2007 Fiscal Year Annual Research Report
術後再発症例に特異的発現パターンの同定と感受性予測を含む個別化診断手法の構築
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19790969
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
冨田 秀太 Nagoya University, 大学院・医学系研究科, 助教 (10372111)
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| Keywords | 肺癌 / マイクロアレイ / バイオインフォマティクス / オーダーメイド医療 / 予後予測 / 感受性予測 / 再発 |
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| Research Abstract |
近年の国民的な健康志向の高まりから喫煙率は低下の兆しを見せており、喫煙との関連が強い肺扁平上皮癌の将来的な減少傾向が想定されている。然しながら、我国の女性肺癌の大半は、生涯に渡る非喫煙者に生じた肺腺癌であり、さらには、我が国を含む多くの先進諸国において、喫煙との関連がほとんどない肺腺癌の相対的及び絶対的増加傾向が浮き彫りとされてきている。
研究代表者らは、肺腺癌の多様性に関するさらに深い知見を、"機能的に関連した一連の遺伝子セット=パスウェイ"を解析単位とする事によって明らかとした。すなわち、外科切除を受けた肺腺癌症例の「再発死亡群」と「外科切除による治癒群」の2群間で発現が異なる遺伝子が特徴付けるパスウェイについて、GSEA法を用いることにより、特徴的なパスウェイ群の抽出に成功した。さらに、培養細胞にFDA認可の化合物を加えた際に観察されたmRNA発現プロファイルの変化をデータベース化したConnectivity Mapを用いて、肺癌患者における「再発死亡群」類似のプロファイルから「外科切除による治癒群」類似のプロファイルに変化させ得る薬剤を探索した結果、我々がGSEA法を用いて抽出した"ターゲットパスウェイ"の阻害と抗腫瘍活性をもつ阻害剤が含まれていた。
以上の結果は、2つの全く独立したバイオインフォマティクス手法による網羅的発現解析データの活用が、作用点の一つとして同じ"ターゲットパスウェイ"の抽出に帰結した信頼性を示しており、今後このパスウェイを基にした感受性予測モデルの構築を進めていく。
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