2022 Fiscal Year Annual Research Report
Rapid pattern recognition of OncomiR by DNA computation
| Project/Area Number |
19H00901
|
|---|
| Research Institution | Tokyo University of Agriculture and Technology |
|---|
Principal Investigator |
川野 竜司 東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (90401702)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鈴木 宏明 中央大学, 理工学部, 教授 (20372427)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2023-03-31
|
| Keywords | DNAコンピューティング / ナノポア計測 / マイクロ流体技術 / リポソーム / コアセルベート |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究ではDNAコンピューティング技術とナノポア計測によるラベルフリーDNA分子検出法を組み合わせることにより、早期がん診断マーカーとして期待されるmicroRNA（miRNA）群のがんパターン診断法の構築をめざす。申請者はこれまで、ナノポア計測によるDNA演算出力分子の迅速検出、これを利用したmiRNA群のパターン診断への応用について研究してきた。最近我々が開発した胆管癌時に発現亢進する5種miRNAパターン認識法が、実際のがん患者の血液検体にも適用可能であることを見出したが、これまでナノポア計測では計測不可能であった超低濃度領域（~fM）のmiRNAを検出している理由が不明であった。そこで昨年度からこの機構解明に向け取り組みを行い、さらにmiRNA発現上昇と減少を同時に判定可能なＤＮＡ演算方法の開発に取り組み、扁平上皮癌の診断へ応用した。
分担者の鈴木は、別のアプローチからの診断の高感度化を見据え、リポソーム内核酸増幅法の確立に取り組み、基礎条件を確立した（論文執筆中）。また、定量解析に向けてマイクロ流路を用いて製造した均一リポソーム内で生化学反応を行う条件も確立した（論文投稿中）。並行して、複合コアセルベートを、サンプル中に低濃度で存在する核酸を高濃縮して検出する課題に取り組み、一定の条件を確立した。今年度はこれらに関連する成果に関して、JACS Auを含む査読付き論文、および国内外の複数の学会において公表した。
|
| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
|
