2019 Fiscal Year Annual Research Report
双生児のエピゲノム情報と臨床検査値に基づいた、生活習慣病に影響する環境因子の解明
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19H04048
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
渡邉 幹夫 大阪大学, 医学系研究科, 教授 (50294088)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
竹中 要一 関西大学, 総合情報学部, 教授 (00324830)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | エピゲノム / 双生児 / 臨床検査 / 生活習慣病 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
① 表現型不一致双生児・一致双生児の同定（並びに継続サンプリング）：臨床検査値を表現型として、一卵性双生児の継続サンプリングを行い、生体試料と疫学データをさらに蓄積した。大阪大学ツインリサーチセンターにおえるサンプリングと併せて、双生児サンプルは500組1000名を超え、経時的なサンプリング実績も50組程度となった。また臨床検査値の標準化を行うとともに、タイピングしたSNPデータのQuality ControlおよびImputationを行い、タイピングキットのロット間差等のコントロールを行った。さらに、DNAメチル化アレイデータのQuality Controlも行うとともにアノテーション情報を追加した。
② 不一致双生児特異的な遺伝背景の同定：既報の臨床検査値の遺伝因子モデルを用いて、各々の一卵性双生児の臨床検査値の標準化された遺伝的予測値を算出した。臨床検査値は50項目程度について予測値の算出が可能であった。これらをGeneticRiskScoreとし、臨床検査値への遺伝要因寄与率を反映するものとして個体ごとに同定を終えた。
③ エピゲノム情報（DNAメチル化）の比較：臨床検査値の実測値と予測値の乖離を調べ、それぞれの個体における環境要因の寄与度を解析した。本解析に関しては、日本臨床化学会、日本双生児研究学会等で成果発表を行った。
さらに一卵性双生児において、ペアの二人における環境要因の寄与度の相違を、それぞれの個体のメチル化率の相違として関連付けるための解析を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
代表的な臨床検査値について遺伝要因寄与度と環境要因寄与度を網羅的に同定でき、エピゲノム変化との関連を解析する準備が整った。
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| Strategy for Future Research Activity |
臨床検査値への環境要因寄与度と双生児のペア内差とDNAメチル化との関連を解析し、併せて個体の生活習慣等がそれらに影響している可能性を模索する。
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[Journal Article] Enhanced processivity of Dnmt1 by mono-ubiquitinated histone H32020
Author(s)
Mishima, Y., Brueckner, L., Takahashi, S., Kawakami, T., Otani, J., Shinohara, A., Takeshita, K., Garvilles, R., Watanabe, M., Sakai, N., Takeshima, H., Nachtegael, C., Nishiyama, A., Nakanishi, M., Arita, K., Nakashima, K., Hojo, H., Suetake, I.
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Journal Title
Genes to Cells
Volume: 25
Pages: 22-32
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Association of IL6 gene methylation in peripheral blood cells with the development and prognosis of autoimmune thyroid diseases2019
Author(s)
Hirai, N., Watanabe, M., Inoue, N., Kishonita, R., Ohtani, H., Hidaka, Y,. Iwatani, Y.
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Journal Title
Autoimmunity
Volume: 52
Pages: 251-255
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Association of IFNG gene methylation in peripheral blood cells with the development and prognosis of autoimmune thyroid disease2019
Author(s)
Hashimoto, H. Watanabe, M., Inoue, N., Hirai, N., Haga, E., Kinoshita, R., Hidaka, Y., Iwatani, Y.
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Journal Title
Cytokine
Volume: 123
Pages: 154770
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Genetic contribution to inter-individual differences in human natural audio-visual experiences2019
Author(s)
Toyoda, S., Nishida, S., Honda, C., Watanabe, M., Ollikainen, M., Vuoksimaa, E., Kaprio, J., Osaka Twin Research Group, Nishimoto, S.
Organizer
3rd Nordic Neuroscience meeting
Int'l Joint Research
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[Presentation] Alterations In The Internal Structure of Platelets Contribute To Morphological Abnormalities Such As DegranulatedAnd Giant Platelets In MDS Patients.2019
Author(s)
Masutani, R., Yamazaki, I., Tanada, H., Kubota, M., Watanabe, M., Okada, Y., Osaka N.
Organizer
The 57th congress of the Korean Association of Medical Technologists & International Conference
Int'l Joint Research
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