Detection of guanine oxidation products which cause G→C transversions.

2009 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19710052
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Risk sciences of radiation/Chemicals
• Research Institution: Tokushima Bunri University
• Principal Investigator: KINO Katsuhito Tokushima Bunri University, 香川薬学部・薬科学科, 講師 (70360534)
• Project Period (FY): 2007 – 2009
• Keywords: グアニン酸化損傷 / 紫外線 / G→Cトランスバージョン

Research Abstract

One of guanine oxidation products, oxazolone, causes G→C transversions. In this research, we intended to find aptamers binding oxazolone. Aptamaer binding oxazolone-resin were found but it can bind weakly with free oxazolone. Then some knowledge of finding aptamers binding oxazolone was obtained.

Research Products

• [Journal Article] Eukaryotic DNA polymerasesα, βandεincorporate guanine opposite 2, 2, 4-triamino-5(2H)-oxazolone. (2009)
  • Author(s): Kino, K. *, Sugasawa, K., Mizuno, T., Bando, T., Sugiyama, H., Akita, M., Miyazawa, H., Hanaoka, F.
  • Journal Title: ChemBioChem 10 Pages: 2613-2616
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Photoirradiation products of flavin derivatives, and the effects of photooxidation on guanine. (2009)
  • Author(s): Kino, K. *, Kobayashi, T., Arima, E., Komori, R., Kobayashi T., Miyazawa, H.
  • Journal Title: Bioorg. Med. Chem. Lett. 19 Pages: 2070-2074
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A new small molecule that directly inhibits the DNA binding of NF-kB. (2009)
  • Author(s): Kobayashi, T., Yoshimori, A., Kino, K., Komori, R., Miyazawa, H., Tanuma, S.
  • Journal Title: Bioorg. Med. Chem. 17 Pages: 5293-5297
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The oxidation of 2'-deoxy-8-oxoguanosine by iodine. (2009)
  • Author(s): Morikawa, M., Kobayashi, T., Kobayashi, T., Komori, R., Sei, Y., Miyazawa, H., Kino, K.
  • Journal Title: Nucleic Acids Sym. Ser. 53 Pages: 219-220
• [Journal Article] A new preparations of guanine photo-oxidation products. (2009)
  • Author(s): Kino, K. *, Morikawa, M., Kobayashi, T., Kobayashi T., Komori, R., Sei, Y., Miyazawa, H.
  • Journal Title: Photomed. Photobiol. 31 Pages: 5-6
• [Journal Article] Identification of RNA binding specificity for the TET-family proteins. (2008)
  • Author(s): Takahama, K., Kino, K., Arai, S., Kurokawa, R., Oyoshi, T.
  • Journal Title: Nucleic Acids Symp. Ser. 52 Pages: 213-214
• [Journal Article] Sequence dependence of fluorescence emission and quenching of doubly thiazole orange labeled DNA: effective design of a hybridization-sensitive probe. (2008)
  • Author(s): Ikeda S., Kubota T., Kino K., Okamoto A.
  • Journal Title: Bioconjugate Chem. 19 Pages: 1719-1725
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Detection of base pairing of an oxidatively damaged guanine using colloidal stability change of DNA-linked polymer micelles. (2007)
  • Author(s): Takarada T, Imaizumi E, Kino K, Yoshimoto K, Ogasawara S, Kanayama N, Maeda M.
  • Journal Title: Nucleic Acids Symp. Ser. 51 Pages: 305-6
• [Journal Article] User-freiendly synthesis and photoirradiation of a flavin-linked oligomer. (2007)
