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2008 Fiscal Year Annual Research Report

ユビキチンリガーゼSCF Fbs複合体構造解析による糖蛋白質分解品質管理機構解析

Research Project

Project/Area Number 19770080
Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

水島 恒裕  Nagoya City University, 大学院・薬学研究科, 准教授 (90362269)

Keywordsユビキチン / 糖鎖 / SCFユビキチンリガーゼ / 蛋白質分解 / 品質管理
Research Abstract

ユビキチンープロテアソームタンパク質分解経路は細胞内の不要タンパク質を特異的に分解することで生体内の機能を維持している。SCF^<Fbs1>はヘテロ四量体を形成し小胞体内における小胞体関連分解系において立体構造異常な糖タンパク質や余剰サブユニットにユビキチンを付加し分解系へと導いている。また、高等動物ではFbs1とホモロジーの高いFbs2、FBG3などのタンパク質が存在しており、それらも同様にSCF複合体を形成しユビキチンリガーゼとして機能している。これまでにSCFユビキチンリガーゼの反応機構と糖鎖の認識機構の理解を目指し、Skp1-Fbs1複合体、Fbs1-RNaseB複合体の結晶構造を決定した。また、これまでにFbs2はFbs1に比べ糖鎖との結合が弱く、FBG3はFbs1が特異的に認識している糖鎖であるキトビオースと結合しないことが分かっていたことから、立体構造と糖鎖認識特異性の理解を目指し、Skp1-Fbs2複合体、Skp1-FBG3複合体の結晶化を行った。その結果、Skp1-FBG3は分解能2.6Aの回折データを収集し、Skp1-Fbs1の立体構造をモデルに分子置換法により立体構造を決定した。Skp1-FBG3複合体の全体構造はSkp1-Fbs1のものと非常によく似ていた。しかしFbs1においてキトビオースと結合する部位の立体構造は、結合を担うアミノ酸が保存または類似した性質を持っているにも関わらず、その立体配置が異なっておりキトビオースと結合できない状態をとっていることが明らかとなった。

  • Research Products

    (8 results)

All 2009 2008

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] 出芽酵母20Sプロテアソーム形成に関わるシャペロン複合体Dmp1/Dmp2の立体構造解析2008

    • Author(s)
      八代田英樹、水島恒裕
    • Journal Title

      細胞工学 27

      Pages: 474-475

  • [Journal Article] Structure of Damino-acid amidase complexed with Lphenylalanine with Lphenylalanine amide : insight into Dstereospecificity of D-amino-acid amidase from Ochrobacterum anthropi SV32008

    • Author(s)
      Okazaki S, Suzuki A, Mizushima T, Komeda H, Asano Y, Yamane T
    • Journal Title

      Acta Cryst. D 64

      Pages: 331-334

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for sorting mechanism of p62 in selective autophagy2008

    • Author(s)
      Ichimura Y, Kumanomidou T, Sou Y, Mizushima, T, Ezaki, J, Ueno T, Kominami E, Yamane T, Tanaka K, Komatsu M
    • Journal Title

      J. Biol. Chem 283

      Pages: 22847-22857

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The novel structure of a pyridoxal 5'phosphatedependent fold-type Iracemase, alpha-amino-epsilon-caprolactam racemase from Achromobacter obae2008

    • Author(s)
      Okazaki S, Suzuki A, Mizushima T, Kawano T, Komeda H, Asano Y, Yamane T
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 941-950

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 鎖認識ユビキチンリガーゼFbsファミリーの構造と反応機構2009

    • Author(s)
      水島恒裕
    • Organizer
      第4回プロテオミクス・構造生物学講演会
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2009-01-30
  • [Presentation] STRUCTURE BASIS FOR RECOGNITION OF GLYCOSYLATED SUBSTRATES BY SCFFbs1 UBIQUITIN LIGASE2008

    • Author(s)
      Mizushima T., Yoshida Y., Kumanomidou T., Yamaguchi Y., Yamane T., Tanaka K., Kato K.
    • Organizer
      ZOMES V
    • Place of Presentation
      Yokohama, Japan
    • Year and Date
      2008-11-13
  • [Presentation] X-ray Structure of the Skp1-Fbs1 glycoprotein complex2008

    • Author(s)
      Mizushima T., Yoshida Y., Kumanomidou T., Hasegawa Y., Suzuki A., Yamane T., Tanaka K.
    • Organizer
      FEBS Congress & IUBMB Conference
    • Place of Presentation
      Athens, Greece
    • Year and Date
      2008-06-30
  • [Presentation] プロテアソームシャペロンDmp1-Dmp2複合体による20Sプロテァソーム分子集合機構2008

    • Author(s)
      水島恒裕、八代田英樹、田中啓二
    • Organizer
      日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-06-12

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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