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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Structural analysis of membrane-bound proteins using synchrotron-radiation circular-dichroism and linear-dichroism spectroscopy

Research Project

Project/Area Number 19K06587
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

松尾 光一  広島大学, 放射光科学研究センター, 准教授 (40403620)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywordsマガイニン2ペプチド / リポソーム / 円二色性 / 放射光 / 構造変化 / 二次構造 / 中間体
Outline of Annual Research Achievements

真空紫外円二色性(VUVCD)によるタンパク質の二次構造(含量・本数・配列)解析法を用いて、水溶性タンパク質の膜結合構造の研究を展開している。本年度は、モデル抗菌ペプチドであるマガイニン2(M2)と生体膜の相互作用のメカニズムを、VUVCDスペクトルのglobal fitting解析、直線二色性(LD)、膜の安定性が観測できる蛍光異方性を用いて明らかにし、M2の膜結合構造とその機能との関係性について検討した。
生体膜は、緑膿菌等の細胞膜に存在するDPPG脂質分子から粒径100 nmのリポソームを調製し利用した。VUVCDとLDの測定は、HiSORのビームライン12にて実施し、また蛍光異方性は蛍光分光光度計を用いて測定した。
VUVCD測定の結果、M2は脂質対ペプチド(L/P)比の増加に伴い、中間状態を経由してランダムコイル構造からαヘリックス構造に変化することが分かった。得られたVUVCDデータに対して吸着モデルを用いたglobal fitting解析から、L/P比の減少に伴い、M2は生体膜上でαヘリックスの単量体から、中間状態であるβシート構造の多量体(凝集体)に変化することが分かった。Flow状態でLDを測定した結果、βシートに由来するLDが得られ、生体膜表面に対するβシートの配向構造が決定された。さらに、βシート凝集体の生体膜安定性への影響を蛍光異方性で調べた結果、凝集体はDPPGリポソームの脂質二重層構造を不安定化させることが分かった。以上の結果から、生体膜上でのM2のβシート凝集体形成が、抗菌作用に重要であることが示唆された。

  • Research Products

    (25 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 1 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] NIOF(エジプト)

    • Country Name
      EGYPT
    • Counterpart Institution
      NIOF
  • [Journal Article] Kinetics of denaturation and renaturation processes of double-stranded helical polysaccharide, xanthan in aqueous sodium chloride2022

    • Author(s)
      Y. Tomofui, K. Matsuo, K. Terao
    • Journal Title

      Carbohydr. Polym.,

      Volume: 275 Pages: 118681(11pages)

    • DOI

      10.1016/j.carbpol.2021.118681

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Formation of β-Strand Oligomers of Antimicrobial Peptide Magainin 2 Contributes to Disruption of Phospholipid Membrane2022

    • Author(s)
      M Kumashiro, R Tsuji, S Suenaga, K Matsuo
    • Journal Title

      Membranes

      Volume: 12 Pages: 131(15pages)

    • DOI

      10.3390/membranes12020131

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Helically aligned fused carbon hollow nanospheres with chiral discrimination ability2022

    • Author(s)
      J Maruyama, S Maruyama, Y Kashiwagi, M Watanabe, T Shinagawa, T Nagaoka, T Tamai, N Ryu, K Matsuo, M Ohwada, K Chida, T Yoshii
    • Journal Title

      Nanoscale

      Volume: 14 Pages: 3748 - 3757

    • DOI

      10.1039/D1NR07971A

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Conformation of myelin basic protein bound to phosphatidylinositol membrane characterized by vacuum-ultraviolet circular-dichroism spectroscopy and molecular dynamics simulations.2021

    • Author(s)
      M. Kumashiro, Y. Izumi, K. Matsuo
    • Journal Title

      Proteins

      Volume: 89 Pages: 1251-1261

    • DOI

      10.1002/prot.26146

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Secondary structure of human De Novo evolved gene product NCYM analyzed by vacuum-ultraviolet circular dichroism2021

    • Author(s)
      T. Matsuo, K. Nakatani, T. Setoguchi, K. Matsuo, T. Tamada, Y. Suenaga
    • Journal Title

      Front. Oncol.

