Multi time scale simulation on chemical reactions by core excitations

2008 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19850027
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Physical chemistry
• Research Institution: Waseda University
• Principal Investigator: IMAMURA Yutaka Waseda University, 理工学術院, 助教 (60454063)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Keywords: 内殻励起 / CVR-B3LYP / 高速化 / エネルギー分割 / 時間発展

Research Abstract

内殻励起反応を効率的に取り扱うことが可能な計算手法CV-B3LYP汎関数と組み合わせた時間依存密度汎関数理論(TDDFT)の高速化に成功し、大規模なモデルでも内殻励起状態計算が可能となった。また、そのCV-B3LYPを生体分子シチジンに適用し、分子内の局所的情報の抽出に成功した。更に、内殻励起反応の追跡には必要不可欠なエネルギー移動の解析が可能な手法(エネルギー密度解析)の開発も行った。

Research Products

• [Journal Article] Density Functional Study on Core Ionization Spectra of Cytidine and Its Fragments (2009)
  • Author(s): A. Thompson, S. Saha, F. Wang, 土持崇嗣, 中田彩子, 今村穣, 中井浩巳
  • Journal Title: Bull. Chem. Soc. Jpn. vol.82 Pages: 187-195
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Application of the Sakurai-Sugiura Projection Method to Core-Excited-State Calculation by Time-Dependent Density Functional Theory (2008)
  • Author(s): 土持崇嗣, 小林正人, 中田彩子, 今村穣, 中井浩巳
  • Journal Title: J. Comput. Chem. vol.29 Pages: 2311-2316
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Natural Bond Orbital Based Energy Density Analysis for Correlated Methods: Second-Order Moller-Plesset and Coupled-Cluster Singles and Doubles (2008)
  • Author(s): 今村穣, 馬場健, 中井浩巳
  • Journal Title: Int. J. Quant. Chem. vol.108 Pages: 1316-1325
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Energy Density Analysis for Second-Order Moller-Plesset Perturbation Theory and Coupled-Cluster Theory with Singles and Doubles : Application to C_2H_4-CH_4 Complexes (2008)
  • Author(s): 今村穣, 中井浩巳
  • Journal Title: J. Comput. Chem. vol.29 Pages: 1555-1563
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] One-body Energy Decomposition Schemes Revisited : Assessment of Mulliken-, Grid-, and Conventional Energy Density Analyses
  • Author(s): 菊地那明, 今村穣, 中井浩巳
  • Journal Title: Int. J. Quant. Chem. (in press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] グリッドを用いたエネルギー密度解析手法の開発 (2008)
  • Author(s): 今村穣, 中井浩巳
  • Organizer: 「実在系の分子理論」成果報告会
  • Place of Presentation: 北海道(ポスター発表)
  • Year and Date: 2008-12-17
• [Presentation] 平面波基底におけるエネルギー密度解析 : PW-EDA (2008)
  • Author(s): 今村穣, 高橋明日香, 中井浩巳
  • Organizer: 日本コンピュータ化学会2008春季年会
  • Place of Presentation: 東京(口頭発表)
  • Year and Date: 2008-05-23
• [Presentation] 櫻井-杉浦法を用いたTDDFTによる内殻励起状態の高速計算 (2008)
  • Author(s): 小林正人, 土持崇嗣, 中田彩子, 今村穣, 中井浩巳
  • Organizer: 日本コンピュータ化学会2008春季年会
  • Place of Presentation: 東京(ポスター発表)
  • Year and Date: 2008-05-23
• [Book] エネルギー密度解析による表面モデルの検証および触媒作用の解明 (2008)
  • Author(s): 中井浩巳, 菊池那明, 今村穣
  • Total Pages: 601
  • Publisher: 触媒