2008 Fiscal Year Annual Research Report

陸上・海底堆積物における細胞外DNAの分布とその重要性の解明

Research Project

Project/Area Number	19740315
Research Institution	National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
Principal Investigator	竹内美緒 National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 地圏資源環境研究部門, 研究員 (20357403)
Keywords	細胞外DNA / 地球化学 / 大深度地下 / 核酸 / 微生物 / 堆積物
Research Abstract	昨年度までの研究において,堆積物中における細胞外DANは,量としては細胞内DANよりも多く存在するものの,損傷を受けている可能性が高く,十分な遺伝子情報が回収できないことが明らかになった。そこで,生きている微生物態系と死んでいる微生物生態系を区別して解明する他のツールとして,RNAを用いた手法を取り入れ,DANを用いた手法による解析結果と比較することとした。それに向けた手法の確立ならびに新たな手法による解析を目的とし,予算の繰り越しを行った。 7月までの間に地下堆積物からのRNA抽出方法に関する手法の確認ならびに実試料を用いた解析を行った。関東平野の沖積層の掘削試料について,RNA抽出ならびに微生物相解析を行ったところ,これまでに海底堆積物でのみ生息が報告されている古細菌のグループが陸域地下圏にも生息していることが確認された。