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2021 Fiscal Year Annual Research Report

次世代のコバレントドラッグ創薬を志向した反応基の開発とプロテオミクス研究

Research Project

Project/Area Number 19H02854
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

進藤 直哉  九州大学, 薬学研究院, 助教 (20722490)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywordsコバレントドラッグ / ビシクロブタン / 分子ひずみ / チロシンキナーゼ / BTK / システイン / ABPP / ケミカルプロテオミクス
Outline of Annual Research Achievements

コバレントドラッグは求電子的反応基を持ち、標的タンパク質と共有結合して不可逆的に機能を阻害する。強く持続的な薬効などの利点を有する一方、標的以外のオフターゲットとの非特異反応は毒性につながる懸念がある。近年では標的選択的に反応するようデザインされたTargeted covalent inhibitor (TCI)の開発が盛んであり、システイン指向反応基としてアクリルアミドが汎用されている。しかし、アクリルアミド型TCIは分子構造によっては時間・濃度依存的な非特異反応を起こすことから、より高度な標的選択性を実現する新たな反応基が求められている。申請者は以前、アクリルアミドと比べ穏やかな反応性のクロロフルオロアセタミド基(CFA)を見出し、不可逆的チロシンキナーゼ阻害剤に応用した。
本研究では新たなシステイン指向反応基として、大きなひずみエネルギーを持つビシクロブタン環に着目した。種々ビシクロブタン誘導体を合成し、GSHや生細胞プロテオームに対する反応性を評価した結果、ビシクロブタンカルボン酸アミド(BCBアミド)がCFAと同等の穏やかな反応性を示すことを明らかにした。応用として、チロシンキナーゼであるBTKのコバレントプローブを開発した。アクリルアミド型の既承認薬イブルチニブの構造を鋳型に、アルキンとBCBアミドを導入したプローブを種々合成し、Ramos細胞中のBTKの蛍光ラベル化を検討した結果、アクリルアミド型プローブと同等のBTK反応効率と、高濃度でも高い選択性を示す化合物を創出した。さらに、同一のBTKリガンドに異なる反応基(アクリルアミド、CFA、BCBアミド)を導入したプローブでケミカルプロテオミクスを検討した。BTKはいずれのプローブでも検出されたのに対し、オフターゲットプロファイルは反応基によって異なり、各反応基にタンパク質の「好み」があることが示唆された。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Selective covalent targeting of SARS-CoV-2 main protease by enantiopure chlorofluoroacetamide2022

    • Author(s)
      Daiki Yamane, Satsuki Onitsuka, Suyong Re, Hikaru Isogai, Rui Hamada, Tadanari Hiramoto, Eiji Kawanishi, Kenji Mizuguchi, Naoya Shindo*, Akio Ojida*
    • Journal Title

      Chemical Science

      Volume: 13 Pages: 3027-3034

    • DOI

      10.1039/D1SC06596C

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Recent progress in covalent warheads for in vivo targeting of endogenous proteins2021

    • Author(s)
      Naoya Shindo, Akio Ojida*
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: 47 Pages: 116386

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2021.116386

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] コバレントドラッグ創薬を志向したシステインの可逆的共有結合修飾化学2022

    • Author(s)
      進藤直哉
    • Organizer
      第3回モダリティ創薬デザイン研究会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 光学活性なCFA基を有するSARS-CoV-2メインプロテアーゼ阻害剤の開発2022

    • Author(s)
      山根太輝, 進藤直哉, 鬼塚さつき, 李 秀栄, 水口賢司, 川西英治, 王子田彰夫
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
  • [Presentation] Lys残基を標的とした可逆的なコバレントドラッグの開発2022

    • Author(s)
      廣瀬侑也, 徳永啓佑, 田中雄大, 進藤直哉, 王子田彰夫
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
  • [Presentation] ひずみ解消型求電子的官能基の不可逆阻害剤への応用2021

    • Author(s)
      徳永啓佑, 進藤直哉, 佐藤磨美, 桑田啓子, 王子田彰夫
    • Organizer
      万有福岡シンポジウム第14回 三地区若手交歓会
  • [Presentation] ひずみ解消型反応基の不可逆阻害剤への応用とその標的選択性評価2021

    • Author(s)
      徳永啓佑, 進藤直哉, 佐藤磨美, 桑田啓子, 王子田彰夫
    • Organizer
      生体機能関連化学部会 若手の会 第32回サマースクール
  • [Presentation] CFA基を用いたSARS-CoV-2メインプロテアーゼ阻害剤の開発2021

    • Author(s)
      山根太輝,進藤直哉,鬼塚さつき,李秀栄,水口賢司,川西英治,王子田彰夫
    • Organizer
      第38回日本薬学会九州山口支部大会
  • [Presentation] Covalent Targeting of SARS-CoV-2 Main Protease with Chlorofluoroacetamides2021

    • Author(s)
      Naoya Shindo, Daiki Yamane, Satsuki Onitsuka, Suyong Re, Kenji Mizuguchi, Eiji Kawanishi, Akio Ojida
    • Organizer
      AFMC International Medicinal Chemistry Symposium 2021
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2022-12-28  

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