2022 Fiscal Year Annual Research Report
A study of diversity of minute brown algae using culture and molecular analyses
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19K06817
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
小亀 一弘 北海道大学, 理学研究院, 教授 (80215219)
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2019-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 褐藻 / 微小褐藻 / DNAバーコーディング / COI / cox1 / 分子系統 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
褐藻類には，数cm以下の微小な種が多く存在するが，形態が単純なために同定が難しく，その多様性についての理解は未だ不十分である。本研究は，微小褐藻について，多くの培養株を確立し，DNAバーコーディングにより，その多様性を解明することが目的である。
令和3年度までに，日本各地の海岸18地点で採取された砂や岩，大型藻，海草の断片を培養し，培養中に出現してきた微小な褐藻類を単離し，358株の培養株を確立していた。そのうち231株について，チトクローム酸化酵素サブユニットI遺伝子（COI）の部分配列を決定していた。令和4年度においても培養株の単離とCOI配列の決定を進め，これまで，18地点から368株を得て，245株について配列情報を得た。それらの配列とDNA Data Bankからダウンロードした149のレファレンス配列をアラインメントし，Neighbour-Joining法を用いて系統樹を作成した。得られた配列は，4株を除いて，全て，Ectocarpalesに位置した。また，ASAPによる種境界解析で得られた1.8％の塩基配列の違いで種境界を設定すると，この245株は62種に分かれた。そのうち，レファレンス配列から種を同定できたものは24種，属まで同定できた種は5種，レファレンス配列との比較において，属・種名いずれも不明な種は36種であった。異形世代交代を行う種の微小世代であったものは12種であった。レファレンス配列から種を同定できたもののうち，5種が日本新産と考えられた。それらは，Microspongium stilophorae (P. Crouan & H. Crouan) Cormaci & G. Furnari，Ectocarpus fascicularis Harvey，Ectocarpus subulatus Kuetzing，Ectocarpus crouaniorum Thuret，Hincksia onslowensis (Amsler & Kapraun) P.C. Silvaであった。本研究で得られたCOI部分塩基配列をDDBJに登録した。
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