2021 Fiscal Year Annual Research Report
The role of hydroxymethylation in imprinting diseases caused by abnormal methylation
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19H03628
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| Research Institution | 独立行政法人国立病院機構(東京医療センター臨床研究センター) |
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Principal Investigator |
山澤 一樹 独立行政法人国立病院機構(東京医療センター臨床研究センター), その他部局等, 医長 (10338113)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鏡 雅代 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 分子内分泌研究部, 室長 (70399484)
松原 圭子 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 分子内分泌研究部, 上級研究員 (90542952)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | メチル化 / ヒドロキシメチル化 / ゲノムインプリンティング |
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年、ゲノムDNA中に存在が確認された5-ヒドロキシメチル化シトシン(5-hydroxymethyl C: 5hmC)は、5-メチル化シトシン(5-methyl C: 5mC)の酸化産物であ り、DNA脱メチル化反応における中間代謝産物として注目されている。本研究は、メチル化異常に起因する小児インプリンティング異常症において、ヒドロキシメ チル化が病態にどのように関与しているかを解明することが目的である。5mCと5hmCを区別するための酸化バイサルファイト(oxBS)処理に続いて、パイロシークエ ンサー(oxBS-pyro)、メチル化ビーズアレイ(oxBS-array)、次世代シークエンサー(oxBS-seq)による解析を行い、一塩基レベルの“methylome”および“hydroxymethylome”を明らかにする。
インプリンティング異常症例のバイサルファイト処理および酸化バイサルファイト処理、パイロシークエンサーによる解析を前年までに終了した。この過程でシルバーラッセル症候群に類似した成長障害を主症状とする症例に、新規のメチル化異常を同定した。これは過去に報告のないメチル化異常であり、新規のインプリンティング疾患として報告した(Yamazawa et al. J Med Genet 2021;58(6):427-432)。また、インプリンティング異常症310症例のバイサルファイト処理検体においてメチル化ビーズアレイの解析を終了しており、今後は酸化バイサルファイト処理検体のメチル化ビーズアレイ解析を実施し、“hydroxymethylome”の実態を解明する予定である。
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| Research Progress Status |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Frequency and clinical characteristics of distinct etiologies in patients with Silver-Russell syndrome diagnosed based on the Netchine-Harbison clinical scoring system2022
Author(s)
Tomoko Fuke, Akie Nakamura, Takanobu Inoue, Sayaka Kawashima, Kaori Hara-Isono, Keiko Matsubara, Shinichiro Sano, Kazuki Yamazawa, Maki Fukami, Tsutomu Ogata, Masayo Kagami
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Journal Title
Journal of Human Genetics
Volume: -
Pages: -
Peer Reviewed
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[Journal Article] Pathogenic copy number and sequence variants in children born SGA with short stature without imprinting disorders2022
Author(s)
Kaori Hara-Isono, Akie Nakamura, Tomoko Fuke, Takanobu Inoue, Sayaka Kawashima, Keiko Matsubara, Shinichiro Sano, Kazuki Yamazawa, Maki Fukami, Tsutomu Ogata, Masayo Kagami
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Journal Title
Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism
Volume: -
Pages: -
Peer Reviewed
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[Presentation] PURA症候群は先天性中枢性低換気症候群の鑑別診断である.2022
Author(s)
桂美遥, 坂野沙里, 大江俊太郎, 髙田啓志, 影山智佳, 前田直則, 籏生なおみ, 佐藤利永子, 鈴木絵理, 藤田尚代, 増田怜史, 和田友香, 丸山秀彦, 鈴木俊彦, 山田洋輔, 長谷川久弥, 三春晶嗣, 山澤一樹.
Organizer
第125回日本小児科学会学術集会
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[Presentation] 当院におけるBRCA1/2遺伝学的検査の現状と課題2021
Author(s)
井上沙聡, 安齋純子, 安達将隆, 大木慎也, 笹岡綾子, 中小路絢子, 笹原真奈美, 山下博, 松井哲, 松永達雄, 山澤一樹.
Organizer
第45回日本遺伝カウンセリング学会学術集会
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[Presentation] A novel pathogenic variant of the FH gene in a family with hereditary leiomyomatosis and renal cell carcinoma.2021
Author(s)
Yamazawa K, Yagi Y, Abeto N, Shiraishi J, Miyata C, Inoue S, Murakami H, Nakashima M, Sugano K, Ushiama M, Yoshida T.
Organizer
日本人類遺伝学会第66回大会
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