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2021 Fiscal Year Annual Research Report

PDIファミリーメンバーP5による小胞体内蛋白質品質管理の解明

Research Project

Project/Area Number 19K06520
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

奥村 正樹  東北大学, 学際科学フロンティア研究所, 助教 (50635810)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywords酸化的フォールディング / PDI family / P5 / シャペロン / SAXS / NMR
Outline of Annual Research Achievements

哺乳動物細胞の小胞体において、酸化的フォールディングの触媒や小胞体ストレス応答因子であるIRE1の機能制御能に関わるP5はこれまで構造未知なためその作動原理は不明であった。今回X線小角散乱とSECによる構造解析より、そのN末端に存在するチオレドキシン様ドメインa0が二量体化に関わることを明らかにした。これまで解かれていた結晶構造を基に、新たにa0ドメインに二量体化に重要なLeu-Val adhesive motifを見出した。以上の結果は、2021年Structure誌に研究成果として発表した。そのため、当初の計画はすでに終えたが、2021年度はさらにP5のカルシウム結合サイトの検索を行った。P5は過去にCa2+ binding protein 1としても報告されていたが、そのカルシウム結合サイトは不明であった。1次配列上Glu richな配列がC-terminalに保存されていることを明らかにし、2021年Structure誌として発表したが、さらに残基レベルでのカルシウム結合部位をNMRにより解析している。この結果、2か所のカルシウム結合サイトの特定に至っており、現在論文投稿準備中である。さらに、P5はPDIと複合体を組むことで、酸化的フォールディングを促し、P5はERp72と複合体を組むことでシャペロン機能を亢進することも見出し、2021年Biologyに発表した。以上、本課題では、P5の新規構造の基づいた生理学的意義の探求において、一定の解釈を与えたのみならず、新たにP5がPDI/ERp72と複合体を組むことで、機能亢進することを見出し、当初の課題計画以上の進展と論文発表に繋がった。

  • Research Products

    (12 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results)

  • [Int'l Joint Research] 韓国基礎科学研究所(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      韓国基礎科学研究所
  • [Journal Article] A unique leucine-valine adhesive motif supports structure and function of protein disulfide isomerase P5 via dimerization.2021

    • Author(s)
      *Okumura M, Kanemura S, Matsusaki M, Kinoshita M, Saio T, Ito D, Hirayama C, Kumeta H, Watabe M, Amagai Y, Lee YH, Akiyama S, and *Inaba K.
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 29 Pages: 1-14

    • DOI

      10.1016/j.str.2021.03.016

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Functional Interplay between P5 and PDI/ERp72 to Drive Protein Folding.2021

    • Author(s)
      Matsusaki M, Okada R, Tanikawa Y, Kanemura S, Ito D, Lin Y, Watabe M, Yamaguchi H, Saio T, Lee YH, Inaba K, and *Okumura M.
    • Journal Title

      Biology

      Volume: 10 Pages: 1112

    • DOI

      10.3390/biology10111112

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Ca2+ Regulates ERp57-Calnexin Complex Formation.2021

    • Author(s)
      Tanikawa Y,# Kanemura S,# Ito D, Lin Y, Matsusaki M, Kuroki K, Yamaguchi H, Maenaka K, Lee YH, Inaba K, and *Okumura M.
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 26 Pages: 2853

    • DOI

      10.3390/molecules26102853

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Visualization of structural dynamics of protein disulfide isomerase enzymes in catalysis of oxidative folding and reductive unfolding.2021

    • Author(s)
      Okumura M, Noi K, and *Inaba K.
    • Journal Title

      Curr Opin Struct Biol.

      Volume: 66 Pages: 49-57

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2020.10.004

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Conjugate of Thiol and Guanidyl Units with Oligoethylene Glycol Linkage for Manipulation of Oxidative Protein Folding.2021

    • Author(s)
      Okada S, Matsusaki M, *Okumura M, and *Muraoka T.
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 26 Pages: 879

    • DOI

      10.3390/molecules26040879

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Distinct roles and actions of protein disulfide isomerase family enzymes in catalysis of nascent-chain disulfide bond formation.2021

    • Author(s)
      Hirayama C, Machida K, Noi K, Murakawa T, Okumura M, Ogura T, Imataka H, and *Inaba K.
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 24 Pages: 102296

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.102296

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Understanding the proteostasis network in the endoplasmic reticulum2022

    • Author(s)
      Masaki Okumura
    • Organizer
      Korea-Japan Joint Workshop on Biofunctional Chemistry
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] PDI familyの動的な会合による小胞体内タンパク質品質管理の理解2021

    • Author(s)
      奥村正樹
    • Organizer
      分子生物学会 WS
    • Invited
  • [Presentation] 小胞体内で液滴を形成する因子の生理学的機能の理解2021

    • Author(s)
      奥村正樹
    • Organizer
      第5回LLPS研究会
    • Invited
  • [Presentation] 小胞体内酸化的フォールディングの触媒システムの理解2021

    • Author(s)
      奥村正樹
    • Organizer
      第21回 日本蛋白質科学会 年会
    • Invited
  • [Presentation] プロテインジスルフィドイソメラーゼ群による基質触媒機構の解明2021

    • Author(s)
      奥村正樹
    • Organizer
      天野財団第22回酵素応用シンポジウム研究奨励賞受賞講演
    • Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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