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2009 Fiscal Year Annual Research Report

機能性分子間相互作用ダイナミックス研究への展開

Research Project

Project/Area Number 19710109
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

谷中 淳  University of Tsukuba, 大学院・数理物質科学研究科, 助教 (80400638)

Keywords原子間力顕微鏡 / 動的分子間力分光法 / ポテンシャル障壁 / 機能性分子
Research Abstract

DNAや抗原抗体などの機能性分子から分子デバイス構築などへの応用を目指す場合、相互認識により特異的な結合を形成する2分子間の相互作用を、温度変化などの環境に対して精密に理解することが重要かつ緊急課題である。本研究では原子間力顕微鏡と動的分子間力分光法を組み合わせることにより、新しい方法で分子間相互作用ポテンシャルを求めた。
温度変化によるポテンシャル曲線の差を精密に測定した。4℃から60℃へ徐々に温度を上げていき、結合ポテンシャルの変化を測定することで、直接結合と架橋結合との差を解析した。直接結合では温度の変化によって障壁位置に変化は現れず、架橋結合の時は障壁位置に変化が現れた。このことから、直接結合では結合ポテンシャルの変化は小さく、架橋結合の場合は架橋分子の温度に対する平衡状態を考慮して解析する必要があることがわかった。
分子鎖とタンパク質の化学結合を変化させることによって、結合ポテンシャルを個々に分離して測定し、表面とタンパク質の相互作用が結合ポテンシャルの分離測定に関係していることを解明した。結合寿命がタンパク質の化学結合の状態で予想通りに変化することもわかった。また、それを利用することでポテンシャル障壁の変化を測定し、機能変化および結合箇所に依存した反応機構を解明した。
より複雑な破断を示すアビジンについて、上記分離測定と溶液中のイオン種変更によって、ストレプトアビジンとは異なり、溶液中の分子が架橋することなくビオチンと結合していることを解明した。

  • Research Products

    (8 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] 原子間力顕微鏡を用いた動的分子間力分光法 -Biotin-Streptavidin 結合ポテンシャルの分離測定-2010

    • Author(s)
      谷中淳、武内修、重川秀実
    • Journal Title

      表面科学 31

      Pages: 41-47

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Site-Selective Anatomy of Step-by-Step Reactions in Ligand-Receptor Bonding Processes Using Dynamic Force Spectroscopy2009

    • Author(s)
      谷中淳, 武内修, 重川秀実
    • Journal Title

      Applied Physics Express 2

      Pages: 085002

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Origin of variety of microscopic interactions for biotin-streptavidin/avidin complexes clarified using Dynamic Force Spectroscopy2009

    • Author(s)
      谷中淳, 武内修, 重川秀実
    • Organizer
      17th International Colloquium on Scanning Probe Microscopy
    • Place of Presentation
      Atagawa Heights Shizuoka
    • Year and Date
      20091210-20091212
  • [Presentation] 動的分子間力分光法によるストレプトアビジン/アビジン-ビオチン相互作用の解析2009

    • Author(s)
      谷中淳、武内修、重川秀実
    • Organizer
      第29回表面科学 学術講演会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀 東京都江戸川区
    • Year and Date
      2009-10-28
  • [Presentation] AFM/DFSによる機能性分子の結合ポテンシャルの分離測定の試みと展開2009

    • Author(s)
      谷中淳、武内修、重川秀実
    • Organizer
      バイオSPM研究会
    • Place of Presentation
      エスアイアイ・ナノテクノロジー セミナールーム東京都中央区
    • Year and Date
      2009-09-11
  • [Remarks] 研究内容

    • URL

      http://dora.bk.tsukuba.ac.jp

  • [Remarks] 雑誌論文

    • URL

      http://dora.bk.tsukuba.ac.jp/results.html

  • [Remarks] 学会発表

    • URL

      http://dora.bk.tsukuba.ac.jp/results-conference.html

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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