  • Author(s): Kino K., Miyazawa H., Sugiyama H.
  • Journal Title: Genes and Environment 29 Pages: 23-28
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The Oxidation of 8-Oxo-7, 8-dihydroguanine by Iodine
  • Author(s): Kino, K. *, Morikawa, M., Kobayashi, T., Kobayashi T., Komori, R., Sei, Y., Miyazawa, H.
  • Journal Title: Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010(in press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] オキサゾロンの点突然変異能 (2010)
  • Author(s): 喜納克仁
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学
  • Year and Date: 20100300
• [Presentation] ヨウ素による8oxoG酸化生成物の分子量測定 (2010)
  • Author(s): 森川雅行、小林輝彦、小林隆信、小森理絵、清悦久、宮澤宏、喜納克仁
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学
  • Year and Date: 20100300
• [Presentation] Ab initio calculation of base pairs containing oxazolone. (2009)
  • Author(s): Kino K, Kobayashi T., Komori R., Miyazawa H.
  • Organizer: 日本環境変異原学会第38回大会
  • Place of Presentation: 静岡
  • Year and Date: 20091100
• [Presentation] ヨウ素による8オキソグアニンの酸化反応 (2009)
  • Author(s): 喜納克仁、森川雅行、小林輝彦、小森理絵、小林隆信、清悦久、宮澤宏
  • Organizer: 第12回ヨウ素学会シンポジウム
  • Place of Presentation: 千葉大学
  • Year and Date: 20091000
• [Presentation] The oxidation of 2 ' -deoxy-8-oxoguanosine by iodine. (2009)
  • Author(s): Morikawa M, Kobayashi T, Kobayashi T, Komori R, Sei Y, Miyazawa H, Kino K.
  • Organizer: 6th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • Place of Presentation: 高山
  • Year and Date: 20090900-20091000
• [Presentation] グアニン光酸化生成物の新規生成反応とその解析 (2009)
  • Author(s): 喜納克仁、森川雅行、小林輝彦、小森理絵、小林隆信、清悦久、宮澤宏
  • Organizer: 第31回日本光医学・光生物学会
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 20090700
• [Presentation] ルミフラビンの新しい作成法 (2009)
  • Author(s): 小林輝彦、喜納克仁、小林隆信、小森理絵、宮澤宏
  • Organizer: 日本化学会第89春季年会
  • Place of Presentation: 千葉
  • Year and Date: 20090300
• [Presentation] 核酸結合タンパク質EWSのDNA結合性の解析 (2009)
  • Author(s): 高濱謙太朗・喜納克仁・内山裕美子・長橋真弓・大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第89春季年会
  • Place of Presentation: 千葉
  • Year and Date: 20090300
• [Presentation] ルミクロームの新しい作成法 (2009)
  • Author(s): 森川雅行、小林輝彦、喜納克仁、小林隆信、小森理絵、宮澤宏
  • Organizer: 日本薬学会第129年会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 20090300
• [Presentation] NF-kBのDNA結合を阻害する低分子化合物の同定 (2009)
  • Author(s): 小林隆信、吉森篤史、角田綾子、喜納克仁、小森理絵、田沼靖一、宮澤宏
  • Organizer: 日本薬学会第129年会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 20090300
• [Presentation] マウス胚性腫瘍細胞P19の神経細胞への分化過程で発言変動する遺伝子の解析 (2009)
  • Author(s): 鈴木雅代、和田彩、実井綾、矢田知見、山内沙也香、小森理絵、小林隆信、喜納克仁、宮澤宏
  • Organizer: 日本薬学会第129年会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 20090300
• [Presentation] Synthesis and reactivity of vitamin B2 derivatives photooxidizing guanine (2008)
  • Author(s): Kino K., Kobayashi T., Morikawa M., Komori R., Kobayashi T., Miyazawa H.
  • Organizer: 日本環境変異原学会第38回大会
  • Place of Presentation: 那覇
  • Year and Date: 20081200
• [Presentation] マウス胚性腫瘍細胞P19の神経分化過程における遺伝子発現解析 (2008)
  • Author(s): 小森理絵, 鈴木雅代, 和田彩, 徳田佳子, 中山智子, 小林隆信, 喜納克仁, 宮澤宏
  • Organizer: 日本分子生物学会第31回年会・日本生化学会第81回大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 20081200
