• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2007 Fiscal Year Annual Research Report

細胞核内環境を再現するヒストン模倣ナノ粒子の作製とそれによる転写活性の制御

Research Project

Project/Area Number 19750149
Research InstitutionKonan University

Principal Investigator

三好 大輔  Konan University, 先端生命工学研究所, 講師 (50388758)

Keywordsヒストン / 転写 / 核酸 / 分子クラウディング / ナノ粒子 / ワトソン-クリック塩基対 / フーグスティーン塩基対 / クロマチン
Research Abstract

本研究では、平成19年度の目的として、細胞核内の環境を化学的に模倣し、細胞における核酸の挙動を定量的に解明することを設定した。細胞核内は、さまざまな生命分子が高密度に存在する分子クラウディング状態にあることから、核酸の構造と熱力学的安定性に及ぼす分子クラウディングの効果を検討した。その結果、分子クラウディングによって、ワトソンクリック塩基対から形成される核酸の構造が不安定化するのに対し、フーグスティーン塩基対から形成される核酸の構造は安定化することが見出された(Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids,26,589(2007))。また、分子クラウディングの効果を用いて、DNAを基質とする酵素(ヌクレアーゼ)の機能活性を制御できた(Nucleic Acids Res.,35,4086(2007))。このような細胞を模倣した環境下において、核酸の構造安定性や酵素の機能活性を合目的的に調節できたことは、平成20年度の目標である転写活性の制御につながる成果であるといえる。さらに、細胞核内に存在するヒストンが核酸と結合している部位を化学的に合成し、核酸の構造安定性に及ぼす効果についても定量的に検討した。その結果、ヒストン模倣ペプチドによって、フーグスティーン塩基対から形成される核酸の構造のみが安定化することが見出された(Nucleic Acids Symp. Ser.(Oxf),51,167(2007))。この結果は、細胞内で転写活性を制御しているクロマチン構造の状態変化に対応するものとして非常に興味深い。また、化学修飾や低分子化合物を用いて核酸の構造や安定性を制御する方法も見出した(J. Am. Chem. Soc.,129,5919(2007)、Tetrahedron Lett.,48,8514(2007))。以上のように、本年度の目標を達成し、本研究の最終的な目標である「細胞核内環境を再現するヒストン模倣ナノ粒子の作製とそれによる転写活性の制御」に向けて有用な成果が得られた。

  • Research Products

    (27 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (17 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Artificial G-wire switch with 2,2'-bipyridine units responsive to divalent metal ions.2007

    • Author(s)
      D. Miyoshi, H. Karimata, Z.-M. Wang, K. Koumoto, and N. Sugimoto
    • Journal Title

      J. Am. Chem, Soc. 129

      Pages: 5919-5925

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular imprinting under molecular crowding conditions: an aid to the synthesis of a high-capacity polymeric sorbent for triazine herbicides.2007

    • Author(s)
      J. Matsui, S. Goji, T. Murashima, D. Miyoshi, S. Komai, A. Shigeyasu, T. Kushida, T. T, Miyazawa, T. Yamada, K. Tamaki, and N. Sugimoto
    • Journal Title

      Anal. Chem. 79

      Pages: 1749-1757

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis, structure and thermal stability of fully hydrophobic porphyrin-DNA conjugates.2007

    • Author(s)
      T. Murashima, K. Hayata, Y. Saiki, J. Matsui, D. Miyoshi, T. Yamada, T. Miyazawa, and N. Sugimoto
    • Journal Title

      Tetrahedron Lett. 48

      Pages: 8514-8517

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids2007

    • Author(s)
      D. Miyoshi, H. Karimata, and N. SugimotoHydration regulates thermodynamic stability of DNA structures under molecular crowding conditions.
    • Journal Title

      Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids 26

      Pages: 589-595

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of DNA nucleases by molecular crowding.2007

    • Author(s)
      Y. Sasaki, D. Miyoshi, and N. Sugimoto
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 35

      Pages: 4086-4093

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of cosolutes on the thermodynamic stability of parallel DNA duplex and triplex.2007

    • Author(s)
      K. Nakamura, H. Karimata, T. Ohmichi, D. Miyoshi, and N. Sugimoto
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp. Ser. 51

      Pages: 167-168

  • [Journal Article] Conformational switch of a functional nanowire based on the DNA G-quadruplex.2007

    • Author(s)
      H. Karimata, D. Miyoshi, T. Fujimoto, K. Koumoto, Z.-M. Wang, and N. Sugimoto
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp. Ser. 51

      Pages: 251-252

  • [Presentation] NanoBioNow(10)周辺の分子環境に応答するDNAナノスイッチの構築2008

    • Author(s)
      狩俣寿枝・三好大輔・藤本健史・甲元一也・Zhong-Ming, Wang・杉本直己
    • Organizer
      日本化学会第88回春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080300
  • [Presentation] NanoBioNow(7)カチオン性ポルフィリンによるDNA四重鎖の構造制御2008

