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2008 Fiscal Year Annual Research Report

黄色ブドウ球菌由来の鉄取り込み関連細胞壁結合型病原因子蛋白質Isdの構造機能解析

Research Project

Project/Area Number 19770076
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

田中 良和  Hokkaido University, 創成科学共同研究機構, 特任助教 (20374225)

Keywords黄色ブドウ球菌 / ヘム結合タンパク質 / X線結晶構造解析 / Isdシステム
Research Abstract

本研究課題では, 高い病原性と薬剤耐性菌の出現により院内感染を引き起こすとして社会問題になっている, 黄色ブドウ球菌の鉄獲得システムのひとつであるIsdシステムに着目し, Isdシステムの蛋白質中に存在するヘム結合ドメイン, NEAT(NEAr Transporter)ドメインのヘム結合特性を解析した. 前年度までに得られたX線結晶構造解析の情報に加え, 分析超遠心分離法, ゲルろ過クロマトグラフィーによる解析, 等温滴定型熱量測定, 分光光度計を用いたヘム結合解析により, 1分子のIsdH-NEAT3が多分子のヘムと結合できることを見出した. X線結晶構造解析では, 2分子のNEATドメインの間に結合したヘム分子がスタックして疎水性相互作用をしており, これは他のヘム結合蛋白質Sphによる多分子のヘム結合様式と類似していた. これまでに報告されたNEATドメインはいずれも1分子のヘムと結合することを示唆したが, 本研究により得られた, 1分子のNEATドメインが多分子のヘムと結合できるという知見は, 効率よくヘムを取り込むために発達した機能と推察される. 本研究で解析したIsdH-NEAT3は, Isdシステムの最上流に位置する蛋白質であり, 多分子のヘムを結合することで, 系全体の効率の向上に貢献すると考えられる. Isdシステムの蛋白質は, 黄色ブドウ球菌に対するワクチンとしての応用が期待されているが, 本研究により, その分子特性を知ることができた. 今後, これらの知見が, ワクチン薬の創成に応用されることを強く期待する.

  • Research Products

    (15 results)

All 2009 2008

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] Immobilized metal affinity chromatography in the presence of arginine2009

    • Author(s)
      R. Abe, M. Kudou, Y. Tanaka, T . Arakawa, and K. Tsumoto
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun 381

      Pages: 306-310

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Staphylococcus aureus Surface Protein SasG Contributes to Intercellular Autoaggregation of Staphylococcus aureus2008

    • Author(s)
      M. Kuroda, R. Ito, Y. Tanaka, M. Yao, K. Matoba, S. Saito, I. Tanaka, and T. Ohta
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun 377

      Pages: 1102-1106

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural and Functional Characterization of the LidR from Corynebacterium glutamicum : a Transcriptional Repressor Involved in L-Lactate and Sugar Utilization2008

    • Author(s)
      Y.-G. Gao, H. Suzuki, H. Itou, Y. Zhou, Y. Tanaka, M. Wachi, N. Watanabe, I. Tanaka, and M. Yao
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res 36

      Pages: 7110-7123

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Electron Microscopy and Computational Studies of Ebh, a Giant Cell-wall-associated Protein from. Staphylococcus aureus2008

    • Author(s)
      S. Sakamoto, Y. Tanaka, I. Tana ka, T. Takei, J. Yu, M. Kuroda, M. Yao, T. Ohta, and K. Tsumoto
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun 376

      Pages: 261-266

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for multimeric heme complexation through a specific protein-heme interaction : the case of the third NEAT domain of IsdH from Staphylococcus aureus2008

    • Author(s)
      M. Watanabe, Y. Tanaka, A. Sue naga, M. Kuroda, M. Yao, N. W atanabe, F. Arisaka, T. Ohta, I. Tanaka and K. Tsumoto
    • Journal Title

      J. Biol. Chem 283

      Pages: 28649-28659

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure-based analysis reveals hydration changes induced by arginine hydrochloride2008

