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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Understanding of wood decay phenomena and construction of biomass conversion system using genome editing technology of mushroom

Research Project

Project/Area Number 19H03013
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

五十嵐 圭日子  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (80345181)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 飛松 裕基  京都大学, 生存圏研究所, 准教授 (20734221)
高畠 幸司  琉球大学, 農学部, 教授 (50446621)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywords木材腐朽菌 / ゲノム編集 / バイオマス変換 / バイオエコノミー
Outline of Annual Research Achievements

きのこの多くは、木材を栄養源として生育する木材腐朽菌である。我々は既にきのこが作る子実体を食品や薬として古来から利用しているが、きのこの木材分解メカニズムや子実体形成メカニズムには依然として不明な点が多い。本研究の目的は、ゲノム編集技術を利用して木材腐朽現象を理解し、「きのこはどのように木材を分解しているのか」を明らかにするとともに、新しいバイオマス変換系の構築に応用することである。
白色木材腐朽菌Phanerochaete chrysosporiumでは、形質転換条件の検討を行い、安定形質転換体を取得し、ゲノム編集実験系を確立することに努めたが、やはり抗生物質耐性が高く、現在用いている抗生物質ハイグロマイシンBは選抜に高濃度が必要であった。そこで、他の生物種でも用いられている抗生物質(Zeocin、G418、Blastcidin、Puromycin、Carboxin)を試したところ、Carboxinのみが100μg/mLの濃度でP. chrysosporiumの成長を阻害できることが明らかとなった。さらに今回テストした担子菌ウシグソヒトヨタケ(Coprinopsis cinerea)、キチリメンタケ(Gloeophyllum trabeum)Postia placentaの成長も同様に100μg/mL以下の濃度で阻害できることが明らかとなった。
さらに、C. cineraのゲノム編集㈱を作成するためのベクターを35種類調製し変異体作成を試みたところ、セルラーゼ(GH6B、GH6C)、アラビのフラノシダーゼ(GH51)、セロビオース脱水素酵素(CDH)、ピラノース脱水素酵素(PDH)の変異株を得ることに成功した。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (11 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ケンブリッジ大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      ケンブリッジ大学
  • [Int'l Joint Research] スウェーデン農業科学大学/ウプサラ大学(スウェーデン)

    • Country Name
      SWEDEN
    • Counterpart Institution
      スウェーデン農業科学大学/ウプサラ大学
  • [Journal Article] Lytic polysaccharide monooxygenase increases cellobiohydrolases activity by promoting decrystallization of cellulose surface2022

    • Author(s)
      1.Uchiyama, T., Uchihashi, T., Ishida, T., Nakamura, A., Vermaas, J. V., Crowley, M. F., Samejima, M., Beckham, G. T., and Igarashi K.
    • Journal Title

      Science Adv.

      Volume: 8 Pages: eade5155

    • DOI

      10.1126/sciadv.ade5155

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Acetylated xylan degradation by glycoside hydrolase family 10 and 11 xylanases from the white-rot fungus Phanerochaete chrysosporium2022

    • Author(s)
      3.Kojima, K., Sunagawa, N., Yoshimi, Y., Tryfona, T., Samejima, M., Dupree, P., and Igarashi, K.
    • Journal Title

      J. Appl. Glycosci.

      Volume: 69 Pages: 35-43

    • DOI

      10.5458/jag.jag.JAG-2021_0017

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Comparison of glycoside hydrolase family 3 β-xylosidases from basidiomycetes and ascomycetes reveals evolutionarily distinct xylan degradation systems.2022

    • Author(s)
      5.Kojima, K., Sunagawa, N., Mikkelsen, N. E., Hansson, H., Karkehabadi, S., Samejima, M., Sandgren, M., and Igarashi, K.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 298 Pages: 101670

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.101670

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Nordic Polymer Conference/Nordic Polymer Days 20212021

    • Author(s)
      Kiyohiko Igarashi
    • Organizer
      Enzymatic degradation and synthesis of crystalline cellulose
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] セルロース分解酵素の中性子構造と古くて新しい加水分解反応メカニズム2021

    • Author(s)
      五十嵐 圭日子
    • Organizer
      iBIXタンパク質構造研究会
    • Invited
  • [Presentation] 植物細胞壁の生分解と生合成を模した循環型もの作り2021

    • Author(s)
      五十嵐 圭日子
    • Organizer
      第38回日本植物バイオテクノロジー学会(つくば)大会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Breaking and making cellulose by enzymes: Perspective on biomass research in Japan and Scandinavia2021

    • Author(s)
      Kiyohiko Igarashi
    • Organizer
      JSPS-ACD hybrid seminar: Biosustainable Chemistry from Biomass
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 次世代バイオマス変換技術:サーキュラーバイオエコノミー実現のためにいかに酵素を利用するか2021

    • Author(s)
      五十嵐 圭日子
    • Organizer
      神戸大ワークショップ2021
    • Invited
  • [Remarks] キノコとカビにおけるヘミセルロース分解戦略の微妙な違い

    • URL

      https://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/topics_20220225-1.html

URL: 

Published: 2023-12-25  

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