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2022 Fiscal Year Annual Research Report

細菌Ⅲ型分泌装置構成因子が受ける新奇な翻訳後多段階プロセシングの分子機構

Research Project

Project/Area Number 19K06562
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

檜作 洋平  京都大学, 医生物学研究所, 助教 (70568930)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Keywords大腸菌 / べん毛 / Rhomboid / 膜内タンパク質分解 / 膜内切断プロテアーゼ / 基質認識機構 / 構造解析 / S2P
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、申請者が見出した細菌べん毛III型分泌装置構成因子FliOの翻訳後多段階プロセシングについて、切断と修飾の二点の解析を通して膜タンパク質の新たな翻訳後機能調節機構にアプローチするものである。最終年度となる本年度は、大腸菌膜内切断プロテアーゼGlpGの新奇生理的切断基質としてのFliOの基質認識・切断機構の解析を以下のように行った。in vivoでの機能解析やFliOの動態解析、架橋法を用いたGlpG―FliO相互作用解析を進め、さらに昨年度に論文として発表した高親和性・高感度のPAタグを用いて大腸菌染色体からPAタグを付加したFliOを発現する改変株を構築し、染色体レベルのFliOの切断・修飾動態を明らかにした。本研究期間中に得られた成果と合わせて論文投稿準備中である。また、本年度は申請者らが決定した大腸菌膜内切断プロテアーゼの一つであるRsePの新規X線結晶構造に基づいた変異体機能解析や生化学的解析を通して、阻害剤作用機序及び基質結合様式を明らかにし、さらに分子内ゲートの構造変化を介した新規の基質取り込み・切断制御機構を提案した。この成果は学術雑誌Science Advances上で発表した。
本研究期間全体の成果としては、FliOの多段階翻訳後プロセシングの一端であるGlpGによる膜内切断の分子機構の詳細解析を行い、二か所の切断部位での認識機構の共通性と相違点を明らかにし、各部位での残基レベルの相互作用様式を明らかにする等の成果を得た。これは細菌の病原性にも関わるべん毛構築の制御機構の解明につながる重要な成果である。また、技術的な成果としてPAタグを用いたタンパク質の抗体ラベリング技術の改良を行い、論文として発表した。この技術は任意のタンパク質に非破壊的に抗体を結合させることを可能とし、高収量・高純度のタンパク質精製や構造解析にも応用できる可能性がある。

  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Mechanistic insights into intramembrane proteolysis by E. coli site-2 protease homolog RseP2022

    • Author(s)
      Y.Imaizumi, K.Takanuki, T.Miyake, M.Takemoto, K.Hirata, M.Hirose, R.Oi, T.Kobayashi, K.Miyoshi, R.Aruga, T.Yokoyama, S.Katagiri, H.Matsuura, K.Iwasaki, T.Kato, M.K.Kaneko, Y.Kato, M.Tajiri, S.Akashi, O.Nureki, Y.Hizukuri, Y.Akiyama
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 8 Pages: eabp9011

    • DOI

      10.1126/sciadv.abp9011

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 膜内切断プロテアーゼRsePのゲーティング機構モデルの検証と基質特異的認識に関する解析2023

    • Author(s)
      檜作洋平
    • Organizer
      2022年度国立遺伝学研究所研究会「単細胞生物に見られる生体プロセスの恒常性維持システム」
    • Invited
  • [Presentation] 膜内タンパク質切断の制御機構の解明に向けた細菌由来Site-2 proteaseの構造生物学的研究2022

    • Author(s)
      今泉友希、髙貫一徳、大井里香、坂口(田村)梨沙子、三好賢一、有賀理江、廣瀬建、片桐静夏、三宅拓也、檜作洋平、秋山芳展、禾晃和
    • Organizer
      第18回大腸菌研究会
  • [Presentation] 全長結晶構造に基づく細菌膜内切断プロテアーゼRsePの基質取り込み・切断機構の解析2022

    • Author(s)
      三宅拓也、今泉友希、髙貫一徳、小林達也、横山達彦、大井里香、檜作洋平、禾晃和、秋山芳展
    • Organizer
      第18回大腸菌研究会
  • [Presentation] 細菌膜内切断プロテアーゼRsePの基質取り込み・切断時におけるダイナミックな構造変化モデル2022

    • Author(s)
      三宅拓也、今泉友希、高貫一徳、小林達也、横山達彦、大井里香、檜作洋平、禾晃和、秋山芳展
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] 大腸菌膜内切断プロテアーゼRsePのTM4領域に着目した基質エントリーゲートの制御機構の検証2022

    • Author(s)
      小林達也、三宅拓也、今泉友希、高貫一徳、横山達彦、大井里香、檜作洋平、禾晃和、秋山芳展
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] 大腸菌S2Pファミリー膜内切断プロテアーゼRsePの切断基質の系統的解析による基質認識・切断特異性の検証2022

    • Author(s)
      檜作洋平、古味大雄、秋山芳展
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Remarks] 京都大学プレスリリース「細胞膜の中ではたらく特殊なタンパク質分解酵素の構造を解明」

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2022-08-25

  • [Remarks] 京都大学医生物学研究所HP 研究成果「細胞膜の中ではたらく特殊なタンパク質分解酵素の構造を解明」

    • URL

      https://www.infront.kyoto-u.ac.jp/post-2986/

  • [Remarks] 京都大学 医生物学研究所 生命システム研究部門 生体膜システム分野研究室HP

    • URL

      https://infront-biomembrane.jp/

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Published: 2023-12-25  

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