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2008 Fiscal Year Annual Research Report

病原性薬剤耐性等の遺伝子の導入に対して細菌が備えるバリアーと細菌の生死

Research Project

Project/Area Number 19790316
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

半田 直史  The University of Tokyo, 大学院・新領域創成科学研究科, 特任助教 (00396855)

Keywords微生物ゲノム / 制限酵素 / DNA分解酵素 / 相同組換え / 病原細菌
Research Abstract

病原細菌の全ゲノム配列解読から、毒素薬剤耐性などの病原性因子がしばしば動く遺伝子に担われていることが明確になり、細菌感染の理解と制御には遺伝子の伝達過程の解明が不可欠であることが明らかになった。細菌自身が備える遺伝子導入を排除する機構として、細菌の世界に広く存在する制限修飾系がある。制限修飾系は自己の目印(メチル化)のないDNAを切断する。制限修飾系が細菌ゲノムを攻撃した際には、それを修復するのは外来遺伝子を排除する第2の機構であるゲノム維持ナノマシンである。この機能を担うDNA分解修復酵素は、自己ゲノムを認識して選択的に修復するしくみであり、病原遺伝子の有無とは別に病原細菌グループのゲノムレベルでのアイデンティティーを規定する。
I型の制限酵素は、特定のDNA塩基配列を認識しても、そこでDNAを切断しないでDNAを「たぐる」。そして、別の酵素分子に邂逅すると、そこでDNAを切断する。私たちは、この不思議な現象が正常なDNA複製をモニターし、異常があれば複製フォークを切断してゲノムの、あるいは細胞の生死をコントロールする事を示唆する実験結果を得た(nucleic Acids Res 印刷中)。II型制限酵素が、その遺伝子を失った細菌のゲノムを切断して殺してしまう「分離後宿主殺し」に関して、その細胞死への抵抗手段として、細菌から高等生物まで広く保存されているメディエーター組換え経路(RecF経路)が重要であることを示した(Microbiology 印刷中)。さらに、多くのタンパク質が同時に働くことが遺伝学的な解析から知られていた、この大腸菌のRecF経路が二本鎖DNA切断を修復する様子を観察することに、試験管内再構成実験で初めて成功した(Genes Dev 印刷中)。

  • Research Products

    (14 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (9 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Reconstitution of Initial Steps of Double-strand DNA Break Repair by the RecF pathway of E. coll2009

    • Author(s)
      Handa N, Morimatsu K, Lovett ST, Kowalczvkowski SC
    • Journal Title

      Genes Dev (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-molecule analysis of a red fluorescent RecA protein reveals adefect in nucleoprotein filament nucleation that relates to its reduc ed biological functions2009

    • Author(s)
      Handa N, Amitani I, Gumlaw N, Sandler SJ, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Contribution of RecFOR machinery of homologous recombination to cell survival after loss of a restriction-modification gene complex2009

    • Author(s)
      Handa N, Ichige A, Kobayashi I.
    • Journal Title

      Microbiology (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cleavage of a model DNA replication fork by a Type I restriction endonuclease2009

    • Author(s)
      Ishikawa K, Handa N, Kobayashi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] DNA複製フォークのI型制限酵素による切断2009

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-29
  • [Presentation] ゲノム中で自己増幅した制限修飾遺伝子とそれに連鎖した遺伝子の発現量の増加2008

    • Author(s)
      古田芳一、半田直史、Marat Sadykov、小林一三
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] Genomic ID sequence recognition by a genome maintenance enzyme2008

    • Author(s)
      半田直史
    • Organizer
      2^<nd> International Symposium on Bio-nanosystems
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20081031-1102
  • [Presentation] Cleavage of a DNA replication fork by a type I restriction enzyme2008

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      第6回3Rシンポジウム
    • Place of Presentation
      静岡県嬬恋
    • Year and Date
      20081027-30
  • [Presentation] Behavior of a RecBCD enzvme with/a RecB-RecD subunit fusion2008

    • Author(s)
      半田直史、Kowalczykowski, SC
    • Organizer
      第6回3Rシンポジウム
    • Place of Presentation
      静岡県嬬恋
    • Year and Date
      20081027-30
  • [Presentation] DNA複製と制限のカップリング : in vitroでの複製フォーク型DNAのI型制限酵素による切断2008

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      日本遺伝学会第80回大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20080903-05
  • [Presentation] 複製フォーク型DNAのI型制限酵素による切断2008

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      第5回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      静岡県藤枝市
    • Year and Date
      20080728-29
  • [Presentation] 大腸菌の相同組換え酵素のサブユニット構成を変えた時の振る舞い2008

    • Author(s)
      半田直史
    • Organizer
      第82回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20080312-14
  • [Presentation] 利己的制限修飾遺伝子間に起きる、ゲノム上のメチル化サイトの取り合いが、ホスト殺しをもたらす2008

    • Author(s)
      Marat Sadykov, 半田直史, 鶴剛史, 小林一三
    • Organizer
      日本進化学会2008年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-08-24
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/ikobaya/index_ja.html

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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