2020 Fiscal Year Annual Research Report
Regulation of virulence-related gene expression by Gas/Rsm-mediated quorum sensing in plant pathogenic bacteria
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19H02956
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| Research Institution | Okayama University |
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Principal Investigator |
一瀬 勇規 岡山大学, 環境生命科学学域, 教授 (50213004)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
松井 英譲 岡山大学, 環境生命科学学域, 准教授 (20598833)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 菌体密度感知機構 / ２成分制御系 / 非コードRNA / 翻訳制御 / 運動能 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究におけるモデル病原細菌Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000にはrsmX遺伝子が5つある(rsmX1 - rsmX5)。まずrsmX1, rsmX2, rsmX5の単独欠損株並びにrsmX3, rsmX4はタンデム に並んでいたためそれらの2重欠損株を作出した。相同組換えによる欠損変異株の作出に当たっては、rsmX遺伝子の近傍にトランスポゾン様配列が存在している場合があり、特異的な相同組換えが困難と思われた。そのような場合には、トランスポゾン様配列も欠損させ、相同組換えの特異性を高めた。これら欠損変異株のswarming運動能を解析したが、変異株のswarming運動能は野生株(WT)とほぼ同様であった。５つあるrsmX遺伝子は相加的に働いている可能性が推察されるため、多重変異株を作出することにした。また、rsmXが捕捉するRNA結合タンパク質RsmAについては、rsmA1からrsmA5まで存在するが、それらの遺伝子をクローニングし、アミノ末端に3×FLAG配列を導入した変異株を作出した。これらの遺伝子を有する菌株を高菌体密度と低菌体密度で培養し、RsmAが結合するRNAを同定する準備を進めた。抗FLAG抗体を用いた UV-crosslinking immunoprecipitation and sequencing (CLIP-seq)法でcDNAを生成し、シークエンス解析を行う予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
欠損変異株の作出に欠損予定の遺伝子の近傍にトランスポゾン配列が存在し、標的遺伝子の相同組替えが困難であったため。また、多重変異株を作出する必要性が生じたため。
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| Strategy for Future Research Activity |
多重変異株の作出をまず第一に研究を進める。
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Research Products
(11 results)
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[Journal Article] PsyR, a transcriptional regulator in quorum sensing system, binds lux box-like sequence in psyI promoter without AHL quorum sensing molecule and activates psyI transcription with AHL in Pseudomonas syringae pv. tabaci 6605.2020
Author(s)
Ichinose, Y., Tasaka, Y., Yamamoto, S., Inoue, Y., Takata, M., Nakatsu, Y., Taguchi, F., Yamamoto, M., Toyoda, K., Noutoshi, Y. and Matsui, H.
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Journal Title
Journal of General Plant Pathology
Volume: 86
Pages: 124-133
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Role of two sets of RND-type multidrug efflux pump transporter genes, mexAB-oprM and mexEF-oprN, in virulence of Pseudomonas syringae pv. tabaci 6605.2020
Author(s)
Ichinose, Y., Nishimura, T., Harada, M., Kishiwagi, R., Yamamoto, M., Noutoshi, Y., Toyoda, K., Taguchi, F., Takemoto, D., Matsui, H.
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Journal Title
Plant Pathology Journal
Volume: 36
Pages: 148-156
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Requirement of γ-aminobutyric acid chemotaxis for virulence of Pseudomonas syringae pv. tabaci 6605.2020
Author(s)
Tumewu, S. A., Matsui, H., Yamamoto, M., Noutoshi, Y., Toyoda, K., Ichinose, Y.
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Journal Title
Microbes and Environments
Volume: 35
Pages: ME20114
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Identification of chemoreceptors for amino acids in Pseudomonas syringae pv. tabaci 6605 that involve in host plant infection2021
Author(s)
Tumewu, S.A., Matsui, H., Yamamoto, M., Noutoshi, Y., Toyoda, K., and Ichinose, Y.
Organizer
令和3年度日本植物病理学会大会
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