2021 Fiscal Year Annual Research Report
Construction of strategy for rational design of optimized RNA conformational switch
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19K05723
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| Research Institution | Konan University |
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Principal Investigator |
遠藤 玉樹 甲南大学, 先端生命工学研究所, 准教授 (90550236)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | RNA / 構造変化 / バイオセンサー / セレクション / 合理設計 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、細胞内で効率良く機能するRNA構造スイッチを合理的に設計する技術基盤を確立する。
2021年度は、色調の異なる蛍光性小分子に対するlight-upアプタマー（小分子に結合することでその蛍光を増強するRNA）を基に、細胞内で標的となる分子の多色検出を可能にするRNA構造スイッチの構築を進めた。2020年度までに、異なる蛍光性小分子に対するlight-upアプタマーを複数種類取得することに成功した。そこで、細胞内でのRNA検出を試みた結果、本研究で得られた青、緑の蛍光を増強するlight-upアプタマー、および既存の赤色蛍光を増強するlight-upアプタマーを併用することで、細胞内で3種類のRNAを同時にイメージングすることに成功した（学会発表済み）。さらに、これまでに得られている配列設計指針を基に、S-アデノシルメチオニン（SAM）、およびテオフィリンを検出するためのRNA構造スイッチを合理的に設計した。その結果、生細胞内におけるSAMおよびテオフィリンの多色同時検出に成功した（投稿論文準備中）。
2021年度はさらに、本研究課題で構築したRNAのセレクション技術を用いて、植物の代謝産物であるベルベリンに相互作用するRNAを取得した。RNAとベルベリンの複合体構造の解析も行い、ベルベリンがバルジを有するRNA二次構造に選択的に相互作用することを明らかにした（Nucleic Acids Res., 49, 8449 (2021)）。細胞内に存在する代謝産物に相互作用するRNAを取得し、合理設計によりRNA構造スイッチに組み込むことで、様々な標的代謝産物の検出を可能にするRNA構造スイッチを構築していくことができると期待される。
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Research Products
(10 results)
