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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Development of material for electron microscopy analysis using protein complex with huge internal space

Research Project

Project/Area Number 19H02519
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

田中 良和  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (20374225)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松井 崇  北里大学, 理学部, 講師 (30463582)
安部 聡  東京工業大学, 生命理工学院, 助教 (40508595)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywordsヘモシアニン / 構造解析
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、クライオ電子顕微鏡を用いた構造解析のホストとして優れた特性(ゲストタンパク質を包摂でき、特徴的な構造の巨大分子であり、解析のノウハウが蓄積している)を有するヘモシアニンを用いて、分子量の小さなタンパク質の構造もクライオ電顕で決定できる手法を開発することを目指す。2019年度は、まず、ヘモシアニン内部に存在するフリーのシステイン残基(Cys3246)を利用して、Cys-マレイミドによる架橋反応によりゲストタンパク質を包摂する手法を検討した。マレイミド基とNTA基をリンカーで結合した分子をヘモシアニンと反応させることにより、Cys3246にNTA基を結合させることができた。NTA基はタンパク質精製に広く用いられているHis6タグと結合する性質を有するため、これを介して種々のHisタグ融合タンパク質をヘモシアニン内部に結合させることができる。NTA基が結合したヘモシアニンにHisタグ融合GFPを添加してゲルろかしたところ、ヘモシアニンの溶出位置にGFP由来の蛍光が観察されたことから、NTA-Hisタグ相互作用によりヘモシアニン内部にゲストタンパク質を包摂できることが明らかになった。同様の手法により、ビオチンーアビジン相互作用を用いても、ヘモシアニン内部にゲストタンパク質を包摂できることが明らかになった(Hashimoto et al., BBRC 51, 31-36 (2019))。一方で、ゲストの結合によりヘモシアニンが解離することや、包摂効率が低いことも明らかになり、これらは解決すべき課題である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究の最初の重要なステップである、ヘモシアニンへのゲスト分子への包摂の手法を複数構築できたことは大きな進捗である。

Strategy for Future Research Activity

ゲストタンパク質を包摂させたヘモシアニンを電子顕微鏡で観察したところ、種々の化学反応によりヘモシアニンが解離することがわかってきた。また、ゲストの包摂効率が低いことも明らかになってきた。目的の実現には、これらの課題を解決する必要がある。今後は、反応条件を変えるなどしてゲストの包摂効率を改善する手法を検討するとともに、ネガティブ染色法でも結合が確認できるゲスト分子を用いて実験し、ゲストの結合に関する知見を得る。

  • Research Products

    (6 results)

All 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Protein encapsulation in the hollow space of hemocyanin crystals containing a covalently conjugated ligand2019

    • Author(s)
      Hashimoto Tsubasa、Ye Yuxin、Ui Mihoko、Ogawa Tomohisa、Matsui Takashi、Tanaka Yoshikazu
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 514 Pages: 31~36

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.04.062

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the catalytic unit of GH 87-type α-1,3-glucanase Agl-KA from Bacillus circulans2019

    • Author(s)
      Yano Shigekazu、Suyotha Wasana、Oguro Natsuki、Matsui Takashi、Shiga Shota、Itoh Takafumi、Hibi Takao、Tanaka Yoshikazu、Wakayama Mamoru、Makabe Koki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 15295~15295

    • DOI

      10.1038/s41598-019-51822-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 巨大タンパク質会合体ヘモシアニンの構造解析 ―結晶構造と電顕構造―2019

    • Author(s)
      田中良和
    • Organizer
      2019年度 日本生化学会九州支部例会
    • Invited
  • [Presentation] X線結晶構造解析とクライオ電子顕微鏡の相関構造解析の有用性ーヘモシアニンを例としてー2019

    • Author(s)
      田中良和
    • Organizer
      日本蛋白質科学会 ランチョンセミナー
    • Invited
  • [Presentation] Structure analysis of squid hemocyanin using both X-ray crystallography and cryo-EM2019

    • Author(s)
      田中良和,松井崇,Stefan Raunser,Gatsogiannis Christos
    • Organizer
      化学系学協会東北大会
    • Invited
  • [Presentation] tRNA thiolation mechanism involving [4Fe-4S] cluster2019

    • Author(s)
      Yoshikazu Tanaka
    • Organizer
      International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-12-27  

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