2019 Fiscal Year Research-status Report
複合的アプローチを用いた多発性嚢胞腎の新規病態メカニズム解明
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19K07318
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| Research Institution | Mie University |
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Principal Investigator |
西村 有平 三重大学, 医学系研究科, 教授 (30303720)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
白水 崇 三重大学, 医学系研究科, 助教 (00582678)
稲垣 昌樹 三重大学, 医学系研究科, 教授 (30183007)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 嚢胞腎 / 線毛病 / データサイエンス / ゼブラフィッシュ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
多発性嚢胞腎は、両側の腎臓に嚢胞が無数に生じ、最終的には腎不全に至る遺伝性の疾患である。線毛病との関連性が明らかにされているが、その病態メカニズムは不明な点が多く残されている。本研究の目的は、原因の異なる多発性嚢胞腎モデルに共通する発現変動遺伝子をとランスクリプトーム解析により同定し、それらの遺伝子をノックアウトや過剰発現させた培養細胞やゼブラフィッシュの表現型を解析することで、一次線毛と多発性嚢胞腎に関連する新たな遺伝子を同定することである。
2019年度は、公共データベースに登録された3種類の多発性嚢胞腎モデルのトランスクリプトームデータのメタ解析から、これらのモデルに共通して発現が変動する遺伝子を8個見出した。このうち5個の遺伝子はすでに多発性嚢胞腎との関連性が報告されており、本研究で用いたアプローチの妥当性を示唆していると考えられる。多発性嚢胞腎との関連性が報告されていない3遺伝子について、ゼブラフィッシュにおける相同遺伝子のノックアウトや過剰発現による表現型の変化を解析するための準備を行った。2020年度はこれら3種類の遺伝子をノックアウトまたは過剰発現させたゼブラフィッシュを作製し、その表現型を解析することにより、多発性嚢胞腎との関連性について検討する予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
研究計画に沿って、多発性嚢胞腎モデルのトランスクリプトームデータのメタ解析から、多発性嚢胞腎に関連する可能性のある遺伝子を同定できており、本研究はおおむね順調に進捗していると考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
2020年度は、2019年度に見出した三種類の多発性嚢胞腎関連遺伝子候補をノックアウトまたは過剰発現させたゼブラフィッシュを作製し、表現型を解析する。
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| Causes of Carryover |
2019年度のゼブラフィッシュの維持管理費が当初見込みより少なくなったため。
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