • Author(s)
      木下明俊, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] 超高密度オリゴヌクレオチドアレイを用いた小児急性骨髄性白血病における網羅的ゲノム解析2008

    • Author(s)
      大木健太郎, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] 急性骨髄性白血病におけるWT1遺伝子変異の解析2008

    • Author(s)
      佐野弘純, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] 高密度SNPアレイを用いた横紋筋肉腫における Molecular allelo-karyotyping2008

    • Author(s)
      加藤元博, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] MLL遺伝子再構成陽性白血病における網羅的ゲノム解析2008

    • Author(s)
      加藤元博, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] ALK遺伝子の活性型変異は神経芽腫の発症に関与する2008

    • Author(s)
      陳玉彦, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] 小児AML with multilineage dysplasia の女児例2008

    • Author(s)
      朴明子, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] 神経芽腫における receptor tyrosine kinase の発現、変異と臨床像2008

    • Author(s)
      佐野弘純, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] 小児T細胞型白血病におけるPTEN遺伝子の解析2008

    • Author(s)
      朴明子, 他
    • Organizer
      第50回日本小児血液学会・第24回日本小児がん学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20081114-20081116
  • [Presentation] 小児急性骨髄性白血病における網羅的ゲノム解析2008

    • Author(s)
      大木健太郎, 他
    • Organizer
      第67回日本癌学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20081028-20081030
  • [Presentation] 神経芽腫における網羅的ゲノム解析および標的遺伝子の同定2008

    • Author(s)
      陳玉彦, 他
    • Organizer
      第67回日本癌学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20081028-20081030
  • [Presentation] 横紋筋肉腫における網羅的ゲノム解析2008

    • Author(s)
      滝田順子, 他
    • Organizer
      第67回日本癌学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20081028-20081030
  • [Presentation] 悪性リンパ腫における網羅的ゲノム解析2008

    • Author(s)
      加藤元博, 他
    • Organizer
      第67回日本癌学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20081028-20081030
  • [Presentation] 小児T細胞型急性リンパ性白血病におけるPTEN遺伝子の解析2008

    • Author(s)
      朴明子, 他
    • Organizer
      第67回日本癌学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20081028-20081030
  • [Presentation] DNAマイクロアレイによる小児急性骨髄性白血病の診断2008

    • Author(s)
      城青衣, 他
    • Organizer
      第67回日本癌学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20081028-20081030
  • [Presentation] 11q23転座以外の付加的染色体異常を認めたMLL再構成乳児急性リンパ性白血病の臨床的特徴及び予後2008

    • Author(s)
      田内久道, 他
    • Organizer
      第70回日本血液学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20081010-20081012
  • [Presentation] 小児ALLに対する化学療法早期の有効性と安全性の検討:TCCSG ALL L 04-16研究2008

    • Author(s)
      小原明, 他
    • Organizer
      第70回日本血液学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20081010-20081012
  • [Presentation] CD10の発現とMLL再構成が通常のパターンと異なった乳児急性リンパ性白血病の2症例2008

    • Author(s)
      佐野弘純, 他
    • Organizer
      第70回日本血液学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20081010-20081012
  • [Presentation] 小児AML with multilineage dysplasia の2例2008

    • Author(s)
      朴明子, 他
    • Organizer
      第70回日本血液学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20081010-20081012
  • [Presentation] 超高密度SNPアレイを用いたMLL再構成陽性小児白血病における molecular allelo-karyotyping2008

    • Author(s)
      滝田順子, 他
    • Organizer
      第70回日本血液学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20081010-20081012
  • [Presentation] 小児急性骨髄球性白血病における Molecular allelo-karyotyping2008

    • Author(s)
      大木健太郎, 他
    • Organizer
      第70回日本血液学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20081010-20081012
  • [Presentation] 高密度SNPマイクロアレイを用いた本邦の小児急性リンパ芽球性白血病の molecular karyotyping2008

    • Author(s)
      清河信敬, 他
    • Organizer
      第70回日本血液学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20081010-20081012
  • [Presentation] Moecular allelo-karyotyping of neuroblastoma using high-resolution single nucleotide polymorphism genomic microarrays2008

    • Author(s)
      Kato M, 他
    • Organizer
      ANR
    • Place of Presentation
      千葉
    • Year and Date
      20080521-20080524
  • [Presentation] Genome-wide analysis of epigenetic abnormalities in neuroblastoma using oligonucleotide tiling array2008

    • Author(s)
      Kato M, 他
    • Organizer
      ANR
    • Place of Presentation
      千葉
    • Year and Date
      20080521-20080524
  • [Presentation] High-resolution copy number analysis and identification of target genes in neuroblastoma using high-density SNP-genotyping microarrays2008

    • Author(s)
      Takita J, 他
    • Organizer
      ANR
    • Place of Presentation
      千葉
    • Year and Date
      20080521-20080524
  • [Presentation] Expression of KIT and PDGFR is associated with a good clinical outcome in neuroblastoma2008

    • Author(s)
      Sano H, 他
    • Organizer
      ANR
    • Place of Presentation
      千葉
    • Year and Date
      20080521-20080524
  • [Presentation] 好酸球増多症候群/好酸球性白血病マウスモデルの検討2008

    • Author(s)
      山田佳之, 林泰秀
    • Organizer
      第111回日本小児科学会学術集会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080425-20080427
  • [Presentation] 横紋筋肉腫における網羅的ゲノム解析2008

    • Author(s)
      滝田順子, 他
    • Organizer
      第111回日本小児科学会学術集会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080425-20080427
  • [Presentation] マイクロアレイを用いた乳児白血病の網羅的ゲノム・エピゲノム解析2008

    • Author(s)
      加藤元博, 他
    • Organizer
      第111回日本小児科学会学術集会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080425-20080427
  • [Presentation] 若年性急性骨髄単球性白血病における網羅的ゲノム・メチル化解析2008

    • Author(s)
      陳玉彦, 他
    • Organizer
      第111回日本小児科学会学術集会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080425-20080427
  • [Presentation] FBW7 and NOTCH1 mutations in childhood T-cell acute lymphoblastic leukemia and T-cell non-Hodgkin's lymphoma ; a Japan association of childhood leukemia study group2008

    • Author(s)
      Park MJ, 他
    • Organizer
      第48回イギリス血液学会
    • Place of Presentation
      イギリス
    • Year and Date
      20080405-20080409
  • [Presentation] 神経芽腫における網羅的ゲノム解析2008

    • Author(s)
      加藤元博, 他
    • Organizer
      第5回北関東がんセミナー
    • Place of Presentation
      高崎
    • Year and Date
      2008-05-10

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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