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2021 Fiscal Year Annual Research Report

人工的な複合微生物反応場の構築と難培養性微生物の取得

Research Project

Project/Area Number 19K05170
Research InstitutionOsaka City University

Principal Investigator

尾島 由紘  大阪市立大学, 大学院工学研究科, 准教授 (20546957)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywordsフロック / 大腸菌 / アンプリコンシーケンス解析 / 活性汚泥 / 難培養性微生物 / OD1
Outline of Annual Research Achievements

前年度までに大腸菌フロックの人工的な複合微生物化に関しては、モデル微生物の生菌数の定量評価方法の構築と、蘇生因子を放出するヘルパー微生物の定着化に成功した。また、プロテアーゼで分解されやすい問題点がある大腸菌フロックに関して、当研究グループが土壌より単離したポリグルタミン酸生産菌であるBacillus licheniformis RK14株と共培養することで、フロックの分解が抑制され、構造安定性が増加することを確認していた。そこで今年度は、複合微生物化で機能や構造安定性が向上した大腸菌フロックを足場として、難培養性微生物との共培養を行い、共生による取得を試みた.具体的には、前培養で大腸菌とヘルパー微生物であるMicrococcus luteusやRK14株の共培養により形成したフロックを回収し、民間工場排水処理施設の曝気槽に含まれる細菌群との共培養を行った。この曝気槽の活性汚泥中には、未培養系統群OD1が存在することが事前のアンプリコンシーケンス解析により明らかになっている。OD1は、ろ過膜を透過する細胞サイズを持ち、ゲノムサイズは大腸菌の10分の1程度で、遺伝子は400ほどしか持たないため、アミノ酸、ヌクレオチド、脂肪酸などの生合成が欠けているものが多く、他の生物に寄生もしくは細胞外共生体として生活していると推測されている。そこで、各種フロックとの1週間の共培養を行った後に、アンプリコンシーケンス解析により存在比率を確認したところ、どの条件においてもOD1の存在比率が極端に減少しており、共生関係を確認することはできなかった。一方で、OD1が含まれる元の活性汚泥から別途単離した酵母様真菌と共培養した際には、OD1の存在が確認できたため、今後はこの酵母様真菌も含めた複合微生物化を行うことで、OD1を安定的に共培養できるかの確認を行う。

  • Research Products

    (6 results)

All 2021

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Aberrant membrane structures in hypervesiculating Escherichia coli strain ΔmlaEΔnlpI visualized by electron microscopy2021

    • Author(s)
      Y. Ojima, T. Sawabe, M. Nakagawa, YO. Tahara, M. Miyata, and M. Azuma
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 12 Pages: 706525

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.706525

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 外膜小胞に着目した大腸菌のタンパク質分泌生産の試み2021

    • Author(s)
      尾島 由紘、 東 雅之
    • Journal Title

      化学工業

      Volume: 72(5) Pages: 319-324

  • [Journal Article] 大腸菌の外膜小胞高生産株の作製とタンパク質分泌生産等への利用2021

    • Author(s)
      尾島 由紘,東 雅之
    • Journal Title

      酵素工学ニュース

      Volume: 86 Pages: 32-35

  • [Presentation] Aberrant membrane structures in hypervesiculating Escherichia coli strain ΔmlaEΔnlpI visualized by quick-freeze deep-etch electron microscopy2021

    • Author(s)
      Yoshihiro Ojima, Tomomi Sawabe, Mao Nakagawa, Yuhei O. Tahara, Makoto Miyata, Masayuki Azuma
    • Organizer
      EMBO Biologists Workshop Bacterial membrane vesicles
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 電子顕微鏡により可視化された大腸菌の外膜小胞高生産株ΔmlaEΔnlpIの異常な膜構造2021

    • Author(s)
      尾島由紘,澤邊朋美,中川真緒,田原悠平,宮田真人,東雅之
    • Organizer
      第73回日本生物工学会大会
  • [Presentation] 土壌より単離したBacillus licheniformis RK14株の自発的な凝集体形成2021

    • Author(s)
      俣野沙月,尾島由紘,東雅之
    • Organizer
      第73回日本生物工学会大会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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