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2020 Fiscal Year Annual Research Report

父性アリル依存的に発現する転写因子群によるイネ受精卵の発生制御機構

Research Project

Project/Area Number 19J12912
Research InstitutionTokyo Metropolitan University

Principal Investigator

戸田 絵梨香  東京都立大学, 大学院理学研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2021-03-31
Keywords受精卵 / 発生 / 父性因子 / トランスクリプトーム解析 / 配偶子 / イネ
Outline of Annual Research Achievements

受精卵発生過程においては、卵細胞から受精卵への変換に伴う卵(受精卵)の活性化や雌雄配偶子由来因子の活性化あるいは不活性化、新規遺伝子発現の開始など、細胞内でダイナミックな変化が起きていると考えられる。本課題では、受精卵の初期発生過程における遺伝子発現制御やその分子基盤の一端の解明を目的とし、本年度は主に下記の2項目について研究を実施した。
(1)イネ受精卵の最初期発生過程における遺伝子発現変動および父母因子の発現プロファイル:イネ配偶子および受精卵を対象とした1細胞トランスクリプトーム解析系の基盤を構築し、配偶子融合後から雌雄核合一完了までの最初期発生過程の受精卵の網羅的かつ経時的な遺伝子発現解析を進めた。また、受精卵の最初期発生過程で発現変動を示す遺伝子群について、それら発現のアリル依存性を明示するため、ジャポニカ品種の日本晴とインディカ品種のカサラスの配偶子融合により作出した交雑受精卵を用いた同様のトランスクリプトーム解析に取り組んだ。
(2)微量サンプルからのDNAライブラリーの調製および解析:イネ配偶子や受精卵といった微量試料を用いたエピゲノム解析に向けて、DNAライブラリーの調製・解析を試みた。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (14 results)

All 2021 2020

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Effect of Paternal Genome Excess on the Developmental and Gene Expression Profiles of Polyspermic Zygotes in Rice2021

    • Author(s)
      Deushi Ryouya、Toda Erika、Koshimizu Shizuka、Yano Kentaro、Okamoto Takashi
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 10 Pages: 255

    • DOI

      10.3390/plants10020255

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Whole-genome sequence analysis of mutations in rice plants regenerated from zygotes, mature embryos, and immature embryos2021

    • Author(s)
      Ichikawa Masako、Kato Norio、Toda Erika、Kashihara Masakazu、Ishida Yuji、Hiei Yukoh、Isobe Sachiko N.、Shirasawa Kenta、Hirakawa Hideki、Okamoto Takashi、Komari Toshihiko
    • Journal Title

      BioRxiv

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1101/2021.01.20.427397

  • [Journal Article] High-quality sugar production by osgcs1 rice2020

    • Author(s)
      Honma Yujiro、Adhikari Prakash Babu、Kuwata Keiko、Kagenishi Tomoko、Yokawa Ken、Notaguchi Michitaka、Kurotani Kenichi、Toda Erika、Bessho-Uehara Kanako、Liu Xiaoyan、Zhu Shaowei、Wu Xiaoyan、Kasahara Ryushiro D.
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 3 Pages: 617

    • DOI

      10.1038/s42003-020-01329-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] CRISPR/Cas9‐Based Genome Editing Using Rice Zygotes2020

    • Author(s)
      Toda Erika、Okamoto Takashi
    • Journal Title

      Current Protocols in Plant Biology

      Volume: 5 Pages: e20111

    • DOI

      10.1002/cppb.20111

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene Expression and Genome Editing Systems by Direct Delivery of Macromolecules Into Rice Egg Cells and Zygotes2020

    • Author(s)
      Toda Erika、Okamoto Takashi
    • Journal Title

      BIO-PROTOCOL

      Volume: 10 Pages: e3681

    • DOI

      10.21769/BioProtoc.3681

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 植物受精卵を用いたゲノム編集2020

    • Author(s)
      岡本龍史、戸田絵梨香、加藤紀夫
    • Journal Title

      植物化学調節学会

      Volume: 55 Pages: 52-56

  • [Presentation] An efficient DNA- and selectable-marker-free genome-editing system using zygotes in rice and its possible application to other crop species2020

    • Author(s)
      Toda E, Koiso N, Takebayashi A, Ichikawa M, Kiba T, Osakabe K, Osakabe Y, Sakakibara H, Kato N, Okamoto T.
    • Organizer
      Keystone Symposia “Plant Genome Engineering: From Lab to Field”
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] イネin vitro受精系を用いた植物多精受精卵の発生過程および受精卵発生における雌雄配偶子の機能差に関する解析2020

    • Author(s)
      戸田絵梨香
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
  • [Presentation] イネ受精卵と葉プロトプラストから作出した融合細胞における核合一および発生プロファイル2020

    • Author(s)
      戸田絵梨香, 亀川拓夢, 岡本龍史
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
  • [Presentation] 植物受精卵への物質導入によるゲノム編集2020

    • Author(s)
      戸田絵梨香
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] PCP論文賞:イネ受精卵における父性アリル依存的遺伝子発現および OsASGR-BBML1による受精卵発生の誘導2020

    • Author(s)
      Md Hassanur Rahman, 戸田絵梨香, 小林正明, 工藤徹, 越水静, 高原美嶺, 岩見百華, 渡辺選子, 関本弘之, 矢野健太郎, 岡本龍史
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 単子葉植物イネ受精卵および初期胚における極性決定機構2020

    • Author(s)
      木下温子, Tety Maryenti, Hanifah Aini, 戸田絵梨香, 岡本龍史
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] ROS Dynamics and GSH-mediated Glutathione Peroxidase Functions in Developing Rice Zygote2020

    • Author(s)
      Rattanawong K, Koiso N, Toda E, Tanaka M, Tsuji H, Okamoto T.
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
  • [Book] ゲノム編集食品・農林水産分野への応用と持続的社会の実現2021

    • Author(s)
      加藤紀夫、戸田絵梨香、岡本龍史
    • Total Pages
      65-69
    • Publisher
      NTS出版

URL: 

Published: 2021-12-27  

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