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2021 Fiscal Year Annual Research Report

生活史戦略の改変と多様化をもたらす分子遺伝基盤

Research Project

Project/Area Number 19H03277
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

石川 麻乃  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (20722101)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山崎 曜  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 助教 (40816021)
北野 潤  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 教授 (80346105)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywords季節性繁殖
Outline of Annual Research Achievements

生物の生活史戦略は、多くの形質が統合されて成立する複雑な形質群である。一方、この生活史戦略は適応度に直接的に影響するため、環境に応じて近縁種/集団間で迅速に分化する。このことは、多形質を同時並行的に変化させ、生活史戦略を劇的に変える原因変異が存在することを示唆しているが、このような原因変異の同定や、それらの各変異の生理的機能や適応度への貢献度、また変異の起源や動態の検証は進んでいなかった。そこで、本研究では、集団間で異なる季節性生活史を複数進化させてきたトゲウオ科イトヨを用いて、これらを解明した。まず、私たちが近年、淡水進出したイトヨで複数回独立に季節性繁殖の進化に寄与することを明らかにした甲状腺刺激ホルモンTSHb2について、その応答性の変化をもたらす遺伝子座(TSHb2 eQTL)が、繁殖形質や成長形質、それらを司るホルモン動態の変化にもたらす効果を定量化した。この結果、シス制御領域の変化により、このTSHb2の応答性の進化が生じている北米集団では、TSHb2 eQTLが、オスでは性ステロイドホルモン、精巣発達、腎臓発達の違いに、メスでは卵巣発達、肝臓発達、筋肉の発達の違いに、多面的に寄与することが分かった。このシス変異は潜性であり、北米の複数の淡水集団に共有されていた。一方で、トランス因子の変異によってTSHb2 の応答性の進化が生じている日本集団では、その直接的な貢献が精巣発達に見られた。このトランス変異は顕性であり、他集団との遺伝的交流がない日本の淡水集団で、新規変異として固定されやすかったと考えられた。更に、短日条件下の海型の下垂体の一細胞RNAシークエンスから、TSHb2発現細胞は各ホルモン産生細胞クラスター内に少数ずつ散在することが分かった。これは、TSHb2が各ホルモンの司令塔として機能することで、季節性生活史の進化のハブ機能を果たしたことを示唆している。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (11 results)

All 2022 2021

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Construction of a chromosome-level Japanese stickleback species genome using ultra-dense linkage analysis with single-cell sperm sequencing.2022

    • Author(s)
      Yoshitake K, Ishikawa A, Yonezawa R, Kinoshita S, Kitano J, and Asakawa S.
    • Journal Title

      NAR Genomics and Bioinformatics

      Volume: - Pages: -

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Convergent copy number increase of genes associated with freshwater colonisation in fishes2022

    • Author(s)
      Ishikawa A, Yamanouchi S, Iwasaki W, and Kitano J.
    • Journal Title

      Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences

      Volume: - Pages: -

  • [Journal Article] Genetic basis for variation in the number of cephalic pores in a hybrid zone between closely related species of goby, <i>Gymnogobius breunigii</i> and <i>Gymnogobius castaneus</i>2021

    • Author(s)
      Kakioka Ryo、Kume Manabu、Ishikawa Asano、Ansai Satoshi、Hosoki Takuya K、Yamasaki Yo Y、Nagano Atsushi J、Toyoda Atsushi、Kitano Jun
    • Journal Title

      Biological Journal of the Linnean Society

      Volume: 133 Pages: 143~154

    • DOI

      10.1093/biolinnean/blab033

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The evolutionary ecology of fatty‐acid variation: Implications for consumer adaptation and diversification2021

    • Author(s)
      Twining Cornelia W.、Bernhardt Joey R.、Derry Alison M.、Hudson Cameron M.、Ishikawa Asano、Kabeya Naoki、Kainz Martin J.、Kitano Jun、Kowarik Carmen、Ladd Sarah Nemiah、Leal Miguel C.、Scharnweber Kristin、Shipley Jeremy R.、Matthews Blake
    • Journal Title

      Ecology Letters

      Volume: 24 Pages: 1709~1731

    • DOI

      10.1111/ele.13771

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Copy number variation of a fatty acid desaturase gene <i>Fads2</i> associated with ecological divergence in freshwater stickleback populations2021

    • Author(s)
      Ishikawa Asano、Stuart Yoel E.、Bolnick Daniel I.、Kitano Jun
    • Journal Title

      Biology Letters

      Volume: 17 Pages: 20210204

    • DOI

      10.1098/rsbl.2021.0204

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] A key gene important for freshwater colonization and radiation2022

    • Author(s)
      Ishikawa A
    • Organizer
      日本生態学会
    • Invited
  • [Presentation] A key metabolic gene important for freshwater colonization and adaptation2021

    • Author(s)
      Ishikawa A
    • Organizer
      ICZ Virtual Conference 2021
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Genetic molecular mechanisms underlying life-history evolution in sticklebacks2021

    • Author(s)
      Ishikawa A
    • Organizer
      NIBB-Academia Sinica International Webinar of Aquatic Model Organisms for Basic Biology to Human Disease Models
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ヒトと魚をつなぐ脂肪酸代謝の進化機構2021

    • Author(s)
      石川 麻乃
    • Organizer
      第75回日本人類学会大会
    • Invited
  • [Presentation] トゲウオから探る季節性生活史の収斂進化の分子遺伝基盤2021

    • Author(s)
      石川 麻乃
    • Organizer
      日本遺伝学会第93回大会
    • Invited
  • [Presentation] トゲウオから探る生活史の収斂進化の分子遺伝機構2021

    • Author(s)
      石川 麻乃
    • Organizer
      第66回日本生態学会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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