2021 Fiscal Year Annual Research Report
Epigenomic regulation during development of testicular germ cell tumor
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19K07444
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| Research Institution | Keio University |
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Principal Investigator |
新井 恵吏 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 准教授 (40446547)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 精巣胚細胞腫瘍 / セミノーマ / DNAメチル化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
精巣胚細胞腫瘍は始原生殖細胞を起源として発生する悪性腫瘍で、希少がんかつAYA (Adolescent and Young Adult)世代のがんである。正常発生・分化の諸段階を模倣する腫瘍内分化を示し、発生進展過程にはエピジェネティクスの寄与が示唆される。
ホルマリン固定パラフィン包埋標本からマイクロダイセクション技術を用いて精巣胚細胞腫瘍組織を組織亜型ごとに切り分け、イルミナ社Infinium BeadChipを用いてゲノム網羅的DNAメチル化解析を行った。主成分分析において、サンプルは組織亜型毎の分布を示した。セミノーマは同一組織亜型にも関わらず、胎児性癌に近いところに分布する症例 (Sem2)とそうでない症例(Sem1)の二群に分かれた。Sem1とSem2は形態学的な差が得られず、これらは分子生物学的に識別されるものと考えた。Sem2はSem1に比して有意にStageが進行しており、術後LDH・hCG・AFP値が有意に高かった。Sem2は悪性度が高く予後不良な胎児性癌に類似したDNAメチル化プロファイルを有することから、Sem1に比して予後不良であると予想される。
Sem1はゲノム網羅的低メチル化状態にあり、Sem2は一部の領域で高メチル化状態を示していた。Sem2はゲノム上の広い領域で高メチル化状態を示す胎児性癌に分化しつつあると考えられた。胎児性癌への分化に寄与しSem1とSem2で有意に異なるDNAメチル化プロファイルは、遺伝子コード領域でなく染色体安定性保持に重要である領域で先行して生じていた。一方で発現変化に帰結し得るDNAメチル化変化を示す遺伝子も同定し得た。これらの遺伝子のDNAメチル化の変化やmRNA・蛋白発現は、Sem1とSem2を識別し、腫瘍の悪性度評価や治療選択に繋がる診断マーカーとして有用であると考えられる。
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[Journal Article] Non-viral Induction of Transgene-free iPSCs from Somatic Fibroblasts of Multiple Mammalian Species2021
Author(s)
Yoshimatsu S, Nakajima M, Iguchi A, Sanosaka T, Sato T, Nakamura M, Nakajima R, Arai E, Ishikawa M, Imaizumi K, Watanabe H, Okahara J, Noce T, Takeda Y, Sasaki E, Behr R, Edamura K, Shiozawa S, Okano H
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Journal Title
Stem Cell Reports
Volume: 16
Pages: 754-770
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Clinicopathological impacts of DNA methylation alterations on pancreatic ductal adenocarcinoma: prediction of early recurrence based on genome-wide DNA methylation profiling2021
Author(s)
Endo Y, Fujimoto M, Ito N, Takahashi Y, Kitago M, Gotoh M, Hiraoka N, Yoshida T, Kitagawa Y, Kanai Y, Arai E
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Journal Title
J Cancer Res Clin Oncol
Volume: 147
Pages: 1341-1354
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Evaluation of clinical formalin-fixed paraffin-embedded tissue quality for targeted-bisulfite sequencing2021
Author(s)
Ohmomo H, Komaki S, Ono K, Sutoh Y, Hachiya T, Arai E, Fujimoto H, Yoshida T, Kanai Y, Sasaki M, Shimizu A
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Journal Title
Pathol Int
Volume: 71
Pages: 135-140
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] DNA hypermethylation of the ZNF132 gene participates in the clinicopathological aggressiveness of 'pan-negative'-type lung adenocarcinomas2021
Author(s)
Hamada K, Tian Y, Fujimoto M, Takahashi Y, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Yoshida T, Asamura H, Kanai Y, Arai E
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Journal Title
Carcinogenesis
Volume: 42
Pages: 169-179
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] 精巣2021
Author(s)
新井恵吏
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Journal Title
病理と臨床第39巻臨時増刊号 治療方針を変える病理所見
Volume: 39
Pages: 249-258
Peer Reviewed
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[Presentation] Quantification of DNA methylation for carcinogenic risk estimation in patients with non-alcoholic steatohepatitis2022
Author(s)
Kuramoto J, Arai E, Fujimoto M, Tian Y, Yamada Y, Yotani T, Makiuchi S, Tsuda N, Ojima H, Fukai M, Seki Y, Kasama K, Funahashi N, Udagawa H, Nammo T, Yasuda K, Taketomi A, Kanto T, Kanai Y
Organizer
American Association of Cancer Research Annual Meeting 2022
Int'l Joint Research
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[Presentation] Correlations between genome-wide DNA methylation profiles and genomic driver aberrations during multistage lung adenocarcinogenesis2021
Author(s)
Hamada K, Tian Y, Fujimoto M, Takahashi Y, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Yoshida T, Asamura H, Kanai Y, Arai E
Organizer
American Association of Cancer Research Annual Meeting 2021
Int'l Joint Research
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