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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Development of Functional Protein Nanobuilding Block Complexes and their Applications

Research Project

Project/Area Number 19H02522
Research InstitutionShinshu University

Principal Investigator

新井 亮一  信州大学, 学術研究院繊維学系, 准教授 (50344023)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 川上 了史  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (60566800)
宮田 健  鹿児島大学, 農水産獣医学域農学系, 准教授 (20448591)
迫野 昌文  富山大学, 学術研究部工学系, 准教授 (50391959)
舘野 浩章  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究グループ長 (30450670)
浅野 竜太郎  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (80323103)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywordsタンパク質ナノブロック / 人工タンパク質デザイン / タンパク質工学 / タンパク質複合体 / 立体構造解析 / 自己組織化 / タンパク質修飾 / 融合タンパク質
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、人工タンパク質ナノブロックへの機能性の付与や応用展開を目指し、機能性タンパク質ナノブロック複合体を創製する基盤的プロセス技術を開発することである。そこで、各研究分担者と緊密に共同研究を進めながら、主に、①タンパク質ナノブロック複合体の立体構造解析、②新型タンパク質ナノブロックの設計開発、③機能性タンパク質ナノブロック複合体作製技術の開発、④レクチンナノブロックの創製・応用展開などに取り組んだ。
①では、クライオ電子顕微鏡を用いて、人工タンパク質ナノブロック複合体の構造解析に成功した。特にTIP60は非常に対称性の高い正二十面体型60量体構造(PDB: 7EQ9)を形成していることを解明した(Chem Commun 2021)。
②では、得られた構造を基にして、研究分担者の川上らを中心として金属イオン誘導型TIP60 (mTIP60)を設計開発し、クライオ電子顕微鏡や小角X線散乱法(SAXS)等によりアルカリ土類金属イオン依存的な複合体形成を明らかにした(JACS 2023)。
③では、ペプチド転移酵素Sortase Aを利用してタンパク質ナノブロックに蛍光タンパク質を付加し、さらにSpyTag/SpyCatcherシステムにより抗体とも連結することにも成功した。
④では、新たなタンパク質ナノブロックとして、糖鎖結合レクチンと融合したレクチンナノブロックを構築し、小角X線散乱や光散乱解析等によって多様な複合体形成を明らかにした。さらに、結合能を測定したところ、大きな複合体ほど多価結合効果により親和性(avidity)が向上することを明らかにした(Int J Mol Sci 2022)。
さらに、研究分担者の迫野らを中心として、ペプチド転移酵素のトランスグルタミナーゼやSortase Aを利用して、アミロイド線維複合体に酵素等の機能分子を簡便に導入する手法の開発にも成功した(J Biosci Bioeng 2023; Chem Lett 2023)。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (21 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 2 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Princeton University/University of Washington(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Princeton University/University of Washington
  • [Journal Article] Reversible Assembly of an Artificial Protein Nanocage Using Alkaline Earth Metal Ions2023

    • Author(s)
      Ohara Naoya、Kawakami Norifumi、Arai Ryoichi、Adachi Naruhiko、Moriya Toshio、Kawasaki Masato、Miyamoto Kenji
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 145 Pages: 216~223

    • DOI

      10.1021/jacs.2c09537

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] One-pot synthesis of fibrillar-shaped functional nanomaterial using microbial transglutaminase2023

    • Author(s)
      Sakono Masafumi、Nakamura Mitsuki、Ohshima Tatsuki、Miyakoshi Ayano、Arai Ryoichi、Minamihata Kosuke、Kamiya Noriho
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2023.03.015

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enzymatic fabrication of multifunctional amyloid-based protein assembly2023

    • Author(s)
      Mitsuki Nakamura, Ryoichi Arai, Noriho Kamiya, Masafumi Sakono
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1246/cl.230156

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Self-Assembling Lectin Nano-Block Oligomers Enhance Binding Avidity to Glycans2022

    • Author(s)
      Irumagawa Shin、Hiemori Keiko、Saito Sayoko、Tateno Hiroaki、Arai Ryoichi
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 23 Pages: 676

    • DOI

      10.3390/ijms23020676

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Production of pentaglycine-fused proteins using Escherichia coli expression system without in vitro peptidase treatment2022

