• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Annual Research Report

小胞体ーゴルジ体を経由しないガレクチン新規分泌経路の解明

Research Project

Project/Area Number 19J40312
Research InstitutionKochi University

Principal Investigator

山口 亜利沙  高知大学, 教育研究部医療学系, 特別研究員(RPD)

Project Period (FY) 2019-10-01 – 2023-03-31
Keywordsガレクチン / 非古典的分泌経路
Outline of Annual Research Achievements

これまでに、ガレクチンーEMARS反応触媒酵素キメラタンパク質を発現するベクターを作製している。本ベクターをHeLa細胞に導入し、安定発現株も作製している(HeLa WT)。
上記の細胞株を用いてEMARS反応を行い、質量分析を行うため、その精製法を検討した。その結果、次の方法を最適とした。EMARS反応後、DE-52カラムにて過剰なFITCを除去する。続いて、Anti-FITCセファロースビーズにてFITC標識されたタンパク質を精製し、過剰FITCにてビーズより標識タンパクを競合溶出させる。その後、クロロホルム/メタノール(1:2)にて、標識タンパク質を沈殿させ、SDC/SLS溶液に溶解させる。本精製法を用いて、HeLa WT(Dox-)および(Dox+)のEMARSサンプル(Dox-:Dox+=1:1)をSILAC法による質量分析に供した。具体的には、SDC/SLSに溶解させたサンプルを還元アルキル化、トリプシンにて消化し、酢酸エチルにて界面活性剤を除去した。その後、脱塩を行い、ペプチドをLC-MS/MS質量分析を用いて解析した。
その結果、Light<Heavyとなる138個のタンパク質が同定された。この中にはGalectin 3およびmCherry-APEX-ガレクチン3-HiBiTキメラタンパク質も同定された。Log2 (ratio H/L)>1のタンパク質として、A-kinase anchor protein 11, Complement decay-accelerating factor, Myosin-9, 10, 11, 14, Tropomodulin-3, Secreted Ly-6/uPAR domain-containing protein, Mucin-like protein 1などが同定された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

SILAC法を用いた質量分析を実施した際に、コントロール区に多くのタンパク質が同定された。質量分析では珍しくないことだが、より正確に分泌に関わるタンパク質を同定するため、サンプルの精製法を再検討した。このため、やや遅れが生じた。

Strategy for Future Research Activity

今後は、同様のSILAC法による質量分析を数回行い、同定された候補分子について、CRISPR/Casテクノロジーを用いてノックアウトし、ガレクチン3の分泌が阻害あるいは抑制されるか否かを解析することで、ガレクチン3の分泌に関わる分子を明らかにする予定である。

  • Research Products

    (1 results)

All 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results)

  • [Journal Article] The Enzyme-Mediated Activation of Radical Sources (EMARS) Reaction: A New Tool for Identification of Membrane Microdomain-Associated GPI-Anchored Glycoprotein Partners2021

    • Author(s)
      Kotani Norihiro、Miyagawa-Yamaguchi Arisa、Honke Koichi
    • Journal Title

      Comprehensive Glycoscience: Second Edition

      Volume: 5 Pages: 364~371

    • DOI

      10.1016/B978-0-12-819475-1.00028-6

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi