2008 Fiscal Year Final Research Report

Dynamic Pathway Prediction by Signature Analysisusing Multiple Edge

Research Project

Project/Area Number	19800009
Research Category	Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
Allocation Type	Single-year Grants
Research Field	Bioinformatics/Life informatics
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	OHTA Yoshihiro The University of Tokyo, 先端科学技術研究センター, 特任研究員 (80436592)
Project Period (FY)	2007 – 2008
Keywords	マルチプルエッジ / シグネチャ解析
Research Abstract	生物系公開データベースと文献情報から時間的・空間的に関連の深いパスウェイを高精度に抽出する研究を行った。また、属性となる情報を取得し、関係の近いパスウェイをクラスタリングすることで、高精度で網羅性の高いシグネチャパスウェイ知識ベースの構築を可能とした。さらに、ここで構築された知識ベースを用いて、発現データを入力とし変動しているパスウェイを自動的に同定するための予測実験を行った。