    • Author(s)
      Sakono Masafumi、Oshima Tatsuki、Iwakawa Takako、Arai Ryoichi
    • Journal Title

      Protein Expression and Purification

      Volume: 194 Pages: 106068~106068

    • DOI

      10.1016/j.pep.2022.106068

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rational thermostabilisation of four-helix bundle dimeric de novo proteins2021

    • Author(s)
      Irumagawa Shin、Kobayashi Kaito、Saito Yutaka、Miyata Takeshi、Umetsu Mitsuo、Kameda Tomoshi、Arai Ryoichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: 7526

    • DOI

      10.1038/s41598-021-86952-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Icosahedral 60-meric porous structure of designed supramolecular protein nanoparticle TIP602021

    • Author(s)
      Obata Junya、Kawakami Norifumi、Tsutsumi Akihisa、Nasu Erika、Miyamoto Kenji、Kikkawa Masahide、Arai Ryoichi
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 57 Pages: 10226~10229

    • DOI

      10.1039/D1CC03114G

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 新規人工酵素Syn-F4エンテロバクチンエステラーゼのX線結晶構造解析2022

    • Author(s)
      栗原航大, 梅澤公二, Ann E. Donnelly, Michael H. Hecht, 新井亮一
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] イソペプチド結合タグを用いた多価抗体タンパク質ナノブロック複合体の開発2022

    • Author(s)
      髙橋五月, 浅野竜太郎, 山本雷蔵, 迫野昌文, 新井亮一
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 多価レクチンナノブロックWA20-ACG複合体の開発2021

    • Author(s)
      入間川 伸,舘野 浩章,新井 亮一
    • Organizer
      第21回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] 三量体レクチンを用いた蛋白質ナノブロックの自己組織化超分子複合体の創製2021

    • Author(s)
      貝川 はるか,舘野 浩章,新井 亮一
    • Organizer
      第21回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] Barium ion responsive reversible assembly of protein supramolecule TIP602021

    • Author(s)
      大原 直也,川上 了史,新井 亮一,宮本 憲二
    • Organizer
      第21回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] 蛋白質ナノブロックによる機能性人工蛋白質複合体の創製に向けて2021

    • Author(s)
      新井 亮一
    • Organizer
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Icosahedral 60-meric porous structure of designed protein nanoparticle TIP602021

    • Author(s)
      Ryoichi Arai, Norifumi Kawakami, Junya Obata, Akihisa Tsutsumi, Kenji Miyamoto, Masahide Kikkawa
    • Organizer
      The Protein Society, the 36th Annual Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Self-assembling lectin nano-building blocks enhance avidity to glycans through polyvalent effect2021

    • Author(s)
      Shin Irumagawa, Hiroaki Tateno, Ryoichi Arai
    • Organizer
      The Protein Society, the 36th Annual Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Self-assembling functional complexes of protein nanobuilding blocks with a trimeric lectin2021

    • Author(s)
      Haruka Kaigawa, Hiroaki Tateno, Ryoichi Arai
    • Organizer
      The Protein Society, the 36th Annual Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Icosahedral 60-meric porous structure of designed supramolecular protein nanoparticle TIP602021

    • Author(s)
      Junya Obata, Norifumi Kawakami, Akihisa Tsutsumi, Erika Nasu, Kenji Miyamoto, Masahide Kikkawa, Ryoichi Arai
    • Organizer
      PDB 50th Anniversary Symposium in Asia
    • Int'l Joint Research
  • [Book] クライオ電子顕微鏡ハンドブック(第4章第6節 人工設計タンパク質ナノ粒子TIP60の立体構造解析)2023

    • Author(s)
      新井亮一,川上了史,小幡隼也,包明久,那須英里圭,宮本憲二,吉川雅英(難波 啓一、加藤 貴之、牧野 文信 監修)
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      978-4-86043-804-3
  • [Remarks] 信州大学 新井亮一研究室

    • URL

      http://fiber.shinshu-u.ac.jp/arai/index.html

  • [Remarks] 信州大学 研究者総覧 新井亮一

    • URL

      http://soar-rd.shinshu-u.ac.jp/profile/ja.OVkUjFkV.html

URL: 

Published: 2023-12-25  

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