      Volume: 11 Pages: 688852 (10page)

    • DOI

      10.3389/fonc.2021.688852

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of Mono-Saccharides on Structural Stabilization of Apo-Myoglobin Studied by Synchrotron-Radiation Circular-Dichroism Spectroscopy2021

    • Author(s)
      T. Shimizu, A. Uomi, M. Kumashiro, Y. Izumi, K. Matsuo
    • Journal Title

      HiSOR Activity Reports

      Volume: 2020 Pages: 101-102

  • [Journal Article] Study of Membrane-Bound Conformation and Pore Formation of Magainin2 using Vacuum-Ultraviolet Circular-Dichroism Spectroscopy2021

    • Author(s)
      R. Tsuji, M. Kumashiro, K. Matsuo
    • Journal Title

      HiSOR Activity Reports

      Volume: 2020 Pages: 103

  • [Journal Article] Effect of Concentration on the Thermal Denaturation of Collagen2021

    • Author(s)
      Y. Maki, K. Matsuo
    • Journal Title

      HiSOR Activity Reports

      Volume: 2020 Pages: 104-105

  • [Presentation] Orientation Analysis of Antimicrobial Peptide Magainin 2 Bound to Phospholipid Membrane by Synchrotron-Radiation Linear Dichroism Spectroscopy2022

    • Author(s)
      Munehiro Kumashiro, Ryoga Tsuji, Shoma Suenaga, Koichi Matsuo
    • Organizer
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of structural change of XRCC4 by pseudo-phosphorylation using VUV-CD and SAXS2022

    • Author(s)
      Kai Nishikubo Maho Hasegawa, Yudai Izumi, Kentaro Fujii , Koichi Matsuo, Yoshihisa Matsumoto, Akinari Yokoya
    • Organizer
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Membrane-Bound Conformations of Magainin 2 depending on the Inherent Characteristics of Membrane Revealed by Synchrotron-Radiation Circular Dichroism Spectroscopy2022

    • Author(s)
      Ryoga Tsuji, Munehiro Kumashiro, Koichi Matsuo
    • Organizer
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of Time-Resolved Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectroscopy and its Application to the Interaction Analysis betweenβ-Lactoglobulin and Lipid Membrane2022

    • Author(s)
      Satoshi Hashimoto, Koichi Matsuo
    • Organizer
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Observation of Liquid-Liquid Phase Separation of FUS-LC using VUV-CD Spectroscopy2022

    • Author(s)
      Kentaro Fujii, Nobuo Maita, Koichi Matsuo, Masato Kato
    • Organizer
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 放射光円二色性・直線二色性・蛍光異方性によるマガイニン2の膜 誘起β凝集体形成の解析2022

    • Author(s)
      熊代 宗弘、末永 翔磨、松尾 光一
    • Organizer
      第35回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
  • [Presentation] VUV-CDによるFUS-LCの相分離転移に伴う二次構造変化の観測2022

    • Author(s)
      藤井 健太郎、真板 宣夫、加藤 昌人、松尾 光一
    • Organizer
      第35回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
  • [Presentation] Desiccation-Induced Conformational Change of Group 3 LEA Protein in the presence of Membrane Characterized by Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectroscopy2022

    • Author(s)
      Shun Sawada, Munehiro Kumashiro, Ryota Imaura, Koichi Matsuo
    • Organizer
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 脂質分子の特性に依存するマガイニン 2 の膜結合構造2021

    • Author(s)
      辻 怜河, 熊代 宗弘, 松尾 光一
    • Organizer
      第59回 日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 放射光円二色性・直線二色性・蛍光異方性により明確化された生体膜に誘起された マガイニン 2β 凝集体の特徴2021

    • Author(s)
      熊代 宗弘, 末永 翔磨, 松尾 光一
    • Organizer
      第59回 日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 真空紫外円二色性と直線二色性によるαシヌクレインの生体膜相互作用研究2021

    • Author(s)
      今浦 稜太、熊代 宗弘、河田 康志、 松尾 光一
    • Organizer
      第22回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] 放射光円二色性・直線二色性・蛍光異方性による抗菌ペプチドマガイニン2の膜結合 により誘起された β-sheet 凝集体の研究2021

    • Author(s)
      熊代宗弘,末永翔 磨,松尾光一
    • Organizer
      Molecular Chirality 2021
  • [Presentation] 放射光円二色性分光法と 生体分子の構造研究2021

    • Author(s)
      松尾光一
    • Organizer
      サントリー生命科学財団  オンラインセミナー
    • Invited
  • [Book] 疾患の原因遺伝子・タンパク質の解析技術と創薬/診断技術への応用 (第2章第3節 真空紫外円二色性法による疾患原因タンパク質の構造解析)2022

    • Author(s)
      松尾 光一,熊代 宗弘
    • Total Pages
      564(内 p136~p145)
    • Publisher
      (株)技術情報協会
    • ISBN
      978-4-86104-877-7
  • [Book] 紫外可視・蛍光分光法(第4章 円偏光分光法 4.1旋光分散計と円二色性、4.4円二色性分光法の実際)2021

    • Author(s)
      築山光一/星野翔麻・編著
    • Total Pages
      320(内 p183~p202, p227-p238)
    • Publisher
      株式会社講談社サイエンティフィク
    • ISBN
      978-4-06-523805-9
  • [Remarks] 神経ネットワークの形成に必要な「糊」タンパク質の構造の初観測

    • URL

      http://www.hsrc.hiroshima-u.ac.jp/research/result/57.html

URL: 

Published: 2022-12-28  

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