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2007 Fiscal Year Annual Research Report

糖尿病の慢性化に関与する受容体RAGEとそのりガンドとの複合体の結晶構造解析

Research Project

Project/Area Number 19770104
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

石谷 隆一郎  Tokyo Institute of Technology, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (30401186)

Keywords糖尿病 / 血管障害 / 血管新生 / X線結晶構造解析 / 後期糖化反応生成物 / アンフォテリン / S100A12蛋白質 / アミロイドβペプチド
Research Abstract

膜タンパク質は膜貫通ドメインに疎水性アミノ酸が密集しているために可溶化しづらく、RAGEは結晶化が難しいと予想された。そこで、レセプタT型RAGEのC末端細胞質ドメインと膜貫通ドメインを欠いた構造をもつスプライシングアイソフォーム、分泌型sRAGE(soluble RAGE)を解析する標的とした。sRAGEは培養2.5Lあたり最大15mgまで得られ、結晶化スクリーニングを行った。次いで、AGE構造体の1つであるpentosidineと混合した複合体もスクリーニングを行った。sRAGEのプロテアーゼ限定分解を行ったところ、十分量のキモトリプシン存在下でサンプルがおよそ1/2質量分まで分解された。この結果から、精製したsRAGE分子がばらばらに不安定なコンフォメーションをとっていることが推察された。そこで現在、分断されたsRAGEがリガンド結合部位を保持した状態であるか確認するために、質量分析およびN末端分析を行っている。その結果を踏まえて、分断したsRAGEの結晶化を今後検討する。また、β-amyloidやS100Aなどの異なるリガンドとの複合体についても結晶化を試みている。

  • Research Products

    (8 results)

All 2008 2007

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Refinement of comparative models of protein structure by using multicanonical molecular dynamics simulations2008

    • Author(s)
      Ishitani R, Terada T, & Shimizu K.
    • Journal Title

      Mol. Simul. In press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural insights into RNA-dependent eukaryal and archaeal selenocysteine formation2008

    • Author(s)
      Araiso Y, Palioura S, Ishitani R 他8名
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 36(4)

      Pages: 1187-1199

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the cytosolic domain of a cation diffusion facilitator family protein2007

    • Author(s)
      Hattori M, Tanaka Y, Ishitani R, Nureki O
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. F63

      Pages: 771-773

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the radical SAM enzyme catalyzing tricyclic modified base formation in tRNA2007

    • Author(s)
      (5名) Ishitani R, Nureki O
    • Journal Title

      J.Mbl. Biol. 372(5)

      Pages: 1204-1214

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the MgtE Mg^2+ transporter2007

    • Author(s)
      Hattori M, Tanaka Y Fukai S, Ishitani R, Nureki O
    • Journal Title

      Nature 448(7157)

      Pages: 1072-1075

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the full-length Mg^2+ transporter MgtE2007

    • Author(s)
      Hattori M, Tanaka Y, Fukai S, Ishitani R, Nureki O
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. F63

      Pages: 682-684

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the Sec4p.Sec2p complex in the nucleotide exchanging intermediate state2007

    • Author(s)
      Sato Y, Fukai S, Ishitani R, Nureki O
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci U S A 104(20)

      Pages: 8305-8310

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] マグネシウム輸送体MgtEの分子動力学シミュレーション2007

    • Author(s)
      石谷隆一郎,杉田有治,濡木理
    • Organizer
      生物物理学会第45回年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-21

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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