2021 Fiscal Year Annual Research Report
Regulation of virulence-related gene expression by Gas/Rsm-mediated quorum sensing in plant pathogenic bacteria
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19H02956
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| Research Institution | Okayama University |
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Principal Investigator |
一瀬 勇規 岡山大学, 環境生命科学学域, 教授 (50213004)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
松井 英譲 岡山大学, 環境生命科学学域, 准教授 (20598833)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 菌体密度感知機構 / ２成分制御系 / 非コードRNA / 翻訳制御 / 運動能 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000にはrsmX遺伝子が５つある（rsmX1 - rsmX5）。まずrsmX1, rsmX2, rsmX5の単独欠損株並びにrsmX3, rsmX4はタンデムに並んでいたためそれらの２重欠損株を作出した。これら欠損変異株のswarming運動能は野生株(WT)とほぼ同様であった。そのため多重遺伝子の欠損変異株、rsmX15、rsmX1345、rsmX12345を作出した。これらのうちrsmX1345とrsmX12345は、軟寒天培地におけるswarming運動能が顕著に低下した。また、遺伝子発現様式を網羅的に解析するため、貧栄養培地で培養した菌体よりRNAを精製し、マイクロアレイ解析を行なった。但し、解析当時にはrsmX12345の５重変異株は未作出だったので、WT、rsmX15、rsmX34の２重変異株、rsmX1345の４重変異株について解析を行なった。その結果、４重変異株において特にWTとの間に遺伝子発現が異なっており、3型分泌システム関連遺伝子やべん毛関連遺伝子の発現が低下した。接種試験の結果、５重変異株の非宿主植物であるベンサミアーナタバコに対するHR誘導能は野生株より若干低下したが、宿主植物であるシロイヌナズナに対する病原力解析では安定的なデータが得られておらず、更なる解析が必要である。RsmAが結合するRNAの同定を試みた。5つのRsmA遺伝子のうちメジャー遺伝子と報告があるRsmA2のN末に3×FLAG配列を導入した菌株を作出し、抗FLAG抗体を用いたUV-crosslinking immunoprecipitation and sequencing (CLIP-seq)法でcDNAを生成し、シークエンス解析を試みたが、DNAの量と質の不足により解析不可能であった。
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| Research Progress Status |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Identification of aerotaxis receptor proteins involved in host plant infection by Pseudomonas syringae pv. tabaci 6605.2022
Author(s)
Tumewu, S. A., F., Matsui, H., Yamamoto, M., Noutoshi, Y., Toyoda, K., Ichinose, Y.
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Journal Title
Microbes and Environments
Volume: 37
Pages: ME21076
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] HopAZ1, a type-III effector of Pseudomonas amygdali pv. tabaci, induces a hypersensitive response in tobacco wildfire-resistant Nicotiana tabacum cv. N509.2022
Author(s)
Kashihara, S., Nishimura, T., Noutoshi, Y., Yamamoto, M., Toyoda, K., Ichinose, Y. and Matsui, H.
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Journal Title
Molecular Plant Pathology
Volume: 未定
Pages: 未定
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Complete genome sequence of Pseudomonas amygdali pv. tabaci strain 6605, a causal agent of tobacco wildfire disease.2021
Author(s)
Matsui, H., Nishimura, T., Asai, S., Masuda, S., Shirasu, K., Yamamoto, M., Noutoshi, Y., Toyoda, K. and Ichinose, Y.
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Journal Title
Microbiology Resource Announcement
Volume: 10
Pages: e00405-21
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] HopH1 effectors of Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 and pv. syringae B728a induce HR cell death in nonhost eggplant Solanum torvum.2021
Author(s)
Nahar, K., Mukaihara, T., Taguchi, F., Matsui, H., Yamamoto, M., Toyoda, K., Noutoshi, Y., Shiraishi, T., Ichinose, Y.
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Journal Title
Journal of General Plant Pathology
Volume: 87
Pages: 24-29.
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Vfr targets promoter of genes encoding methyl-accepting chemotaxis protein in Pseudomonas syringae pv. tabaci 6605.2021
Author(s)
Ogura, K., Matsui, H., Yamamoto, M., Noutoshi, Y., Toyoda, K., Taguchi, F. and Ichinose, Y.
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Journal Title
Biochemistry and Biophysics Reports
Volume: 26
Pages: 100944
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Cluster II che genes of Pseudomonas syringae pv. tabaci 6605, orthologs of cluster I in Pseudomonas aeruginosa, are required for chemotaxis and virulence.2021
Author(s)
Tumewu, S. A., Ogawa, Y., Okamoto, T., Sugihara, Y., Yamada, H., Taguchi, F., Matsui, H., Yamamoto, M., Noutoshi, Y., Toyoda, K. and Ichinose, Y.
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Journal Title
Molecular Genetics and Genomics
Volume: 296
Pages: 299-312.
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Identification of chemoreceptor proteins for amino acids involved in host plant infection in Pseudomonas syringae pv. tabaci 6605.2021
Author(s)
Tumewu, S. A., Matsui, H., Yamamoto, M., Noutoshi, Y., Toyoda, K., Ichinose, Y.
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Journal Title
Microbiological Research
Volume: 253
Pages: 126869
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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