• [Presentation] NF-κBとDNAの結合を阻害する新規低分子阻害剤の同定 (2008)
  • Author(s): 小林隆信、吉森篤史、喜納克仁、小森理絵、田沼靖一、宮澤宏
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 20081200
• [Presentation] グアニン酸化損傷の効果の予測 (2008)
  • Author(s): 喜納克仁
  • Organizer: 第11回生命化学研究会
  • Place of Presentation: 水上(群馬)
  • Year and Date: 20081100
• [Presentation] ビタミンB2からのフラビン誘導体の合成 (2008)
  • Author(s): 小林輝彦, 喜納克仁, 小林隆信, 小森理絵, 宮澤宏
  • Organizer: 第47回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 20081100
• [Presentation] DNA酸化損傷に対して特異的に認識するDNAアプタマーの探索 (2008)
  • Author(s): 森川雅行, 喜納克仁, 千田岳史, 小林輝彦, 小森理絵, 小林隆信, 宮澤宏
  • Organizer: 第47回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 20081100
• [Presentation] チアゾールオレンジのエキシトン相互作用を利用したDNAプローブの配列依存的な蛍光特性 (2008)
  • Author(s): 池田修司、久保田健、喜納克仁、岡本晃充
  • Organizer: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  • Year and Date: 20080900
• [Presentation] グアニン酸化損傷を認識するDNAアプタマーの探索 (2008)
  • Author(s): 喜納克仁、森川雅行、小林輝彦、小森理絵、小林隆信、宮澤宏
  • Organizer: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  • Year and Date: 20080900
• [Presentation] 核酸結合タンパク質EWSのDNA結合性の解析 (2008)
  • Author(s): 高濱謙太郎、喜納克仁、内山裕美子、大吉崇文
  • Organizer: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  • Year and Date: 20080900
• [Presentation] フラビン誘導体の合成 (2008)
  • Author(s): 喜納克仁
  • Organizer: 新世代の生物有機化学研究会
  • Year and Date: 20080600
• [Presentation] DNA損傷を認識するDNAアプタマーの探索 (2008)
  • Author(s): 森川雅行、喜納克仁、小林輝彦、小森理絵、小林隆信、宮澤宏
  • Organizer: 日本薬学会第128年会
  • Year and Date: 20080300
• [Presentation] マウス胚性腫瘍細胞P19の神経分化にかかわる遺伝子・タンパク質の網羅的探索 (2007)
  • Author(s): 小森理絵、木内郁代、松田島英里、小林隆信、喜納克仁、宮澤宏
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会
  • Year and Date: 20071200
• [Presentation] グアニン酸化の新規生成経路 (2007)
  • Author(s): 喜納克仁
  • Organizer: 新世代の生物有機化学研究会2007
  • Year and Date: 20070600
• [Presentation] Detection of base pairing of an oxidatively damaged guanine using colloidal stability change of DNA-linked polymer micelles. (2007)
  • Author(s): Takarada T, Imaizumi E, Kino K, Yoshimoto K, Ogasawara S, Kanayama N, Maeda M
  • Organizer: 5th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • Place of Presentation: Tokyo, Japan
  • Year and Date: 20070000
• [Book] Prog. DNA Damage Res.(Molecular basis of guanine oxidation under UV-A/VIS radiation and its biological effects., Chapter X) (2008)
  • Author(s): Kino K. *, Sugiyama H, Miyazawa H.
  • Total Pages: 271-276
• [Book] 13章 遺伝子損傷の分子機構(化学フロンティア ゲノム化学の最前線-医学、分子生物学への応用と展開-) (2007)
  • Author(s): 喜納克仁
  • Total Pages: 99-107
• [Remarks] Kino, K., Ikeda, S., Okamoto, A. NABiT SF 2. 0
  • URL: http://kp.bunri-u.ac.jp/kph04/index.htm1
• [Remarks] 喜納克仁、小林輝彦、有馬英治、小森理絵、小林隆信、宮澤宏「フラビン誘導体の光分解生物とグアニン光酸化反応」ビタミン,2010, 84, 59-60.
• [Remarks] 喜納克仁、宮澤宏、杉山弘 「フラビン結合オリゴマーの簡易合成法と光反応解析」ビタミン, 2008, 82, 35-37.
• [Remarks] 喜納克仁 (2009) 「グアニン酸化損傷の発生、変異、修復」12 月、京都大学
• [Remarks] 喜納克仁 (2008)「グアニン酸化損傷の生体内への影響」北陸先端科学技術大学院大学セミナー 10 月、能美(石川)
• [Remarks] 喜納克仁「DNA 化学反応 ～がん・老化のきっかけ～」第185 回 やさしい科学技術セミナー (主催:JapanPrize) 2008 年9 月13 日実施※youtube での公開http://www.youtube.com/watch?v=gI6CZ33oIkE
• [Remarks] 喜納克仁「最新のDNA 研究理解」四国新聞, 2008, 9 月14 日, 22.