2020 Fiscal Year Annual Research Report
Assessing causal relationship of skeletal muscle- and fitness-related myokines with cardiometabolic risk factors
Project/Area Number |
19H04065
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Research Institution | Waseda University |
Principal Investigator |
谷澤 薫平 早稲田大学, スポーツ科学学術院, 専任講師 (50771812)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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Keywords | マイオカイン / 筋量 / 体力 / 心血管代謝リスク / ゲノムワイド関連解析 / メンデルランダム化解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究の主要な目的は、筋量・体力に関連するマイオカインの血中濃度を規定する遺伝子バリアントを、ゲノムワイド関連解析(GWAS)により同定し、それらを操作変数としたメンデルランダム化解析により、血中マイオカイン濃度と心血管代謝リスクとの因果関係を明らかにすることである。本年度は昨年度に引き続き、GWASおよびメンデルランダム化解析を実施するために必要なジェノタイプデータの取得と整備を行うと共に、ジェノタイプデータのインピュテーションと、血中マイオカイン濃度の測定を進めた。新たに384名を対象として、Illumina社のInfinium HumanCoreExome BeadChipを用いて約55万個のSNPについてジェノタイプデータを取得し、昨年度までに解析した864名と合わせて計1248名のジェノタイピングが完了した。1248名の内、クオリティコントロールを通過した1219名について、ソフトウェアSHAPEITを用いてジェノタイプからハプロタイプを予測するプレフェージングを実施した後、ソフトウェアIMPUTE2を用いて1000人ゲノムプロジェクトをリファレンスパネルとしたジェノタイプデータのインピュテーションを行い、バリアント情報を補完した。昨年度に選定した4つのマイオカインを分析するためにELISA kitを購入し、現在血中マイオカイン濃度の測定を進めている。また、GWASの実施に向けて、骨格筋量・体力・心血管代謝リスク因子などのフェノタイプデータの整備を進めている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
ジェノタイプデータの取得とインピュテーションは順調に進んだものの、血中マイオカイン濃度の測定が終わらず、GWASとメンデルランダム化解析に着手できなかったため。
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Strategy for Future Research Activity |
研究補助者を雇用することにより、血中マイオカイン濃度の測定とフェノタイプデータの整備を速やかに終わらせ、GWASとメンデルランダム化解析に着手する。
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[Journal Article] Female Athletes Genetically Susceptible to Fatigue Fracture Are Resistant to Muscle Injury: Potential Role of COL1A1 Variant2021
Author(s)
Miyamoto-Mikami E, Kumagai H, Tanisawa K, Taga Y, Hirata K, Kikuchi N, Kamiya N, Kawakami R, Midorikawa T, Kawamura T, Kakigi R, Natsume T, Zempo H, Suzuki K, Kohmura Y, Mizuno K, Torii S, Sakamoto S, Oka K, Higuchi M, Naito H, Miyamoto N, Fuku N.
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Journal Title
Med Sci Sports Exerc
Volume: in press
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] MANTA, an integrative database and analysis platform that relates microbiome and phenotypic data2020
Author(s)
Chen YA, Park J, Natsume-Kitatani Y, Kawashima H, Mohsen A, Hosomi K, Tanisawa K, Ohno H, Konishi K, Murakami H, Miyachi M, Kunisawa J, Mizuguchi K
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Journal Title
PLoS One
Volume: 15(12)
Pages: e0243609
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Visceral fat and cardiorespiratory fitness with prevalence of pre-diabetes/diabetes mellitus among middle-aged and elderly Japanese people: WASEDA'S Health Study2020
Author(s)
Usui C, Kawakami R, Tanisawa K, Ito T, Tabata H, Iizuka S, Kawamura T, Midorikawa T, Sawada SS, Torii S, Sakamoto S, Suzuki K, Ishii K, Oka K, Muraoka I, Higuchi M
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Journal Title
PLoS One
Volume: 15(10)
Pages: 0241018
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Association between dietary intake and the prevalence of tumourigenic bacteria in the gut microbiota of middle-aged Japanese adults2020
Author(s)
Watanabe D, Murakami H, Ohno H, Tanisawa K, Konishi K, Tsunematsu Y, Sato M, Miyoshi N, Wakabayashi K, Watanabe K, Miyachi M
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Journal Title
Sci Rep
Volume: 10(1)
Pages: 15221
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Cut-offs for calf circumference as a screening tool for low muscle mass: WASEDA'S Health Study2020
Author(s)
Kawakami R, Miyachi M, Sawada SS, Torii S, Midorikawa T, Tanisawa K, Ito T, Usui C, Ishii K, Suzuki K, Sakamoto S, Higuchi M, Muraoka I, Oka K
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Journal Title
Geriatr Gerontol Int
Volume: 20(10)
Pages: 943-950
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Sport and exercise genomics: the FIMS 2019 consensus statement update2020
Author(s)
Tanisawa K, Wang G, Seto J, Verdouka I, Twycross-Lewis R, Karanikolou A, Tanaka M, Borjesson M, Di Luigi L, Dohi M, Wolfarth B, Swart J, Bilzon JLJ, Badtieva V, Papadopoulou T, Casasco M, Geistlinger M, Bachl N, Pigozzi F, Pitsiladis Y
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Journal Title
Br J Sports Med
Volume: 54(16)
Pages: 969-975
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research