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2008 Fiscal Year Annual Research Report

安定同位体標識技術を利用した糖鎖の精密構造解析法の開発

Research Project

Project/Area Number 19790039
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

山口 芳樹  The Institute of Physical and Chemical Research, 糖鎖構造生物学研究チーム, チームリーダー (90323451)

Keywords生物分子構造学 / 安定同位体標識
Research Abstract

これまで糖鎖水酸基の関与する水素結合の情報を抽出するために、13C-NMRを用いて糖鎖ヒドロキシルプロトンの溶媒との交換速度の算出方法を開発し、Lewis x糖鎖のヒドロキシルプロトンの水素結合形成にともなう交換速度の低下を観測することに成功してきた。今年度は、オリゴ糖鎖のみならずアミロースやべータグルカンなどの多糖に本方法を適用した。その結果、アミローズでは鎖長に依存せずにO3や水素結合形成が観測されたのに対して、ベータグルカンの場合では鎖長に依存してO2で水素結合の形成が観測されるようになった。これらの知見は多糖のヘリックス形成の構造基盤を明らかにする上で基礎的な知見となる。
また、前年度に引き続き13C標識を施した高分子量糖タンパク質糖鎖のNMRシグナルの帰属法として13C検出型のNMR測定を検討した。その結果、分子量5万程度の糖タンパク質に関しては、13C-TOCSYに比べて13C-NOESY計測の方が高感度にシグナルを検出できることが判明した。13C直接検出を利用した本帰属法はHCCH-COSY/TOCSYなどの1H検出型の帰属法と相補的であり、両方法を併用することにより高分子量糖タンパク質糖鎖のシグナルを効率的に帰属することが可能になると考えられる。

  • Research Products

    (13 results)

All 2009 2008

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (5 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] A ^<13>C-detection NMR approach for large glycoproteins2009

    • Author(s)
      Y. Yamaguchi
    • Journal Title

      Carbohydr. Res. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure of the putative 32 kDa myrosinase-binding protein from Arabidopsis (At3g16450.1) determined by SAIL-NMR2008

    • Author(s)
      M. Takeda
    • Journal Title

      FEBS J. 275

      Pages: 5873-5884

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development and application of stable-isotope-labeling methods orientied to structural glycobiology2008

    • Author(s)
      Y. Yamaguchi
    • Journal Title

      Trends Glycosci. Glycotechnol. 20

      Pages: 117-130

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development and application of high performance liquid chromatography map of glucuronyl N-glycans2008

    • Author(s)
      H. Yagi
    • Journal Title

      Open Glycoscience 1

      Pages: 8-18

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural and molecular basis for hyperspecificity of RNA aptamer to human immunoglobulin G2008

    • Author(s)
      S. Miyakawa
    • Journal Title

      RNA 14

      Pages: 1154-1163

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 920 MHz ultra-high, field NMR approaches to structural glycobiology2008

    • Author(s)
      K. Kato
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta. 1780

      Pages: 619-625

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 13C-NMRの同位体シフト効果を用いた糖類の水素結合観測への試み2009

    • Author(s)
      花島慎弥
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] StruGutural glycobiology for elucidating the function of glycoprpteins-a multifaceted approach2008

    • Author(s)
      Yoshiki Yamaguchi
    • Organizer
      International Symposium on Systems Glycobiology -A Bridge between Functional Glycomics and Chemical Biology-
    • Place of Presentation
      品川
    • Year and Date
      2008-12-05
  • [Presentation] 糖鎖の機能解明を目指した糖鎖構造生物学2008

    • Author(s)
      山口芳樹
    • Organizer
      第6回糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム-糖鎖研究と他領域との統合-
    • Place of Presentation
      品川
    • Year and Date
      2008-12-04
  • [Presentation] Development of an NMR Method for Structural Analysis of Oligosaccharides2008

    • Author(s)
      Yoshiki Yamaguchi
    • Organizer
      2008 Annual Meeting of the Society for Glycobiology
    • Place of Presentation
      テキサス
    • Year and Date
      2008-11-13
  • [Presentation] 糖鎖ヒドロキシルプロトンの交換速度を算出するためのNMR法の開発2008

    • Author(s)
      山口芳樹
    • Organizer
      第28回日本糖質学会年会
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      2008-08-19
  • [Book] Experimental Glycoscience Glycochemistry2008

    • Author(s)
      Y. Yamaguchi
    • Total Pages
      3
    • Publisher
      Springer Japan
  • [Book] Experimental Glycoscience Glycochemistry2008

    • Author(s)
      K. Kato
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      Springer Japan

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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