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2020 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝的同化理論を考慮した洞窟性魚類の適応進化機構の解明

Research Project

Project/Area Number 19J22686
Research InstitutionUniversity of the Ryukyus

Principal Investigator

小林 大純  琉球大学, 理工学研究科海洋環境学専攻, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2022-03-31
Keywords洞窟 / 適応 / ノコギリハゼ科 / カワアナゴ科 / ハゼ目 / 両側回遊
Outline of Annual Research Achievements

本年度は社会情勢の影響下で変更した計画のもと,昨年度までに収集した標本に基づき,カワアナゴ属とジャノメハゼ属の洞窟性種それぞれの回遊パタンの推定と対象分類群の遺伝解析,分岐年代推定をそれぞれ実施した.回遊については,耳石微量元素分析に基づき,カワアナゴ属とジャノメハゼ属の洞窟性種の元素変動パターンを分析し,広域分散性の種と狭域で固有の種間で異なる回遊パタンが検出された.また,それぞれと同所的に生息する洞窟性種にも同様のパタンが確認され,洞窟の様式ごとに通し回遊性種からの進化メカニズムが推定された.系統解析については,本年度は洞窟性ジャノメハゼ属を含むノコギリハゼ科魚類を中心に実施し,昨年度の分類学的な検討結果と合わせて,ジャノメハゼ属の再定義とそれに伴う洞窟性種の系統学的位置づけの確定,分岐年代の推定を行った.この系統解析の過程でジャノメハゼ属内や近縁属に複数の隠蔽系統が含まれることが明らかになった.全ゲノムについては,先進ゲノム支援の補助も受けながら,テンジクカワアナゴの新規ゲノム配列決定と近縁種のリシーケンスを実施し,テンジクカワアナゴの高精度なリファレンスゲノムを取得した.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

本年度インドネシアでの実施を予定していた共通環境実験用の各洞窟性種の仔魚の採集が感染症による社会情勢の変化によって不可能になったため,当該項目は開始することができなかった.

Strategy for Future Research Activity

次年度は系統解析のために,各対象種のゲノムをリシーケンスし,本年度決定されたテンジクカワアナゴのリファレンスゲノムにマッピングして解析を進める予定である.本年度仔魚の採集ができず実施できなかった,表現型可塑性の飼育実験による比較については,社会情勢の変化を注視しながら,異なる光環境の野生集団を用いて実験を行うなどの代用案を考慮に入れて柔軟に対応する.また,本年度明らかになった洞窟性種の周辺の分類群の隠蔽種についても形態データの追加の取得を試みる予定である.

  • Research Products

    (9 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results)

  • [Int'l Joint Research] サムラトゥランギ大学(インドネシア)

    • Country Name
      INDONESIA
    • Counterpart Institution
      サムラトゥランギ大学
  • [Journal Article] First record of Stiphodon annieae Keith & Hadiaty, 2014 (Teleostei, Oxudercidae) from Sulawesi Island, Indonesia2021

    • Author(s)
      Gani Abdul、Nurjirana Nurjirana、Bakri Achmad、Adriany Devita、Wuniarto Erwin、Khartiono Lady、Satria Dawam Heksa、Hasan Veryl、Herjayanto Muh.、Burhanuddin Andi Iqbal、Moore Abigail Mary、Kobayashi Hirozumi
    • Journal Title

      Check List

      Volume: 17 Pages: 261~267

    • DOI

      10.15560/17.1.261

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A New “Beakless” Halfbeak of the Genus Nomorhamphus from Sulawesi (Teleostei: Zenarchopteridae)2020

    • Author(s)
      Kobayashi Hirozumi、Masengi Kawilarang W. A.、Yamahira Kazunori
    • Journal Title

      Copeia

      Volume: 108 Pages: 522~531

    • DOI

      10.1643/CI-19-313

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A record of Tetraroge nigra (Tetrarogidae) from Iriomote Island, southern Japan, with notes on its ecological aspects2020

    • Author(s)
      Sato Mao、Kobayashi Hirozumi、Iida Midori、Shirai Kotaro、Sasaki Kunio
    • Journal Title

      Ichthyological Research

      Volume: 68 Pages: 207~213

    • DOI

      10.1007/s10228-020-00763-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Latitudinal variation in sexual dimorphism in a freshwater fish group2020

    • Author(s)
      Sumarto Bayu K A、Kobayashi Hirozumi、Kakioka Ryo、Tanaka Rieko、Maeda Ken、Tran Hau D、Koizumi Noriyuki、Morioka Shinsuke、Bounsong Vongvichith、Watanabe Katsutoshi、Musikasinthorn Prachya、Tun Sein、Yun L K C、Anoop V K、Raghavan Rajeev、Masengi Kawilarang W A、Fujimoto Shingo、Yamahira Kazunori
    • Journal Title

      Biological Journal of the Linnean Society

      Volume: 131 Pages: 898~908

    • DOI

      10.1093/biolinnean/blaa166

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Morphologies and population genetic structures of the eight-barbel loach of the genus Lefua on southern Sakhalin2020

    • Author(s)
      Machida Yoshiyasu、Kanaiwa Minoru、Shedko Sergey V.、Matsubara Hajime、Kobayashi Hirozumi、Mandagi Ixchel F.、Ooyagi Akira、Yamahira Kazunori
    • Journal Title

      Ichthyological Research

      Volume: 68 Pages: 239~248

    • DOI

      10.1007/s10228-020-00783-1

  • [Presentation] 同一島嶼における洞窟性魚類の異なる進化履歴2021

    • Author(s)
      小林 大純,K.W.A. Masengi, 山平 寿智
    • Organizer
      日本生態学会第68回全国大会
  • [Presentation] Latitudinal Variation in Sexual Dimorphisms in a Freshwater Fish Group2021

    • Author(s)
      Sumarto B.A.K., S. Fujimoto, H. Kobayashi, K. Yamahira
    • Organizer
      日本生態学会第68回全国大会
  • [Presentation] スラウェシ島におけるヒナハゼ属魚類 “Redigobius penango” の非回遊性と系統分類 / インド太平洋における洞窟性カワアナゴ属魚類の種分化機構と適用すべき学名2021

    • Author(s)
      小林 大純
    • Organizer
      魚類分類研究会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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