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2019 Fiscal Year Annual Research Report

細菌べん毛タンパク質輸送の交通整理のしくみの解明

Research Project

Project/Area Number 19H03182
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

南野 徹  大阪大学, 生命機能研究科, 准教授 (20402993)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywords細菌 / 蛋白質 / 1分子計測 / 電子顕微鏡
Outline of Annual Research Achievements

輸送ゲート構成タンパク質であるFlhAのC末細胞質ドメイン(FlhA-C)は9量体リング複合体を形成する。このリング複合体を構成する各FlhA-Cサブユニットがべん毛フックの完成に伴って協同的に構造変化すると、べん毛タンパク質輸送の交通渋滞が発生することなく規則正しい順番でべん毛タンパク質が送り出される。本研究は、フック完成に伴って誘導されるFlhA-Cリング複合体の協同的構造変化とそれに伴う機能変化を原子レベルで解明することを目指している。本年度の主な成果は以下に示す。
1.FlhBのC末細胞質ドメイン (FlhB-C) の変異体解析から、 FliKのC末ドメイン (FliK-C) がFlhB-Cに結合するとFlhB-Cの構造変化が起こり、その結果フックタンパク質の輸送が停止すること、さらにFlhB-CがFlhA-Cに結合するとFlhA-Cが構造変化し、その結果べん毛繊維タンパク質の輸送が開始することを突き止めた。さらに、FlhA-Cの変異体解析から、FliK-CがFlhA-Cにも結合することが示唆された。
2.ATPaseであるFliIがFlhB-Cとの相互作用を介してATP依存的に輸送ゲートを開閉すること、FlhBのN末細胞質領域と構造的にフレキシブルなC末端天然変性領域が輸送ゲートの開閉に重要な役割を果たすことが示唆された。
3.FliKのN末ドメインとFliK-Cをつなぐリンカー領域の欠失解析から、リンカー領域はフックの長さを測定する分子物差しの一部であること、FliK-CとFlhB-Cとの相互作用を巧みに制御すること、などが判明した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

遺伝学的および生化学的解析から、べん毛タンパク質輸送の交通整理のしくみを概ね明らかにすることができた。しかしながら、X線結晶構造解析に適した結晶は未だ得られていない。

Strategy for Future Research Activity

解析に適した結晶化スクリーニングを進める一方で、クライオ電子顕微鏡を用いてMSリングの中心孔に結合したFlhAリング複合体の構造解析に着手する。さらに、高速AFMを用いてFliKとFlhA-Cとの相互作用を可視化する。

  • Research Products

    (13 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 5 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] 南京農業大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      南京農業大学
  • [Int'l Joint Research] ユタ大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ユタ大学
  • [Journal Article] FliK-Driven Conformational Rearrangements of FlhA and FlhB Are Required for Export Switching of the Flagellar Protein Export Apparatus2020

    • Author(s)
      Minamino Tohru、Inoue Yumi、Kinoshita Miki、Namba Keiichi
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 202 Pages: e00637-19

    • DOI

      10.1128/JB.00637-19

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The flexible linker of the secreted FliK ruler is required for export switching of the flagellar protein export apparatus.2020

    • Author(s)
      Kinoshita M, Tanaka S, Inoue Y, Namba K, Aizawa SI, Minamino T.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 838

    • DOI

      10.1038/s41598-020-57782-5.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] In vitro autonomous construction of the flagellar axial structure in the inverted membrane vesicles.2020

    • Author(s)
      Terashima H, Tastumi C, Kawamoto A, Namba K, Minamino T, Imada K.
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 10 Pages: 126

    • DOI

      10.3390/biom10010126.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural and functional comparison of Salmonella flagellar filaments composed of FljB and FliC.2020

    • Author(s)
      Yamaguchi T, Toma S, Terahara N, Miyata N, Ashihara M, Minamino T, Namba K, Kato T.
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 10 Pages: 246

    • DOI

      10.3390/bioml0020246

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Flagella-Driven Motility of Bacteria2019

    • Author(s)
      Nakamura Shuichi、Minamino Tohru
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 9 Pages: 279

    • DOI

      10.3390/biom9070279

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Directional Switching Mechanism of the Bacterial Flagellar Motor2019

    • Author(s)
      Minamino Tohru、Kinoshita Miki、Namba Keiichi
    • Journal Title

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      Volume: 17 Pages: 1075~1081

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2019.07.020

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Structural and functional analyses of the flagellar transmembrane export gate complex of the Salmonella flagellar type III protein export apparatus.2019

    • Author(s)
      Kinoshita M, Miyata T, Kawamoto A, Kato T, Namba K, Minamino T.
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Salmonella Biology and Pathogenesis.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Autocatalytic cleavage of FlhB is required for conformational rearrangements of FlhA to switch export specificity of the flagellar protein export apparatus.2019

    • Author(s)
      Minamino T, Inoue Y, Kinoshita M, Namba K.
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Salmonella Biology and Pathogenesis.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Gating mechanism of the bacterial flagellar protein export apparatus (バクテリアべん毛タンパク質輸送装置のゲート機構).2019

    • Author(s)
      Kinoshita M, Namba K, Minamino T.
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] バクテリアべん毛タンパク質輸送装置のエネルギー共役機構2019

    • Author(s)
      南野徹, 木下実紀, 難波啓一
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第45回討論会
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/general/lab/02/group/

URL: 

Published: 2021-01-27  

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