臨床検体から同定したピロリ菌ゲノム異常の時空間的な解明に基づく胃癌の革新的制御

2021 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 19H03521
• Research Institution: St. Marianna University School of Medicine
• Principal Investigator: 山本 博幸 聖マリアンナ医科大学, 医学研究科, 教授 (40332910)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 伊東 文生 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 教授 (90223180) ; 松尾 康正 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 講師 (70724756)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: H. pylori / ゲノム解析 / ゲノム多様性 / 胃洗浄廃液 / 胃癌

Outline of Annual Research Achievements

世界の全人口の半数以上がピロリ菌に感染していると推定される。胃癌の98%はピロリ菌関連であり、ピロリ菌感染の制御が胃癌の撲滅につながる。現状の除菌だけでは、異時性胃癌の発生を完全に予防できず、ピロリ菌ゲノムに注目した胃発癌リスクのバイオマーカーの重要性が再認識され、研究開発に対する社会的要請は高い。研究代表者らは、ピロリ菌の胃内空間的不均一性という課題を内視鏡胃洗浄廃液という面診断で克服し（日欧特許取得）、ヒトゲノム解析を行ってきた。
本研究では、ピロリ菌ゲノムに注目し、時空間的にロングリード次世代シーケンサーを用いたゲノム解析を行うとともに機能解析を行い、ゲノムの多様性の理解に基づく胃発癌の新機軸を明らかにすることを目的とした。
ピロリ菌microRNA解析を網羅的に行い、胃癌と関連するピロリ菌microRNA異常を明らかにした。さらに、それらのmicroRNA異常の制御機構の一部を明らかにした。また、ピロリ菌エピゲノム解析を網羅的に行い、胃癌と関連するピロリ菌エピゲノム異常を明らかにした。また、ピロリ菌とヒトのmicroRNA異常およびエピゲノム異常の関連を明らかにし、さらに、インタラクトーム解析により、新たな知見を得た。これまで得られたデータに対して、バイオインフォマティクス解析を行い、臨床実装に向けた基盤の構築に成功した。
胃癌の本質的な基礎医学的分子病態の解明とともに、診断から除菌治療までの迅速遺伝子判定システムなどの臨床応用開発につながる成果をあげることができた。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。