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2022 Fiscal Year Annual Research Report

大腸菌宿主翻訳機能の革新技術開発

Research Project

Project/Area Number 19H00936
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

宮崎 健太郎  大阪大学, 生物工学国際交流センター, 特任教授(常勤) (60344123)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Keywordsホーミングエンドヌクレアーゼ / リボソーム / イントロン
Outline of Annual Research Achievements

昨年度までに獲得した異種23S rRNA遺伝子にRhodothermus marinus由来のホーミングエンドヌクレアーゼを含むイントロンを挿入した際、期待したプロセッシングを受けなかったため、改めて新規な異種23S rRNA遺伝子のスクリーニングを行った。高温環境などを含めた多様な環境より23S rRNA遺伝子をPCR増幅し、生育相補スクリーニングを行い、集積培養を行い、変異株ライブラリーを構築した。
当該23S rRNAに対し、ホーミングエンドヌクレアーゼを含むイントロンを23S rRNA遺伝子配列中に組み込んだ。ホーミングエンドヌクレアーゼの挿入部位は配列保存性が高く、ライブラリー全体としても正しくプロセッシングを受ければ機能を損なうことがないと考えられる。しかし結果としては、ライブラリーに含まれる23S rRNAの融合遺伝子でリボソームオペロン完全欠失株を機能相補することはできなかった。
以前の結果同様、好熱菌由来のホーミングエンドヌクレアーゼが宿主内で十分な活性を示さないためであると推測された。ホーミングエンドヌクレアーゼや23S rRNAのランダム変異導入なども試みたが、生育相補可能な変異体は得られなかった。
大腸菌23S rRNA遺伝子に組み込んだ場合については、些細な実験条件の違いで相補が見られる場合とそうでない場合があり、安定した機能を再現させることが困難であった。
一方、大腸菌内で発現したホーミングエンドヌクレアーゼについては性状解析を行い、論文化を進めた。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (3 results)

All 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results)

  • [Journal Article] Genetic Perturbation Alters Functional Substates in Alkaline Phosphatase2023

    • Author(s)
      Sakuma Morito、Honda Shingo、Ueno Hiroshi、Tabata Kazuhito V.、Miyazaki Kentaro、Tokuriki Nobuhiko、Noji Hiroyuki
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 145 Pages: 2806~2814

    • DOI

      10.1021/jacs.2c06693

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Complete Genome Sequences of Four Parageobacillus Strains Isolated from Soil in Japan2022

    • Author(s)
      Miyazaki Kentaro、Hosoya Kae
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11 Pages: e00204-22

    • DOI

      10.1128/mra.00204-22

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Complete Genome Sequences of Thermus Strains Isolated from Senami Hot Spring in Japan2022

    • Author(s)
      Miyazaki Kentaro
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11 Pages: e00354-22

    • DOI

      10.1128/mra.00354-22

    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2023-12-25  

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