2021 Fiscal Year Annual Research Report
Genetic basis for variation in the ability to colonize new niches
| Project/Area Number |
19H01003
|
|---|
| Research Institution | National Institute of Genetics |
|---|
Principal Investigator |
北野 潤 国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 教授 (80346105)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
石川 麻乃 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (20722101)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
|
| Keywords | 種分化 / クロマチン / 適応進化 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本課題では、淡水環境への適応に重要な遺伝子を同定し、当該遺伝子座におけるクロマチン構造上の特徴を見出すことである。本年度は、淡水進出の鍵となる遺伝子について、機能解析のためにノックアウトを実施した。その結果、淡水進出に際して変化する多数の形質（体サイズ、繁殖時期、ホルモン量など）を同時に変える鍵遺伝子であることを明らかにした。この遺伝子の適応度への影響を解析するために、海型と淡水型のF2雑種を作出し、メソコスムに放流し、メソコスムにおける適応度を解析しRAD-seq（Restriction Site Associated DNA Sequence）にてジェノタイピングを実施した。また、さまざまなエコタイプについて、ATACシークエンス（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing）と修飾ヒストン抗体てCUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）-シークエンスを実施した。その結果、エコタイプ間で上記の遺伝子を含むいくつかの領域でクマチン状態が異なることを見出した。また、エコタイプ間でのクロマチンの違いを生み出す遺伝基盤を解明するために、QTL（Quantitative Trait Loci：量的形質遺伝子座）解析を実施した。これらデータをまとめて論文化にもっていける状態になった。
|
| Research Progress Status |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
|
