2019 Fiscal Year Annual Research Report
リキッドバイオプシーによる口腔がんの免疫チェックポイント阻害薬効果予測法の確立
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19H03856
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| Research Institution | National Cancer Center Japan |
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Principal Investigator |
本田 一文 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 部門長 (10260936)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
吉本 世一 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 科長 (00462242)
本間 義崇 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医長 (30719943)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | CTCs / リキッドバイオプシー / ctDNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
がん治療の効率化には、がん自身が持つ個性を正確にとらえ、最も合理的な治療法を選択することがカギとなる。がんは自身の生存をかけて治療圧力に抵抗し、その個性を進化させる。進化した個性を適時・適格に捉えるには、腫瘍細胞が持つ分子生物学的や遺伝学的プロファイルを頻回に検査し、最適な治療法を提示するバイオマーカーの開発が急務である。腫瘍本体からの分子プロファイルには、手術検体や生検検体の採取が必要であるが、頻回の検査は患者の負担を高めるため、採血などの方法からCTCsやctDNAなどから分子プロファイルする方法の開発が求められている。
われわれは、国立シンガポール大学との共同研究で、CTCs細胞表面に発現する上皮系マーカーを利用せず、微小流路通過による遠心力と揚力を利用してCTCsを分取する要素技術を開発し、分取したCTCｓから次世代シーケンスを用いて口腔がんや食道がん、大腸がん等の遺伝子変異プロファイル技術を確立した。また、CTCsを分取した同一患者からctDNAを採取して、次世代シーケンスを行い、CTCsとctDNAの遺伝子変異プロファイルをマージさせることで、特異度を下げることなく検出感度を上昇させることを報告した（Onidani et al. Cancer Sci 2019）。さらに理化学研究所との共同研究で、分取したCTCsをマイクロマニピュレーターを用いて１細胞に分離し、同細胞質液を質量分析することで、CTC１細胞からのメタボローム解析に世界で初めて成功した（Abouleila et al. Cancer Sci 2019）。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
１）国立シンガポール大学との共同研究で、CTCs細胞表面に発現する上皮系マーカーを利用せず、微小流路通過による遠心力と揚力を利用してCTCsを分取する要素技術を開発し、分取したCTCｓから次世代シーケンスを用いて口腔がんや食道がん、大腸がん等の遺伝子変異プロファイル技術を確立した。
２）CTCsを分取した同一患者からctDNAを採取して、次世代シーケンスを行い、CTCsとctDNAの遺伝子変異プロファイルをマージさせることで、特異度を下げることなく検出感度を上昇させることを報告した（Onidani et al. Cancer Sci 2019）。
３）理化学研究所との共同研究で、分取したCTCsをマイクロマニピュレーターを用いて１細胞に分離し、同細胞質液を質量分析することで、CTC１細胞からのメタボローム解析に世界で初めて成功した（Abouleila et al. Cancer Sci 2019）。
４）口腔がんでニボルマブを投与された患者１６例（治療前８例、投与４週後６例、PD時２例）から、CTCsとctDNAを分取し、CTCsから分取したDNAはwhole genome amplificationをした段階で凍結保存した。
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| Strategy for Future Research Activity |
ニボルマブ投与された口腔がん患者のCTCｓやctDNAを分離し、ゲノム、メタボローム解析から免疫チェックポイント治療の奏効性を予測するバイオマーカーを同定する。
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