• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

H3K27脱メチル化とシグナル伝達を連結する長鎖ncRNAによるがん細胞運命制御

Research Project

Project/Area Number 19H03501
Research InstitutionHamamatsu University School of Medicine

Principal Investigator

北川 雅敏  浜松医科大学, 医学部, 教授 (50294971)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywords長鎖ノンコーディングRNA / ヒストン脱メチル化 / シグナル伝達
Outline of Annual Research Achievements

我々はlncRNAががん細胞の運命転換シグナルの伝達機構とエピジェネティックな機構をつなぐキープレイヤーであると考えている。我々はこれまでの研究でTGFβで誘導され上皮間葉転換(EMT)に関与する新規長鎖ノンコーディングRNA(lncRNA)としてELIT-1を見出した。本研究ではELIT-1とSmadに関し以下の知見を得た。ELIT-1はSmad2とは結合せずにSmad3と選択的に結合した。ELIT-1-Smad3複合体はは強制発現したELIT-1およびSmad3で確認されただけでなく、内因性のELIT-1およびSmad3でも複合体を形成した。内因性ELIT-1-Smad3複合体はTGFβ刺激により増加した。ELIT-1はリン酸化ミミックなSmad3と優先的に結合した(強制発現系)。ELIT-1-Smad3複合体は細胞質より核内で主に検出された。さらに、ELIT-1はSmad3の標的遺伝子プロモーターへのリクルートを促進する機能を持っていることがわかった。ここまでの研究成果はCancer Reseach誌に発表した。
さらに我々は、ELIT-1がH3K27脱メチル化酵素KDM6Bとも結合することがRIP-assayによって見出した。
このELIT-1のKDM6Bとの結合特異性を解析している途中、当初の予想に反し、TGFβで誘導されるELIT-1以外の新規lncRNAを発見し、ELIT-1に類似した機能を有する可能性があることが判明した。研究遂行上、この新規lncRNAの検証が不可欠なため、この新規lncRNAの標的遺伝子とEMT誘導機構等の機能を調べる実験を追加で実施した。その結果、このlncRNAはTGF-betaで誘導されるが、EMTへの影響はほとんどなく、Smadとも結合しないことが判明した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

ELIT-1のKDM6Bとの結合特異性の解析の途中、当初の予想に反し、TGFβで誘導される新規lncRNAを発見し、ELIT-1に類似した機能を有する可能性があることが判明した。研究遂行上、この新規lncRNAの検証が不可欠なため、この新規lncRNAの標的遺伝子とEMT誘導機構等の機能を調べる実験を追加で実施する必要が生じたため。

Strategy for Future Research Activity

ELIT-1様な機能が想定されたlncRNAはTGFβで誘導されるが、EMTへの影響はほとんどなく、Smadとも結合しないことが判明し、今後はこのlncRNAを研究の対象から除くことにした。
今後は、まずELIT-1とKDM6BおよびSmad3の複合体の解析を行う。さらに最終年度は、RIP-SeqによるKDMと結合するlncRNAの網羅的解析の条件を決め、それを実行する。

  • Research Products

    (7 results)

All 2019 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Long noncoding RNA ELIT-1 acts as a Smad3 cofactor to facilitate TGF-β/Smad signaling and promote epithelial-mesenchymal transition2019

    • Author(s)
      Sakai, S., Ohhata, T., Kitagawa, K., Uchida, C., Aoshima, T., Niida, H., Suzuki, T., Inoue, Y., Miyazawa, K and *Kitagawa, M.
    • Journal Title

      Cancer Research

      Volume: 79 Pages: 2821-2838

    • DOI

      10.1158/0008-5472.CAN-18-3210

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 新規 lncRNA ELIT-1 は Smad3 コファクターとして TGF βシグナリング と EMT を促進する2019

    • Author(s)
      北川雅敏
    • Organizer
      第71回日本細胞生物学会大会
  • [Presentation] Smad3の標的遺伝子へのリクルーターとして機能する新規lncRNA ELIT-12019

    • Author(s)
      北川雅敏、酒井聡、大畑樹也
    • Organizer
      第21回日本RNA学会年会
  • [Presentation] TGF βによって誘導され、TGF β-Smadシグナリングの正の制御因子として機能する新規lncRNA ELIT-12019

    • Author(s)
      北川雅敏、酒井聡、大畑樹也
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
  • [Presentation] A novel lncRNA ELIT-1 promotes Snail induction and EMT via TGFb signaling2019

    • Author(s)
      北川雅敏
    • Organizer
      第78回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Long noncoding RNA ELIT-1 act as a Smad3 cofactor to promotes TGFbeta-Smad signaling and epithelial-mesenchymal transition2019

    • Author(s)
      Masatoshi Kitagawa, Tatsuya Ohhata, Satoshi Sakai
    • Organizer
      EMBO Workshop The Non-Coding Genome
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 浜松医科大学医学部分子生物学講座

    • URL

      https://www.hama-med.ac.jp/education/fac-med/dept/mol-biol/index.html

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi