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2007 Fiscal Year Annual Research Report

イカロドプシンのX線結晶構造解析

Research Project

Project/Area Number 19770129
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

村上 緑  Nagoya University, 大学院・理学研究科, 助教 (20324387)

Keywordsロドプシン / X線結晶構造解析
Research Abstract

視物質ロドプシンは網膜視細胞に存在する光受容膜タンパク質で、G蛋白質共役型受容体(GPCR)のモデルタンパク質である。発色団レチナールが光を吸収するとロドプシン分子全体の構造変化が惹起され、細胞質側の結合部位に共役したG蛋白質へと光情報を受け渡す。本研究は、イカロドプシン結晶を用いてロドプシンが担うG蛋白質活性化の分子機構の全容を構造学、分光学の両面から解明することを目指している。本年度は、前年度に引き続き分解能の向上をはかり、ロドプシンの精製・結晶化条件の精密化を行い、その結果、十分に大きく、良質な結晶を得ることができた。この結晶をもちいて回折データセットを収集、構造解析を行い、最終的にはイカロドプシンの立体構造を2.5Å分解能で決定することに成功した。この構造から、1)GPCRの膜貫通領域はほぼ保存されていること、2)細胞質側のG蛋白質共役部位が堅いドメイン構造であること、3)9個の水分子クラスタが活性部位とG蛋白質共役部位を結ぶ水素結合網を形成し、細胞内シグナル伝達に寄与していること、4)発色団レチナールのプロトン化シッフ塩基とその対イオンGlu180は5Å離れていること、5)GPCRの生理的な二量体がヘリックス4と5を接合面として会合していること、6)細胞外側領域どうしの塩橋による相互作用が無脊椎動物の目が偏光を検出するのに寄与していること、が新たに明らかとなった。

  • Research Products

    (7 results)

All 2008 2007

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Crystallization and crystal properties of squid rhodopsin2007

    • Author(s)
      M. Murakami, R. Kitahara, T. Gotoh and T. Kouyama
    • Journal Title

      Acta Cryst. F63

      Pages: 475-279

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Crystal Structure of Squid Rhodopsin2008

    • Author(s)
      M. Murakami
    • Organizer
      Gordon Research Conference on "LIGAND RECOGNITION&MOLECULAR GATING"
    • Place of Presentation
      Ventura, CA, USA
    • Year and Date
      2008-03-06
  • [Presentation] スルメイカロドプシンのX線結晶構造解析2007

    • Author(s)
      村上緑、神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第45回年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] イカロドプシンの結晶構造2007

    • Author(s)
      村上緑、神山勉
    • Organizer
      日本結晶学会2007年度年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] Crystal Structure of Squid Rhodopsin2007

    • Author(s)
      M. Murakami and T. Kouyama
    • Organizer
      International Symposium on RETINAL PROTEINS: EXPERIMENTS AND THEORY
    • Place of Presentation
      Bremen, Germany
    • Year and Date
      2007-09-24
  • [Presentation] X-ray crystallographic study of squid rhodopsin2007

    • Author(s)
      M. Murakami and T. Kouyama
    • Organizer
      2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology 2007
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2007-09-10
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 特許権2008

    • Inventor(s)
      神山勉、村上緑
    • Industrial Property Rights Holder
      神山勉、村上緑
    • Industrial Property Number
      特許権、特願2008-58864
    • Filing Date
      2008-03-09

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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