    • Author(s)
      村嶋貴之・三好大輔・松井淳・宮澤敏文・山田隆己・杉本直己
    • Organizer
      日本化学会第88回春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080300
  • [Presentation] NanoBioNow(5)DNA二重鎖による機能性DNA四重鎖の配向化2008

    • Author(s)
      三好大輔・K. Dutta・S. Muhuri・井上真美子・杉本直己
    • Organizer
      日本化学会第88回春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080300
  • [Presentation] NanoBioNow(4)DNA四重鎖の熱力学的安定性に及ぼすカルテットとループの安定性の寄与2008

    • Author(s)
      藤本健史・狩俣寿枝・三好大輔・杉本直己
    • Organizer
      日本化学会第88回春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080300
  • [Presentation] NanoBioNow(3)共存溶質の分子クラウディングによるフーグスティーン塩基対からなるDNA構造の安定化2008

    • Author(s)
      中村かおり・狩俣寿枝・三好大輔・大道達雄・杉本直己
    • Organizer
      日本化学会第88回春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080300
  • [Presentation] NanoBioNow(6)ポルフィリン修飾核を含むDNA二重鎖の構造と安定性2008

    • Author(s)
      佐伯裕美・村嶋貴之・松井淳・三好大輔・宮澤敏文・山田 隆己・杉本直己
    • Organizer
      日本化学会第88回春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080300
  • [Presentation] NanoBioNow(9)The structure of G-quadruplex for 5-UTR mRNA of bcl-2 under molecular crowing condition2008

    • Author(s)
      張東浩・三好大輔・杉本直己
    • Organizer
      日本化学会第88回春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080300
  • [Presentation] 化学的刺激に応答する機能性核酸マテリアルの開発2008

    • Author(s)
      三好大輔
    • Organizer
      日本化学会第88回春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080300
  • [Presentation] Development of functional nanobiodevices with DNAs2007

    • Author(s)
      三好大輔・中野修一・狩俣寿枝・井上真美子・中村かおり・魚谷有希・岡裕人・Z.-M. Wang・甲元一也・杉本直己
    • Organizer
      5th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20071100
  • [Presentation] Conformational switch of a functional nanowire based on the DNA G-quadruplex2007

    • Author(s)
      狩俣寿枝・三好大輔・藤本健史・甲元一也・Z.-M. Wang・杉本直己
    • Organizer
      5th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20071100
  • [Presentation] 擬似細胞環境下における長鎖テロメア核酸の構造と熱力学的安定性2007

    • Author(s)
      三好大輔・Hai-Qing Yu・狩俣寿枝・杉本直
    • Organizer
      日本化学会生体関連化学部会シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20070900
  • [Presentation] TELOMERE DNA-BASED LOGIC GATES2007

    • Author(s)
      三好大輔・井上真美子・杉本直己
    • Organizer
      The 2nd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20070900
  • [Presentation] 化学入力に応答するユニバーサルDNA論理素子の開発2007

    • Author(s)
      三好大輔・井上真美子・杉本直己
    • Organizer
      日本化学会バイオテクノロジー部会シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20070900
  • [Presentation] Effects of cosolutes on the thermodynamic stability of parallel DNA duplex and tripiex.2007

    • Author(s)
      中村かおり・狩俣寿枝・大道達夫・三好大輔・杉本直己
    • Organizer
      2nd European Conference on Chemistry for Life Sciences
    • Place of Presentation
      Wroclaw, Poland
    • Year and Date
      20070900
  • [Presentation] Design and Development of Functional Molecules Based on Nucleic Acids2007

    • Author(s)
      三好大輔・中野修一・狩俣寿枝・井上真美子・中村かおり・魚谷有希・岡裕人・Z.-M. Wang・甲元一也・杉本直己
    • Organizer
      Gordon Research Conference (Nucleosides, Nucleotides & Oligonucleotides)
    • Place of Presentation
      Newport, RI, USA
    • Year and Date
      20070700
  • [Presentation] 細胞内環境因子に応答するユニバーサルDMロジックゲートの構築2007

    • Author(s)
      三好大輔・井上真美子・杉本直己
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー研究会 第2回年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20070500
  • [Presentation] Development of Functional DNAs Based on G-Quadruplexes2007

    • Author(s)
      三好大輔・H. Q. Yh・狩俣寿枝・杉本直己
    • Organizer
      First International Meeting of Quadruplex DNA
    • Place of Presentation
      Louisville, KY, USA
    • Year and Date
      20070400
  • [Book] 未来材料2007

    • Author(s)
      三好大輔・杉本直己
    • Total Pages
      9
    • Publisher
      (株)エヌ・ティー・エス
  • [Book] 化学2007

    • Author(s)
      杉本直己・三好大輔
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      化学同人
  • [Remarks]

    • URL

      http://fiber.konan-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi