糖鎖プロセシング酵素を分子標的とした論理的・網羅的創薬探索

2009 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 19790102
• Research Institution: Nihon University
• Principal Investigator: 袴田 航 Nihon University, 生物資源科学部, 講師 (10333337)
• Keywords: 小胞体 / 翻訳後修飾 / ウイルス / in silico / スクリーニング

Research Abstract

本研究は、立体構造が明らかにされた糖鎖プロセシング酵素を分子標的として、市販化合物のライブラリ(約600万化合物ライブラリを入手済)に対して、コンピュータを用いたin silicoスクリーニングを行い、効率的にドラックライクな化合物を見いだすための研究である。
研究を効率的に進める為、医薬品や医薬品候補化合物のデータベースを用いたDrug-Like/Drugness/Drugabilityの解析と経験則のルール化を重要視したライブラリ(水素結合アクセプター数、水素結合ドナー数、分配係数、自由回転結合数、分子量等を考慮したライブラリ)を用い単なる阻害剤ではなくリード化合物として発展性が期待できる阻害剤を獲得する戦略を採用した。
昨年度に引き続き水年度は、立体構造が明らかにされた糖質加水分解酵素の構造を解析し、市販化合物のライブラリ(約600万化合物ライブラリ)に対して、in silicoスクリーニングを行って得だヒット化合物ライブラリを基にドッキングモード等を精査しよりクオリティーの高いライブラリを得る事ができ、ライブラリの濃縮に成功した。