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2021 Fiscal Year Annual Research Report

試験管内再構成された環状DNA複製サイクルにおける転写翻訳反応の共役

Research Project

Project/Area Number 19J20097
Research InstitutionRikkyo University

Principal Investigator

奈良 聖亜  立教大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2022-03-31
Keywordsゲノム複製 / 自己複製
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、試験管内で再構成した大腸菌ゲノム複製反応(RCR)と転写・翻訳反応(PURE system)を共役させることによって自己複製システムの構築を目指す。RCRは、25種のタンパク質を用いて大腸菌ゲノム複製システムを再構成した系であり、複製開始起点oriCを含む環状DNAを指数関数的に増幅する反応である。RCRとPURE systemの共役は、RCRに必要な複製タンパク質を遺伝子として有するoriC環状DNA(自己複製ゲノム)を鋳型に、PURE systemを用いて複製タンパク質を産生し、さらに、産生した複製タンパク質を用いて鋳型となった自己複製ゲノムの増幅を導くことで達成される。これまでに、RCRに含まれる複製タンパク質の1つ(複製開始タンパク質DnaA)について、この共役に成功していた。しかし、鋳型ゲノムDNA分子が多数含まれるバルクの反応系では、産生されたDnaA分子が自身の鋳型ゲノムDNA分子以外を複製する可能性があるため、真に自己複製が達成されているとは言い難かった。そこで、油中水滴エマルジョンを用いて反応系を区画化し、1分子の鋳型ゲノムDNA毎に共役反応を行うことを検討した。この時、1分子の鋳型ゲノムDNA上で複製と転写が同時に起こるため、複製装置と転写装置の衝突を解消することが課題であった。既にバルクの共役系において、大腸菌で働く複製と転写の衝突回避機構が鋳型ゲノムDNAの増幅を促進することが明らかになっており、この機構をエマルジョンを用いた共役系にも導入したところ鋳型ゲノムDNAの増幅促進が見られた。この結果は、生命システムの根幹となるゲノムの自己複製を達成するためには複製と転写の協調的な進行が重要になることを示しており、細胞が実際に行う1分子のゲノムDNAを基にした複製・転写・翻訳、すなわちセントラルドグマを試験管内で再現することに繋がる。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] In vitro amplification of whole large plasmids via transposon-mediated oriC insertion2021

    • Author(s)
      Nara Seia、Su'etsugu Masayuki
    • Journal Title

      BioTechniques

      Volume: 71 Pages: 528~533

    • DOI

      10.2144/btn-2021-0068

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Amplification of over 100 kbp DNA from Single Template Molecules in Femtoliter Droplets2021

    • Author(s)
      Ueno Hiroshi、Sawada Hiroki、Soga Naoki、Sano Mio、Nara Seia、Tabata Kazuhito V.、Su’etsugu Masayuki、Noji Hiroyuki
    • Journal Title

      ACS Synthetic Biology

      Volume: 10 Pages: 2179~2186

    • DOI

      10.1021/acssynbio.0c00584

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌染色体複製と転写翻訳の協調的進行2022

    • Author(s)
      奈良聖亜、末次正幸
    • Organizer
      第16回日本ゲノム微生物学会年会
  • [Presentation] Replication-Cycle Reaction法による環境試料からのプラスミドの収集と性状解析2022

    • Author(s)
      一瀬拓海、池田奈菜子、森光矢、奈良聖亜、末次正幸、金原和秀、新谷政己
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
  • [Presentation] 大腸菌染色体複製再構成系と転写・翻訳系との協調2021

    • Author(s)
      奈良聖亜、末次正幸
    • Organizer
      第17回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] Replication-Cycle Reaction法による環境試料中からの環状DNAの収集・解析2021

    • Author(s)
      一瀬拓海、池田奈菜子、森光矢、奈良聖亜、末次正幸、金原和秀、 新谷政己
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2021年度大会
  • [Presentation] Replication-Cycle Reaction法による環境試料からの環状DNAの収集・解析2021

    • Author(s)
      一瀬拓海、池田奈菜子、森光矢、奈良聖亜、末次正幸、金原和秀、新谷政己
    • Organizer
      日本微生物生態学会第34回大会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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