    • Author(s)
      M. Nakakido, Y. Tanaka, M. Mit suhori, M. Kudou, D. Ejima, T. Arakawa, and K. Tsumoto
    • Journal Title

      Biophys. Chem 137

      Pages: 105-109

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Staphylococcus aureus Giant Protein Ebh is Involved in Tolerance to Transient Hyperosmotic Pressure2008

    • Author(s)
      M. Kuroda, Y. Tanaka, R. Aoki, D. Shu, K. Tsumoto and T. Ohta
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Comm 374

      Pages: 237-241

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] How Protein Recognizes Ladder-Like Polycyclic Ethers : Interactions Bet ween Ciguatoxin(CTX3C)Fragments and Its Specific Antibody 10C92008

    • Author(s)
      M. Ui, Y. Tanaka, T. Tsumuraya , I. Fujii, M. Inoue, M. Hirama, and K. Tsumoto
    • Journal Title

      J. Biol. Chem 283

      Pages: 19440-19447

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Thermodynamic Analysis Reveals that GTP Binding Affects the Interaction between the alpha-and gamma-subunits of Translation Initiation Factor 22008

    • Author(s)
      M. Nakakido, Y. Tanaka, M. So kabe, and K. Tsumoto
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Comm 371

      Pages: 596-599

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression, Purification, Crystallization, and Primary Diffraction Analys is of CapF, a Capsular Polysaccharide Synthesis Enzyme from Staphylococcus aureus2008

    • Author(s)
      T. Miyafusa, Y. Tanaka, M. Kur oda, T. Ohta and K. Tsumoto
    • Journal Title

      Acta Cryst F64

      Pages: 512-515

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 黄色ブドウ球菌由来巨大蛋白質Ebhの構造解析2008

    • Author(s)
      田中良和
    • Organizer
      23^<rd> Summer University in Hokkaido&2008年度北海道高分子若手研究会
    • Place of Presentation
      北海道
    • Year and Date
      20080829-30
  • [Presentation] Structural analysis of a giant cell wall-associated adhesion protein Ebh from Staphylococcus aureus2008

    • Author(s)
      Yoshikazu Tanaka, Sou Sakamoto, Makoto Kuroda, Shuichiro Goda, Yong-Gui Gao, Kouhei Tsumoto, Yuzuru Hiragi, Min Yao, No buhisa Watanabe, Toshiko Ohta, and Isao Tanaka
    • Organizer
      International Union of Crystallography 2008
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      20080822-28
  • [Presentation] A Helical String of Alternately Connected Two Three-helix Bundles for the 1.1-Megadalton Cell Wall-Associated Protein Ebh from Staphylococcus aureus2008

    • Author(s)
      Yoshikazu Tanaka, Sou Sakamoto, Makoto Kuroda, Shuichiro Goda, Yong-Gui Gao, Kouhei Tsumoto, Yuzuru Hiragi, Min Yao, Nobuhisa Watanabe, Toshiko Ohta, and Isao Tanaka
    • Organizer
      Protein Society
    • Place of Presentation
      San Diego
    • Year and Date
      20080718-24
  • [Presentation] 黄色ブドウ球菌由来Dro35と高等生物由来解毒蛋白質の構造類似性2008

    • Author(s)
      田中良和, 大木優, 森川一也, 姚〓, 津本浩平, 渡邉信久, 大田敏子, 田中勲
    • Organizer
      毒素シンポジウム
    • Place of Presentation
      山中湖
    • Year and Date
      20080702-06
  • [Presentation] 巨大細胞表面蛋白質Ebhの全体構造に関する考察2008

    • Author(s)
      田中良和, 坂本壮, 黒田誠, 郷田秀一郎, 高永貴, 津本浩平, 柊弓弦, 姚〓, 渡邉信久, 大田敏子, 田中勲
    • Organizer
      蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080610-0612

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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