2020 Fiscal Year Annual Research Report
The role of hydroxymethylation in imprinting diseases caused by abnormal methylation
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19H03628
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| Research Institution | 独立行政法人国立病院機構(東京医療センター臨床研究センター) |
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Principal Investigator |
山澤 一樹 独立行政法人国立病院機構(東京医療センター臨床研究センター), その他部局等, 医長 (10338113)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鏡 雅代 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 分子内分泌研究部, 室長 (70399484)
松原 圭子 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 分子内分泌研究部, 上級研究員 (90542952)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | メチル化 / ヒドロキシメチル化 / ゲノムインプリンティング |
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年、ゲノムDNA中に存在が確認された5-ヒドロキシメチル化シトシン（5-hydroxymethyl C: 5hmC）は、5-メチル化シトシン（5-methyl C: 5mC）の酸化産物であり、DNA脱メチル化反応における中間代謝産物として注目されている。本研究は、メチル化異常に起因する小児インプリンティング異常症において、ヒドロキシメチル化が病態にどのように関与しているかを解明することが目的である。5mCと5hmCを区別するための酸化バイサルファイト(oxBS)処理に続いて、パイロシークエンサー（oxBS-pyro）、メチル化ビーズアレイ(oxBS-array)、次世代シークエンサー（oxBS-seq）による解析を行い、一塩基レベルの“methylome”および“hydroxymethylome”を明らかにする。
インプリンティング異常症例のバイサルファイト処理および酸化バイサルファイト処理、パイロシークエンサーによる解析を前年度行った。この過程でシルバーラッセル症候群に類似した成長障害を主症状とする症例に、新規のメチル化異常を同定した。これは過去に報告のないメチル化異常であり、新規のインプリンティング疾患として報告した(Yamazawa et al. J Med Genet 2021;58(6):427-432)。さらに本症例における5hmCの挙動についても詳細な解析を行っている。また、インプリンティング異常症310症例のバイサルファイト処理検体においてメチル化ビーズアレイの解析を実施中である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
インプリンティング異常症例のバイサルファイト処理、パイロシークエンス解析は順調に進行している。また新規のインプリンティング異常症と思われる症例を発見し、論文報告を行った。
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| Strategy for Future Research Activity |
引き続きインプリンティング異常症例のバイサルファイト処理、酸化バイサルファイト処理を行い、メチル化ビーズアレイや次世代シークエンサーによる解析を実施し、一塩基レベルの“methylome”および“hydroxymethylome”を明らかにする。これによりインプリンティング異常症の神経症状を改善する治療法の開発を目指す。
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Research Products
(14 results)
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[Journal Article] 水痘ワクチン株由来の三叉神経領域帯状疱疹を発症した6歳男児の1例2021
Author(s)
坂野沙里, 三春晶嗣, 雪野祐莉子, 磯部あいこ, 影山智佳, 前田直則, 籏生なおみ, 佐藤利永子, 鈴木絵理, 山澤一樹, 藤田尚代, 込山修.
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Journal Title
小児科臨床
Volume: 74
Pages: 55-59
Peer Reviewed
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[Presentation] Loss of imprinting of the human-specific imprinted gene ZNF597 causes prenatal growth retardation and dysmorphic features reminiscent of Silver-Russell syndrome.2020
Author(s)
Kazuki Yamazawa, Takanobu Inoue, Yoshihiro Sakemi, Toshinori Nakashima, Hironori Yamashita, Kaduki Khono, Hideki Fujita, Keisuke Enomoto, Kazuhiko Nakabayashi, Kenichiro Hata, Moeko Nakashima, Tatsuo Matsunaga, Akie Nakamura, Keiko Matsubara, Tsutomu Ogata, Masayo Kagami.
Organizer
European Human Genetics Virtual Conference
Int'l Joint Research
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[Presentation] Loss of imprinting of the human-specific imprinted gene ZNF597 causes prenatal growth retardation and dysmorphic features.2020
Author(s)
Kazuki Yamazawa, Takanobu Inoue, Yoshihiro Sakemi, Toshinori Nakashima, Hironori Yamashita, Kaduki Khono, Hideki Fujita, Keisuke Enomoto, Kazuhiko Nakabayashi, Kenichiro Hata, Moeko Nakashima, Tatsuo Matsunaga, Akie Nakamura, Keiko Matsubara, Tsutomu Ogata, Masayo Kagami.
Organizer
Genomic Imprinting - from Biology to Disease Virtual Conference
Int'l Joint Research
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