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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of RNA exosome-mediated regulation in plant immune system based on an Arabidopsis autoimmune mutant

Research Project

Project/Area Number 19K06054
Research InstitutionKagawa University

Principal Investigator

市村 和也  香川大学, 農学部, 教授 (70321726)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywords植物免疫 / 自己免疫表現型 / DEAD-boxヘリカーゼ / 核RNAエキソソーム / 転写後調節
Outline of Annual Research Achievements

植物免疫に関与するMAPキナーゼ経路MEKK1-MKK1,2-MPK4におけるいずれかの段階の欠損は矮性を含む自己免疫表現型を示す。我々は本表現型に対するサプレッサー変異体の原因遺伝子として、SMN1/RPS6を同定した。本遺伝子は、植物病原菌Pseudomonas syringaeのエフェクターhopA1を認識しETIを誘導する。また、次に同定したSMN2はDEAD-box RNAヘリカーゼをコードし、核内RNA品質管理機構で重要な核RNAエキソソームのRNA分解特異性決定因子だった。SMN1とSMN2は機能的に関連すると思われたことから、これらの遺伝学的相互作用を中心に植物免疫におけるSMN2の機能を解明すべく研究を行ってきた。smn2変異体において、SMN1の3’領域において野生型では見られない異常なRNAの蓄積が検出された。他グループの研究により、上記のゲノム領域にはTIRドメインをコードする新奇遺伝子が存在する事が明らかとなった。これを受けて、新奇TIRタンパク質とSMN1/RPS6のTIRドメインを用いて結合を解析したが、結合は検出されなかった。このことから、タンパク間相互作用によらず、smn2変異体で生成する異常なRNA蓄積がSMN1の機能低下に関連する可能性が示唆された。
本助成金による研究は2020年度でほぼ目的を達成したことからmpk4変異体の解析を行うこととした。mpk4変異体の自己免疫表現型はsmn1とsumm2変異がそれぞれ抑制する。summ2変異によるmpk4の表現型抑制は相対的に弱いことから、SMN1遺伝子の影響が顕著であると考えた。mpk4 smn1 summ2 三重変異体を作製したところ、mpk4変異体の自己免疫表現型は完全に抑制された。よってMPK4の欠損によるSMN1とSUMM2、2つのNLRが活性化することが示された。

  • Research Products

    (6 results)

All 2022 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Simultaneous mutations in SMN1 and SUMM2 fully suppress the dwarf and autoimmune phenotypes of Arabidopsis mpk4 mutant2022

    • Author(s)
      Takagi Momoko、Nagai Suzuna、Kaminaka Hironori、Akimitsu Kazuya、Shirasu Ken、Ichimura Kazuya
    • Journal Title

      Plant Signaling & Behavior

      Volume: 17 Pages: e2046412

    • DOI

      10.1080/15592324.2022.2046412

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] PUB25 and PUB26 positively regulate MAMP-responsive MEKK1 - MKK1/MKK2 - MPK4 pathway and disease resistance in Arabidopsis2022

    • Author(s)
      Nagai, Suzuna., Kubo, Yuta., Hio, Junpei., Kobayashi, Takahiro., Mizoguchi, Tsuyoshi., Takahashi, Fuminori., Shinozaki, Kazuo., Shirasu, Ken., Ichimura, Kazuya.
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] トマト斑葉細菌病原菌に対する病害抵抗性を正に制御するシロイヌナズナMKK3の上流因子MTK1の機能解析2022

    • Author(s)
      新谷光雄, 横田航平, 永田雅也, 松村美里, 中村雅子, 瀧澤 香, 松岡大介, 秋光和也, 白須 賢, 市村和也.
    • Organizer
      令和4年度日本植物病理学会大会
  • [Presentation] シロイヌナズナPUB25及びPUB26はMEKK1に直接結合し、MEKK1以降の経路と病害抵抗性を正に制御する2022

    • Author(s)
      永井鈴奈,小林孝博,久保佑太,樋尾隼平,溝口剛,高橋史憲,篠崎一雄,白須賢,市村和也.
    • Organizer
      令和4年度日本植物病理学会大会
  • [Presentation] シロイヌナズナsmn2/hen2変異体におけるNLR遺伝子SMN1/RPS6の3′末端領域で生じる転写物と機能低下の関連について2022

    • Author(s)
      川人恵理香、永井鈴奈、高木桃子、秋光和也、白須賢、市村和也
    • Organizer
      生物系三学会(動物学会・植物学会・生態学会)合同中四国支部大会
  • [Remarks] 香川大学農学部市村研究室ブログ

    • URL

      https://www.ag.kagawa-u.ac.jp/kichimura/pg291.html#20220330

URL: 

Published: 2022-12-28  

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