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2009 Fiscal Year Annual Research Report

シクロデキストリンによる包接現象及び分子認識に関する分子シミュレーション

Research Project

Project/Area Number 19740261
Research InstitutionYamaguchi University

Principal Investigator

浦上 直人  Yamaguchi University, 大学院・理工学研究科, 講師 (50314795)

Keywords計算物理 / 超分子化学 / 自己組織化 / 分子認識 / ナノ材料
Research Abstract

前年度までに、シクロデキストリンと高分子鎖に関する粗視化モデルを構築し、それぞれ、環状分子、鎖状分子として表した。今年度は、この粗視化モデルを用い、鎖長認識シミュレーションを行った。長さの異なる2種類の鎖状分子を用い、環状分子が、どちらの鎖状分子と包接化合物を形成するかを調べた。環状分子数が少ない場合は、長い鎖状分子とのみ包接化合物を形成し、鎖長が認識される。しかしながら、環状分子数が多くなると、両方の鎖状分子と包接化合物を形成し、鎖長認識は観察されない。この結果は、実験結果を非常によく再現している。次に、鎖状分子の長さの違いが少ない場合についても同様のシミュレーションを行った。その結果、環状分子の数に関係なく両方の鎖状分子と包接化合物を形成した。これら結果をより詳しく調べるため、包接化合物を形成してから解離するまでの時間、つまり包接化合物の形成時間に対する鎖長依存性を調べた。その結果、鎖長が長くなればなるほど包接化合物を形成している時間が長く、一度包接化合物を形成するとほとんど解離しないことが分かった。
以上の結果をもとに、鎖長認識メカニズムの調べるため、以下のような簡単な仮説を立て、鎖状分子と包接化合物を形成する割合を計算した。
1. 包接化合物はどちらの鎖状分子とも同じ確率で包接化合物の形成し、その後解離する。
2. 環状分子が解離している時間は、包接化合物を形成している時間に比べ非常に短く、無視できる。
この結果、シミュレーションで得られた結果と理論的に得られた結果を比較したところ、非常に良く一致していることが分かった。そのため、鎖長認識は、包接化合物を形成している時間の違いによって説明できると言える。

  • Research Products

    (5 results)

All 2010 2009

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Simulation of pseudopolyrotaxane formation and orientational order between pseudopolyrotaxanes2010

    • Author(s)
      浦上直人, 他
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics 132

      Pages: 1-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] シクロデキストリンの包接化合物形成と分子認識-粗視化モデルを用いたシミュレーション-2010

    • Author(s)
      浦上直人
    • Journal Title

      分子シミュレーション研究会会誌 (掲載予定)

      Pages: 1-4

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Simulation of Chain Length Recognition in the Formation of Inclusion Complex2009

    • Author(s)
      浦上直人, 他
    • Organizer
      Conference on Computational Physics
    • Place of Presentation
      高雄(台湾)
    • Year and Date
      2009-12-18
  • [Presentation] 擬ポリロタキサンの形成と鎖長認識シミュレーション2009

    • Author(s)
      浦上直人, 他
    • Organizer
      第58回 高分子学会討論会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      2009-09-18
  • [Presentation] 環状分子による鎖長認識メカニズムの解析2009

    • Author(s)
      浦上直人, 他
    • Organizer
      第58回 高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2009-05-28

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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