Genomic comparison of the O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia coli strains

2008 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19790325
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Bacteriology (including Mycology)
• Research Institution: University of Miyazaki
• Principal Investigator: IGUCHI Atsushi University of Miyazaki, フロンティア科学実験総合センター, 研究員 (00437948)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Keywords: 遺伝

Research Abstract

本研究では、O抗原コード領域とその周辺領域を株間で比較することにより、水平伝播領域の特定および入れ換わった領域の特徴を調べた。その結果、複数の大腸菌株でO抗原コード領域を含む大きな領域が水平伝播により入れ換わったことが明らかとなった。

Research Products

• [Journal Article] The complete genome sequence and com parative genome analysis of enteropathoge nic E (2009)
  • Author(s): Iguchi A, Thomson N R, Ogura Y, Saun ders D, Ooka T, Henderson I R, Harris D, Asadulghani M, Kurokawa K, Dean P Kenny B, Quail M A, Thurston S, Dou gan G, Hayashi T, Parkhill J, Frankel G
  • Journal Title: coli O127:H6 strain E2348/69 vol.191 Pages: 347-354
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The Emergence and Constrained Radiations of Escherichia coli O157 : A Precise Reconstruction (2009)
  • Author(s): Leopold R S, Magrini V, Holt J N, Shaikh N, Mardis R E, Cagno J, Ogura Y, Iguchi A, Hayashi T, Mellmann A, Karch H, Besser E T, Sawyer A S, Whittam S T, Tarr I P
  • Journal Title: PNAS vol.106 Pages: 8713-8718
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genomic comparison of the O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia coli O55 strains belonging to three distinct lineages (2008)
  • Author(s): Iguchi A, Ooka T, Ogura Y, Asadulghani, Nakayama K, Frankel G, Hayashi T
  • Journal Title: Microbiology vol.154 Pages: 559-570
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The defective prophage pool of Escherichia coli O157 : prophage-prophage interactions potentiate horizontal transfer of virulence determinants
  • Author(s): Asadulghani M, Ogura Y, Ooka T, Itoh T, Sawaguchi A, Iguchi A, Nakayama K,Hayashi T
  • Journal Title: PLoS Pathogen (in press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 腸管病原性大腸菌(EPEC)E2348/69株のゲノム解析 (2009)
  • Author(s): 井口純,他
  • Organizer: 第3回ゲノム微生物学会年会
  • Year and Date: 20090300
• [Presentation] The complete genome sequence and comparative genome analysis of EPEC O127 : H6 strain E2348/69 (2009)
  • Author(s): 井口純,他(ワークショップ)
  • Organizer: 第82回日本細菌学会総会
  • Year and Date: 20090300
• [Presentation] 大腸菌におけるO抗原をコードする領域の組換え過程の解析 (2008)
  • Author(s): 井口純,他
  • Organizer: 第2回ゲノム微生物学会年会
  • Year and Date: 20080300
• [Presentation] 大腸菌におけるO抗原をコードする領域の組換え過程 (2008)
  • Author(s): 井口純,他
  • Organizer: 第81回日本細菌学会総会
  • Year and Date: 20080300
• [Presentation] 大腸菌におけるO抗原合成遺伝子群を含む水平伝播領域の解析 (2007)
  • Author(s): 井口純,他
  • Organizer: 第11回腸管出血性大腸菌感染症シンポジウム
  • Year and Date: 20070800